前言 关于技术，只有不停重复学习，方能如扎如稳的前行。 1.函数柯里化 函数柯里化的是一个为多参函数实现递归降解的方式。其实现的核心是: 要思考如何缓存每一次传入的参数 传入的参数和目标函数的入参做
push 用于向数组的末尾添加一个或多个元素，并返回新的长度;改变原数组的长度，将新的值添加在数组的尾部
作者：CarterLi https://segmentfault.com/a/1190000012463583 不要用 for_in 遍历数组 这是 JavaScript 初学者常见的误区。for_in 用于遍历对象中包括原型链上的所有可枚举的（enumerable）的 key，本来不是为遍历数组而存在。 使用 for_in 遍历数组有三点问题： 1.遍历顺序不固定 JavaScript 引擎不保证对象的遍历顺序。当把数组作为普通对象遍历时同样不保证遍历出的索引顺序。 2.会遍历出对象原型链上的值 如果你改
//every 检测数组中的值是否存在满足条件的值，全部满足条件返回true和有一个不满足就返回false，不对空数组进行检测，不改变原数组
背景 最近在涉猎 【React】 前端框架知识时; 更多的精力会放在对 JS 的数据处理上 并且, 在业务中会经常使用数组操作 显然， 对不熟悉前端开发的小伙伴，会很容易入坑的 ——
深拷贝就是在拷贝数据的时候，将数据的所有引用结构都拷贝一份。简单的说就是，在内存中存在两个数据结构完全相同又相互独立的数据，将引用型类型进行复制，而不是只复制其引用关系。
源码分析forclone()System.arraycopy()Arrays.copyof()
XHMM是一款利用WES数据分析CNV的软件，利用PCA降维来归一化外显子区的测序深度信息，然后通过隐马可夫模型来预测CNV,对应的文章链接如下
经动脉化疗栓塞（TACE）是晚期肝癌（HCC）最常用的治疗方法，但仍然缺乏准确的实时生物标志物来监测其治疗效果。在本研究中，研究者探讨了循环游离DNA（cfDNA）的拷贝数分析是否可用于预测接受TACE治疗的HCC患者的反应和预后。总共从64名HCC患者，57名肝硬化（LC）患者和32名健康志愿者中收集了266份血浆cfDNA样本。研究者对cfDNA样品进行了低深度全基因组测序（LD-WGS），以进行拷贝数变异（CNV）分析和肿瘤分数（TFx）定量。然后，探讨了TFx/CNVs与疗效、治疗结局和脂碘醇沉积的相关性。TACE治疗期间TFx的变化与患者的肿瘤负荷有关，可以准确和更早地预测治疗反应和预后，提供mRECIST以外的替代策略。在低深度拷贝数分析过程中，研究者利用Sentieon 软件对cfDNA 测序数据进行拷贝数分析前处理。
CNVkit使用on-target reads和非特异性捕获的off-target reads来计算每个样本基因组的log2拷贝比。简而言之，off-target bin是从目标区域之间的基因组位置分配的，off-target bin的平均大小比平均on-target bin大得多，以匹配它们的read counts.然后分别使用目标位置和非目标位置来计算每个间隔内的平均reads深度。然后将目标reads深度和非目标reads深度结合起来，将其归一化为来自对照样本的参考，并对几个系统偏差进行校正，从而得到 log2 copy ratios的最终表。内置的segmentation algorithm可以在log2 copy ratios上运行，以推断discrete copy number segments。
基于read depth的分析策略, 采用滑动窗口的方式，将基因组划分为等长的窗口，称之为bin, 利用不同窗口内测序深度的分布来预测CNV, 如下图所示
这个方法是可以实现拷贝的，但是我们需要注意的是，当属性对应的一个值是引用类型时，我们会发现这也是一个浅拷贝：
Javascript的基础知识。 ECMAScript有几个常见的基本方法一直没怎么搞清楚， 一、容易混淆的几个方法：split、slice、splice split() split()方法用于将一个字符串分割成字符串数组 var str = 'abcdefg'; var strArr = str.split(''); console.log(strArr); // ["a", "b", "c", "d", "e", "f", "g"] slice() slice()方法用于返回从数组中返回的元素，不会改变
在一个需求中，我需要实现一个拖拽的功能，其中我使用了 sortable.js 去实现，但我发现我拖拽之后的数据并没有渲染在页面上。
由博主《前端初级工程师面试系列一JS基础》文章一JS变量类型引伸的考点，变量类型分为基本类型和引用类型，那么在变量拷贝赋值时，也是不一样的，分为浅拷贝和深拷贝，是面试中常考的知识点，也是实际开发中经常会用到的内容。
这是直接赋值的情况，不涉及任何拷贝。当改变newArr的时候，由于是同一个引用，arr指向的值也跟着改变。
1.展开数组/字符串/对象 2.拷贝数组/对象（浅拷贝） 3.合并数组/对象 4.把伪数组转换成真数组 5.收集函数的剩余参数
