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生信学习-Day6-学习R包

让我们分解一下代码各个部分来理解它含义: iris: 这是R语言中自带一个数据集,包含了150个样本,每个样本都是不同鸢尾花,4个花测量特征(萼片长度、萼片宽度、花瓣长度、花瓣宽度)和一个种类标签...这相当于从原始test数据框中筛选所有属于"setosa"或"versicolor"这两个种类鸢尾花样本。...group_by(Species):这一步将数据按照Species列不同进行分组,即将数据集分成多个子集,每个子集包含相同Species数据。...这意味着函数将查找 test1 和 test2 中列名为 "x" 列,基于这两列中匹配来合并行。只有当两个数据框中都存在列 "x" 且某些行在这一列相等时,这些行才会出现在最终结果中。...结果将是一个新数据框,其中包含了test1中那些在test2中找到匹配项行,而包含在test2中找不到匹配项行。这种操作通常用于数据集筛选,以保留与另一个数据集相关数据。

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2-SQL语言中函数

分组前筛选:分组前筛选也就是筛选内容在数据库中就存在, 可以直接利用对应列筛选,利用where语句筛选,位置在group_by字句前面 分组后筛选:分组后筛选是利用已经重新分配信息进行筛选...分组前筛选:分组前筛选也就是筛选内容在数据库中就存在, 可以直接利用对应列筛选,利用where语句筛选,位置在group_by字句前面 2....分组后筛选:分组后筛选是利用已经重新分配信息进行筛选, 这些信息直接存储于数据库中。...`department_id`; # 外连接 /* 用于查询一个表中有,另一个表中没有的记录 特点: 外连接查询结果为主表中所有记录 如果表中有和它匹配,则显示匹配 如果没有匹配...和子查询中某个作比较,例如15>ANY(40,10,25),因为15>10所以上式成立 ALL 和子查询返回所有比较,例如15>ANY(40,10,25),因为40>15所以上式不成立 */

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Day6——R包

包含150种鸢尾花信息,每50种取自三个鸢尾花种之一(setosa,versicolour或virginica)。...数据框是一种二维表格结构,其中包含了多个变量(字段)和观测(行)。在进行数据分析时,有时我们只对数据框中特定字段感兴趣,而不需要使用所有的字段。...left_joinleft_join(test1, test2, by = 'x')#保留 test1 中所有观测全连full_joinfull_join( test1, test2, by = 'x...')#保留test1和test2 中所有观测半连接semi_joinsemi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')#返回能够与y表匹配x表所有记录反连接anti_joinanti_join...(x = test2, y = test1, by = 'x')#返回无法与y表匹配x表所记录简单合并bind_rows()函数需要两个表格列数相同,而bind_cols()函数则需要两个数据框相同行数示例数据

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两个神奇R包介绍,外加实用小抄

新建一个数据框赋值给bioplanet这个变量(赋值符号<-还记得嘛)括号里是“列名”=列,这里列名要加双引号。这里涉及几个给列填充数值函数 rep,重复,括号中填要重复字符和重复次数。...expand(列出每列所有可能组合,天哪我是写到这里时候刚看懂!) 来看示例 ? ? 我是看到了结果才知道我干了啥喂。就是选中列中各种组合,成为一个新表。...3.distinct 去除重复行(其实就是列出某一列所有的不同) distinct(frame1,geneid) distinct(frame1,geneid,Sampleid)#列出这两个都重复行...4.select 按列筛选(选择符合要求列) select(frame3,geneid,expression) #选择特定两列 select(frame3,-Sampleid) #反选,all but...•semi_join只保留第二个表格中包含id ? 只是把表1中gene4去掉了,但并没有加上表2annotion列。 •anti-join只保留第二个表格中包含id ?

