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沙龙
1
回答
理论说明一个函数内的多个返回语句
、
、
特别是,我有一个BOOL函数:{ if (
gnomad
_ex_controls_an == "NA" &&
gnomad
_gen_controls_an === "NA" && floatable(<
浏览 3
提问于2019-07-09
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回答
输出中间的换行符
f1: Location Consequence SYMBOL Feature
gnomAD
_AF
gnomAD
_AFR_AF
gnomAD
_AMR_AF
gnomAD
_ASJ_AF
gnomAD
_EAS_AF
gnomAD
_FIN_AF
gnomAD
_NFE_AF
gnomAD
_OTH_AF
gnomAD
_SAS_AF CLIN_SIG CADD_phredchromosome star
浏览 5
提问于2019-04-02
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2
回答
使用rvest在R中进行Web抓取:查找标记时出现问题
、
网址是:https://
gnomad
.broadinstitute.org/variant/8-52733231-G-A?dataset=
gnomad
_r2_1我对欧洲等位基因频率的价值特别感兴趣(见图): ? 我已经尝试通过在源代码中进行搜索来查找与此号码相关联的CSS标记。结果总是相同的:{xml_nodeset (0)} 我的代码是: url <-'https://
gnomad
.broadinstitute.org/variant/
浏览 13
提问于2021-01-19
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1
回答
gnomAD
数据库
等位基因频率
、
、
我需要帮助了解
gnomAD
等位基因频率。我需要过滤人口中小于1%的变异。我在一些注释文件"
gnomAD
最高频率“栏中看到过,在此基础上,其他科学家筛选出了< 1%的变体。在我的文件中,我只能在我的
gnomAD
表中看到AF。此外,AF列中的数字类似于0.9876,0.087,但不是百分比形式。 我的问题是我是否应该选择AF列来选择<1 %。
浏览 5
提问于2022-01-31
得票数 0
1
回答
读取bash中的文件,在MongoDB中执行查询,并在while循环中的最后一列中添加结果
、
、
、
print $0"\t"val}'在文件中重定向查询结果之后,我得到如下内容:chr1 ... lotsofcolumns ... 0.9854 0.9995
gnomAD
_EASchr1 ... lotsofcolumns...
浏览 0
提问于2019-04-04
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1
回答
在python编辑中打开VCF.bgz文件
、
、
、
我从
gnomad
- 下载了一些数据。它以VCF.bgz文件的形式出现,我想将它作为一个vcf文件读取。ifile = gzip.GzipFile("
gnomad
.genomes.r2.1.1.sites.2.vcf.bgz") ofile = open("truncated.vcf
浏览 7
提问于2022-11-10
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1
回答
索尼随身听MP3播放器没有安装在Xubuntu 11.10中
、
、
我最近升级了从Ubuntu10.04到Ubuntu11.10安装了xubuntu-desktop (我不喜欢统一),并发现当我插入我的索尼随身听NWZ 153 MP3播放器,它没有按预期安装。但是,我不能通过pcmanfm或thunar浏览MP3播放器的文件。我安装了usbmount包,这似乎先发制人地解决了其他USB设备的问题,因为我可以通过/media/usb/地址访问其他USB驱动器。 MP3似乎除了通过Rhythmbox和lsusb之外没有任何地方显示自己,所以如果有人能提供
浏览 0
提问于2012-02-24
得票数 0
1
回答
用字符替换空格的Tab分隔文件格式
ExAC_AC_AN_AMR ExAC_AC_AN_EAS ExAC_AC_AN_FIN ExAC_AC_AN_NFE ExAC_AC_AN_OTH ExAC_AC_AN_SAS ExAC_FILTER
gnomAD
_AF
gnomAD
_AFR_AF
gnomAD
_AMR_AF
gnomAD
_ASJ_AF
gnomAD
_EAS_AF
gnomAD
_FIN_AF
gnomAD
_NFE_AF
gnomAD
_OTH_AF<e
浏览 0
提问于2020-07-13
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1
回答
用httr2包发布请求
、
、
、
library(tidyverse) req_body_form( 'datasetId' = '
gnomad
_r3', 'referenceGenome' = 'GRCh38'
浏览 7
提问于2022-06-09
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1
回答
来自特定列的GREP大写字符,将结果管道到与新列相同的文件。
