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R-INLA-参数介绍

贝叶斯地理统计模型R-INLA-参数介绍 在前述的内容中,我们介绍了,如何利用海拔高度预测降雨量信息,在建立了INLA空间模型后,需要对模型的参数进行提取,但是具体涉及到哪些参数,所以本篇内容就来介绍,...image-20200622221446422.png 该回归模型包含三个参数β1, β2, and σ,在INLA模型中,主要是涉及β与 σ,变异参数( σ)也通常叫做 hyperparameters...然后我们的 R-INLA 是通过计算 τ = 1 / σ2 来得到σ。 所以参数的分布图见下。关于GLM及固定效应模型等,以此类推,在建立好的INLA模型中,获取对应参数。...我们的INLA参数存储在fit模型中summary.fixed。可以获取不同的β值。...),σ(Spatial Variacne)及r(sptial rang) 参考 1.Geostatistical data 2.Spatial analysis of geotagged data

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R语言画图par() 函数参数详解

R语言画图par() 函数参数详解 在使用R语言画社交网络图时...如前面所说,直接在R编辑器中输入命令par()或者par(no.readonly=TRUE)都可以获取当前的各个绘图参数。 函数par()中的参数可以分为三大类: (1)只能读取,不能进行设置。...若为TRUE(且当前的R会话是可交互状态),则在绘制新图像之前会要求用户输入确认信息。...值x和y用于设定x和y轴上的刻度线的个数,而len设定了刻度线的长度(目前R中这个值是没有效应的)。 las。只能是0,1,2,3中的某一个值,用于表示刻度值的方向。...取值范围为:"r", "i", "e", "s", "d"。一般来说,计算方式是由xlim的数值范围确定的(如果xlim指定了的话)。"

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R语言绘图001-基础参数

plot(1:4,ann=FALSE)') #添加标题为plot(1:4,ann=FALSE) ask,逻辑值,若为TRUE(且当前的R会话是可交互状态),则在绘制新图像之前会要求用户输入确认信息。...lab 设置坐标轴刻度数目(R会尽量自动“取整”2);取值形式c(x, y,len):x和y分别设置两轴的刻度数目,len目前在R中尚未生效,因此设置任意值都不会有影响(但用到lab参数时必须写上这个参数...xaxs, yaxs 坐标轴范围的计算方式;取值范围为:"r", "i", "e", "s", "d"。一般来说,计算方式是由xlim的数值范围确定的(如果xlim指定了的话)。"...R提供了很多和颜色相关的函数供我们调用,如colors()、palette()、rainbow()、rgb()、gray()、hsv()、hcl()等等。...以后也会对“如何设定颜色”这一问题进行整理,并且接下来关于R语言的博文也会重点关注于可视化方面,包括如何绘制散点图、条形图、热点图、地图等。 ylab y轴标题

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R」do.call 的妙用——参数更新

R 中的 do.call() 是我极少用到的一个函数,不过它在很多情况下是蛮有用的,之前我也做过简单的介绍。...它可以在实际调用函数时将参数以列表的形式传入,下面是一个简单的函数: f <- function(x) print(x^2) 我们可以用下面的方式调用 do.call(): do.call(f, list...最近我需要批量更新参数时发现了 do.call() 的好用之处。 在批量建模时可能需要比较对建模函数设定不同的参数,我们以求和函数作为建模函数举例。...假设建模需要 4 个参数,造一个类似的求和函数: Sum <- function(a = 1, b = 2, c = 3, d = 4) { return(sum(a, b, c, d)) } 而我们需要批量运行这个函数...,而且只修改其中 3 个参数,另外参数是外部定义的,比如说其他使用这个函数的人。

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Python的h5py模块

读取和保存HDF5文件1) 读取HDF5文件的内容首先我们应该打开文件:>>> import h5py>>> f = h5py.File('mytestfile.hdf5', 'r')请记住h5py.File...>>> dset[...] = np.arange(100)2) 创建一个HDF5文件我们用’w’模式打开文件>>> import h5py>>> import numpy as np>>> f = h5py.File...但是我们需要先用读写模式打开文件:>>> f = h5py.File('mydataset.hdf5', 'r+')>>> grp = f.create_group("subgroup")然后grp就具有和...namemydatasetsubgroupsubgroup2为了遍历一个group内的所有直接和间接成员,我们可以使用group的visit()和visititerms()方法,这些方法需要接收一个回调函数作为参数...用关键词compression来指定压缩滤波器,而滤波器的可选参数使用关键词compression_opt来指定:>>> dset = f.create_dataset("zipped", (100,

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Python数据存储之h5py详解

使用h5py 创造一个HDF5文件 可以使用以下代码在Python中创建一个HDF5文件: import h5py # 创建HDF5文件 with h5py.File('data.h5', 'w')...读取一个HDF5文件 import h5py # 读取HDF5文件 with h5py.File('data.h5', 'r') as f: # 读取名为“mydataset”的dataset...但是我们需要先用读写模式打开文件: >>> f = h5py.File('mydataset.hdf5', 'r+') >>> grp = f.create_group("subgroup") 然后grp...mydataset subgroup subgroup2 为了遍历一个group内的所有直接和间接成员,我们可以使用group的visit()和visititerms()方法,这些方法需要接收一个回调函数作为参数...用关键词compression来指定压缩滤波器,而滤波器的可选参数使用关键词compression_opt来指定: >>> dset = f.create_dataset("zipped", (100,

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R语言入门之非参数假设检验

前言 在往期内容中,我已经和大家讲解了t检验和方差分析(ANOVA)在R语言中如何实现,这里需要注意:使用t检验和方差分析时,需要样本服从正态分布,并且方差齐性,或者经过变量变换后服从正态分布和方差齐性...但是如果我们的数据无论经过怎样的变量变换都达不到正态分布或方差齐性的要求,那么我们就需要使用基于秩次的非参数假设检验,非参数检验主要针对非正态样本,其统计效力会比带参数的假设检验要弱一些。...R语言里提供了许多可以进行非参数假设检验的函数,这里我们主要介绍三个常用的函数,一个是基于秩次的Wilcox秩和检验, Kruskal Wallis秩和检验和Friedman秩和检验。...friedman.test(y~A|B)# y是数值型向量(检测量),A 代表处理组,B代表区组 下图是一个随机区组设计的Friedman秩和检验数据表,有兴趣的朋友可以将数据制成表格,在R中进行计算...上面就是关于如何在R中进行非参数检验的方法,主要有三个函数:(1)独立双样本或配对样本的wilcox.test();(2)完全随机设计多个样本的Kruskal Wallis秩和检验kruskal.test

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