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R语言lasso改进逻辑回归变量选择分析高血压、易感因素、2型糖尿病和LDL可视化

3个模型:Logistic模型、成组Lasso Logistic模型、由Lasso选出协变量Logistic模型,3个易感因素、高血压、2型糖尿病和LDL,得出误差率和变量数目的图。...为了比较不同调整参数筛选解释变量效果, 建立如下三个包含不同协变量模型通过十折交叉验证计算判断误差: 1)模型 I:包含所有待选协变量 Logistic 模型; 2)模型 II:成组 Lasso...=T) head(data) 1)模型I:包含所有待选协变量Logistic模型; 包含所有待选协变量Logistic模型是一种统计模型,用于预测二分类结果概率。...每个单元格代表了在特定类别下样本数量。 混淆矩阵四个主要单元格包括: 真正例(True Positive, TP):预测为正例且实际也为正例样本数量。...这意味着,在仅包含由成组Lasso选出协变量Logistic模型中,只有少数对预测目标有重要影响协变量被保留下来,而其他对预测目标没有重要影响协变量则被排除。

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Python3分析Excel数据

两种方法可以在Excel文件中选取特定列: 使用列索引 使用列标题 使用列索引 用pandas设置数据框,在方括号中列出要保留索引或名称(字符串)。...设置数据框和iloc函数,同时选择特定行与特定列。如果使用iloc函数来选择列,那么就需要在列索引前面加上一个冒号和一个逗号,表示为这些特定保留所有的行。...pandas将所有工作表读入数据框字典,字典中键就是工作表名称,就是包含工作表中数据数据框。所以,通过在字典键和之间迭代,可以使用工作簿中所有的数据。...两种方法可以从工作表中选取一列: 使用列索引 使用列标题 在所有工作表中选取Customer Name和Sale Amount列 用pandasread_excel函数将所有工作表读入字典。...在一工作表中筛选特定行 用pandas在工作簿中选择一工作表,在read_excel函数中将工作表索引或名称设置成一个列表。

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【数据库设计和SQL基础语法】--查询数据--分组查询

筛选数据: 通过将数据分组应用条件,可以轻松地筛选出符合特定条件数据子集。这使得可以对关键数据进行更有针对性分析。 提高查询性能: 在处理大量数据时,分组查询有时可以优化查询性能。...这种方式可以用来对分组后结果进行更细粒度筛选,以便只保留满足特定条件分组。...它允许在同一查询中指定多个维度,生成包含所有可能组合聚合结果。CUBE 操作符生成结果比 ROLLUP 更全面,因为它包含所有可能组合。..., column2); 在这个语法中,CUBE 子句指定了要进行多维度分组列,生成结果将包含每个列组合聚合,以及所有可能列组合总计。...区别总结: 结果全面性: ROLLUP 生成结果包含每个列每个组合聚合,以及每个列总计。 CUBE 生成结果不仅包含每个列每个组合聚合,还包含所有可能列组合总计

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使用Power Query时最佳做

可以使用自动筛选菜单来显示列中找到不同列表,以选择要保留筛选。还可以使用搜索栏来帮助查找列中。还可以利用特定于类型筛选器,例如日期、日期时间甚至日期时区列 上 一个筛选器。...这些特定于类型筛选器可帮助你创建动态筛选器,该筛选器将始终检索前 x 秒、分钟、小时、天、周、月、季度或年份中数据,如下图所示。 备注若要详细了解如何基于列中筛选数据,请参阅 按筛选。...这有助于最大程度地减少每次向查询添加新步骤时等待预览呈现时间。临时处理数据子集如果在Power Query 编辑器中向查询添加新步骤很慢,请考虑先执行“保留第一行”操作限制要处理行数。...然后,添加所需所有步骤后,删除“保留第一行”步骤。使用正确数据类型Power Query中一些功能与所选列数据类型相关。...例如,选择日期列时,“添加列”菜单中“日期和时间”列可用选项将可用。 但如果列没有数据类型集,则这些选项将灰显。类型特定筛选器也会出现类似的情况,因为它们特定于某些数据类型。