ExAC_AFR ExAC_ALL ExAC_AMR ExAC_EAS ExAC_FIN ExAC_NFE ExAC_OTH ExAC_SAS
gnomAD
_exome_AFR
gnomAD
_exome_ALL
gnomAD
_exome_AMR
gnomAD
_exome_ASJ
gnomAD
_exome_EAS
gnomAD
_exome_FIN
gnomAD
_exome_NFE
gnomA
浏览 0
提问于2017-04-24
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1
回答
python中的源shell脚本
、
、
、
/bin/bash IN="/sc/arion/projects/Variants/
gnomad
.exomes.r2.1.1
浏览 0
提问于2022-08-01
得票数 0
1
回答
创作禅宗不适用于女妖或节奏盒
、
、
、
女妖和节奏盒都不会看到关于创造性禅宗的文件。右击Zen并选择“属性”将导致女妖和节奏盒退出。这在10.10上非常有效。 在宏碁Aspire台式机、宏碁5552笔记本电脑和松下CF52笔记本电脑上的几个11.10安装上复制了问题。
浏览 0
提问于2011-11-21
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1
回答
来自文件的示例输入
--af-of-alleles-not-in-resource 2.5e-06 \ -pon /home/zyto/unger/GATK_PoN/1000g_pon.hg38.vcf.gz" ...--af-of-alleles-not-in-resource 2.5e-06
浏览 18
提问于2021-03-11
得票数 0
1
回答
为什么点击renderDataTable的过滤框会让我回到屏幕的左边,在R上闪闪发亮?
、
."),
gnomad
_AC = c("NULL", "NULL", "NULL", "NULL", "NULL", "NULL"), pmid = c("10903344", "12809637",002225.5", "NM_001379500.1"), dbsnp = c("rs267607049", "NULL", "NU
浏览 13
提问于2022-10-31
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1
回答
在UBUNTU中安装R软件包
、
、
install.packages("tidyverse")install.packages("dplyr")gunzip("
gnomad
.exomes.r2.1.1.sites.21.vcf.bgz", "
gnomad
.exomes.r2.1.1.sites.21.vcf") vc=read.vcfR("
gnomad
.exomes.r
浏览 0
提问于2022-11-21
得票数 1
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1
回答
为什么我不能在存储库中找到
gnomad
2?
、
我尝试了又尝试过,但我似乎无法在Ubuntu存储库中找到
gnomad
2 ( http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=93810 )。
浏览 0
提问于2011-02-10
得票数 2
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1
回答
如何使用Python脚本从Docker容器中保存输出JSON文件
、
、
、
varskor_annotation /input/out_total_filtered_2.vcf /input/HumanNet_XI_Network_Stats.csv /input/exac_
gnomad
_freq.csv/input/
gnomad
.v2.1.1.lof_metrics.by_transcript.txt 我可以给出输入,但是在任何地方都找不到我的输出JSON。
浏览 1
提问于2022-07-07
得票数 0
1
回答
GNU并行环境变量与输入分离
、
、
normal $name " "-L {{}} --germline-resource {input.
gnomAD
浏览 26
提问于2021-02-19
得票数 0
2
回答
将音乐同步到银河Nexus (MTP)的最佳方式?
、
、
、
Galaxy使用的是MTP,这使得一般使用起来有点痛苦。幸运的是,Ubuntu附带了一些预装的驱动程序,这样我就可以通过nautilus轻松地访问我的手机内存,但是Rhythmbox和Banshee似乎不太喜欢它。当我尝试同步时,节拍盒会崩溃,而在女妖上,我会得到大量的错误。我被Windows上的DoubleTwist之类的东西破坏了,我可以通过无线方式将iTunes库与之同步。显然,iTunes和DoubleTwist都没有在Ubuntu上工作,所以我想找到一些替代方案。最坏的情况下,我可以手动传输我的所有音乐(试图完全摆脱这里的Windows )。 现在,我知道我的音乐库中的很多ID3标签
浏览 0
提问于2012-06-26
得票数 14
1
回答
“`gcloud存储”是否为公共数据的传输向我们收费?
、
、
奖励: 对我来说,上面提到的后一个项目似乎不正确,因为我从来没有故意告诉
浏览 32
提问于2022-10-28
得票数 0
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