我正试图为什么单体型调用者创建一个蛇形工作流,但我正在与MissingInputException错误进行斗争。我得到的是:
Building DAG of jobs...
MissingInputException in line 9 of /srv/KLN/users/esv/KRISPS/whatshap/phased_illumina_FILT5/snakefile:
Missing input files for rule all:
saturna/saturna_phased_illumina_FILT5.vcf.gz
stratos/stratos_phased_illumina
我有一个巨大的data.frame,它有大约300万行和100列。在其中一列中,有关于ID的信息。我需要创建一个R脚本,它可以用于基于这个ID生成一个新的data.frame。基本上,这个新的data.frame将只包含找到这个ID的行和来自大data.frame的其余列,再加上一些需要根据ID column中包含的信息创建的额外列。最后一个想法是将其实现到一个闪亮的应用程序中,这样用户就可以输入名称ID,然后新的data.frame就可以可视化了。
下面是我的数据的一个例子。这将是我需要按示例拆分的大型data.frame:
Chr Start End Ref A
我正在将我的应用程序移到新的服务器上,并且最近遇到了一些问题。PHP version: 5.5.34、Mac OSX Apache 2.4
Laravel版本:4.2
我得到了一个网格,但我的浏览器抱怨URL。
我的ajax请求如下所示:
$(grid_name).jqGrid({
//to get this function working make sure you've .htaccess file
//url:'illumina_xhr_get_data', - won't work if not added illumina
我已经绞尽脑汁去做一些对比我更有Perl编程经验的人来说可能更容易的事情。
我有下面的代码。
use strict;
use warnings;
my @lines = do {
open my $in_fh, '<', 'input.txt' or die qq{Unable to open "input.txt" for input: $!};
<$in_fh>;
};
chomp @lines;
my $re = join '|', @lines;
my @files = grep /^(?:$
嗨,伙计们,我的滚动条有问题,在照片中你可以看到灰色框,这是一个简单的列表框,如何将滚动条放在红色的特定位置,而不是在屏幕的右端或底部,就像普通的拼图栏一样?谢谢!
添加代码:
from tkinter import *
from ctypes import windll
def inserisci_spesa():
global lista_spese
global testo_nuova_spesa
if testo_nuova_spesa.get() != "":
lista_spese.insert(0,testo_nuova_s
我有一个A类型的事件序列,A包含数据对象B的枚举。我想将序列A映射到C中,以便它是B的平坦序列。
public class Sandbox
{
public class A
{
public IEnumerable<B> Collection { get; set; }
}
public class B
{
}
private readonly IObservable<A> _sequence;
public Sandbox(IObservable<A> sequence
我有一个包含6个cols的CSV文件。我将它加载到内存中,并通过一些方法进行处理。我的结果是一个包含4个cols的数据帧,如下所示: name number Allele Allele
aaa 111 A B
aab 112 A A
aac 113 A B 但现在我得到了另一种格式的csv (没有Illumina),我需要将其更改为上面的格式。 我有一个结果: name number Allele1 Allele2
aaa 111 A C
aab 112 A G
aac 113
我很难理解一个查询并让它在黑斑羚上运行。我创建了以下工作查询来连接两个表:
SELECT *
FROM illuminavariant as vcf, ensembl_genes as ens
WHERE vcf.filter = "PASS"
AND vcf.qual > 100
AND vcf.chromosome = ens.chromosome
AND vcf.position BETWEEN ens.start AND ens.stop
现在,我试图编写一个查询,查找vcf.filter = "PASS“和vcf.qual > 100的所有变
这是一个问题:用一个包含G元素的列表来表示G大小的基因组,其中每个元素都包含有关该位置的相关信息,例如,该位置的核苷酸被测序了多少次。若要模拟一次测序过程,请执行以下步骤:·将列表中的所有元素设置为0(标记每个核苷酸已被测序0次)。·随机选择L大小R读的起始位置,并对每次读更新所包含的核苷酸序列的次数进行测定。
到目前为止我有这样的想法:
genome = [0]*G
for x in range(R):
randlocation = random.randint(0,G-L)
genome = genome[0:randlocation] + [x+1 for x in ge
我有这个版本的makefile [sbsuser@compute-00-01 415]$ make --version GNU Make 3.81
我有一个目录体,我有3个文件。我只想生产一个输出。这就是我写的。
`
OUTSOMATIC=SOMATIC
FINAL=FINAL
INPUT=$(wildcard $(OUTSOMATIC)/*.vcf)
OUTSORT2= $(patsubst $(OUTSOMATIC)/%.vcf,$(FINAL)/%somatic.ensemble.gz,$(INPUT))
$(info lista $(OUTSORT2))
$(info lista $(