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使用SMM监控Kafka集群

我们开始逐渐介绍使用SMM用例。 SMM提供了基于智能筛选,该筛选使用户可以选择生产者、Broker、Topic或消费者,根据选择仅查看相关实体。...SMM非常聪明,可以仅显示那些将数据发送到选定Topic生产者,并且仅显示那些从这些Topic中消费消费者筛选对四个实体中任何一个进行选择。...更新inactive.producer.timeout.ms以更改生产者被视为活动时间段。以毫秒为单位指定此。 ? 识别生产者状态 两种方法可以识别生产者是活动还是消极。...监控消费者 查看有关消费者摘要信息 概览页面在页面右侧为您提供有关消费者摘要信息。您可以使用“活动”,“消极”和“所有”选项卡仅在活动或消极或所有消费者中查看消费者。...查看消费者资料 消费者配置文件显示有关每个消费者详细信息,包括: • 包含消费者数。 • 中消费者实例数量。 • 有关消费者滞后详细信息。 要访问消费者个体资料: 1.

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Extreme DAX-第5章 基于DAX安全性

它将层次结构两列作为参数,返回从层次结构顶部到当前 EmpNr 路径。结果是一个文本字符串,其中包含由竖线字符分隔所有 EmpNr 串联。...我们希望任何错误信息,因此图5.19中视觉对象是最佳选择。在此示例中,部门员工SSN 正确显示,其他员工显示为空。...对于Employee表, Employee (private)表包含行数必须是Employee表两倍。我们将其分为两,一包含EmpNr所有,以及所有私有数据,我们将这些行称为正行。...另一行还包含EmpNr所有,但在私有列中是空白(或你选择任何其他显示方式),我们将这些行称为负行。附加列 Private 有助于区分正行和负行。图5.21示意性地显示了这一点。...这意味着你可以创建一个包含按团队划分工资成本报表,对显示特定团队里按员工工资成本详细报表进行钻取。详细报表底层模型可以实现自己安全策略,因此可以阻止未经授权用户查看详细数据。

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python df 列替换_如何用Python做数据分析,没有比这篇文章更详细了(图文详情)...

生成数据表函数是 pandas 库中 DateFrame 函数,数据表一共有 6 行数据,每行 6 个字段。在数据中我们特意设置了一些 NA 问题字段,例如包含空格等。...“定位条件”在“开始”目录下“查找和选择”目录中。  查看空  Isnull 是 Python 中检验空函数,返回结果是逻辑包含返回 True,包含则返回 False。...以数组形式返回,包含表头信息。  ...下面的代码和结果中可以看到使用 dropna 函数后,包含 NA 两个字段已经不见了。返回是一个包含数据表。  ...Where 函数用来对数据进行判断和分组,下面的代码中我们对 price 列进行判断,将符合条件分为一,不符合条件分为另一使用 group 字段进行标记。

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基于XGBoost『金融时序』 VS 『合成时序』

所有分析和优化仅在train_val.csv数据集上执行。train_val.csv包含12,000个观测,test.csv包含12,000个观测。...我们随机选择了一年,使用函数getTradingDates重命名了这些列(总是一个万能R程序包……)。...(我们在这里再次使用了melt,但查看了pivot_longer函数以获得更直观应用程序) 此处代码中一个重要说明是,我们是按随机抽样,也就是说,我们不会从所有所有观测结果中随机抽样。...我们选择了4个观测根据它们筛选出数据。 足够数据分析我们可能还可以同时进行PACF图和其他一些探索性数据分析,继续使用tsfeatures包生成金融时间序列特征。...在下面的代码中所做是随机抽取5个(使用整个数据集需要很长时间才能计算时间序列特征),然后将tsfeatures包中所有函数应用于每个时间序列资产数据通过映射每个资产数据计算时间序列特征来完成。

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