英文标题：Chemoresistance Evolution in Triple-Negative Breast Cancer Delineated by Single-Cell Sequencing
目的：Array.of() 出现的目的是为了解决上述构造器因参数个数不同，导致的行为有差异的问题。
扩展运算符拷贝数组，只有第一层是深拷贝，即对一维数组使用扩展运算符拷贝就属于深拷贝，看下面的代码：
数组是 JS 中广泛使用的数据结构。数组对象提供了大量有用的方法，如array. forEach()、array.map()等来操作数组。
自己创建一个新的对象，来接受你要重新复制或引用的对象值。如果对象属性是基本的数据类型，复制的就是基本类型的值给新对象；但如果属性是引用数据类型，复制的就是内存中的地址，如果其中一个对象改变了这个内存中的地址，肯定会影响到另一个对象。
测试性能必须采用基准（标准）性能测试方法，否则测试结果不可信。在 dotnet 里面，可以采用 BenchmarkDotNet 进行性能测试。详细请看 C# 标准性能测试
展开运算符也是我平时在书写代码是经常用到的新特性，允许一个表达式在某处展开，主要适用于数组或者类数组的展开，他给我们的coding过程带来了极大的便捷。
数组扁平化就是将多层数组拍平成一层，如[1, [2, [3, 4]]]变成[1, 2, 3, 4]
在JavaSCript中的数据类型中，分为两种：原始类型（number/string/boolean/null/undefined）和引用类型（array/object/function）。
这个类在日常的开发中，还是非常常用的。今天就总结一下Arrays工具类的常用方法。最常用的就是asList,sort,toStream,equals,copyOf了。另外可以深入学习下Arrays的排序算法，这个还是非常有用的。 所有的方法都是在下面的类中进行测试的: public class ArraysTest { String[] array = new String[]{"a","c","2","1","b"}; Integer[] ints = new Integer[]{5
肿瘤样本拷贝数变异 (CNV，copy number variation)，即 somatic CNV 是最主要的体细胞突变之一。
写这篇文章的缘由是上周在公司前端团队的code review时，看了一个实习小哥哥的代码后，感觉一些刚入行不久的同学，对于真实项目中的一些js处理不是很熟练，缺乏一些技巧。
vue对数据的监听都知道是通过Object.defineProperty，今天简单把过程捋了一下，弄清楚vue对数据的处理。
call 突变的工具推荐使用GATK HaplotypeCaller 和 Platypus。也有基于贝叶斯统计方法的 Samtools/BCFtools 和 FreeBayes 。不同工具得到的结果的一致性通常在 90% 以上。 过滤 Artifacts 虽然从上面方法得到的突变结果准确度高达 99.9%，但是依然会由于人为因素而引入了假阳性突变。因此，得到的突变结果需要在 IGV 中进行人工手动的可视化过滤。如：低质量碱基（图 2 a），reads末端的artifacts（图 2 b），由于局部比对错误引起的插入缺失（图 2 c），strand bias artifacts（图 2 d）、低复杂度区域中的错误比对（图 2 e）等 识别de novo mutations 在人群中，de novo mutations 存在一定的频率。可以基于已经公开的数据集，如 gnomAD 进行注释和过滤。一般认为在人群中 MAF > 0.0001（也有人说是0.001），更有可能是 germline mutation。 拷贝数和结构变异 拷贝数变异 CNV 是人类遗传变异的另一种类型，与许多疾病相关，如抑郁症 autism，智力底下 intellectual disability，先天性心脏病 congenital heart disease。NGS 在临床上也有应用于 CNV 检测，相应的工具有：cn.MOPS 、CONTRA、CoNVEX、ExomeCNV、ExomeDepth 和 XHMM。如果是全基因组测序，还有检测结构变异 SV，常用的软件有 DELLY 、Lumpy 、Manta 、Pindel 和 SVMerge ，但由于二代测序的 reads 读长较短，检测 SV 仍然存在挑战性。 拷贝数变异和 SV 可以通过 IGV 进行可视化查看：
要说明的是，虽然第二种方法创建数组指定了长度，但实际上所有情况下数组都是变长的，也就是说即使指定了长度为5，仍然可以将元素存储在规定长度以外的，注意：这时长度会随之改变。
我相信你一定或多或少的接触或使用过 JS 中的扩展操作符（Spread Operator），在基本形式中，扩展操作符看起来像三个点，比如如下这样：
今天和大家分享的是2020年3月发表在Nature genetics（IF：27.603)上的一篇文章Comprehensive molecular characterization of mitochondrial genomes in human cancers，作者使用pan-cancer研究的WGS和RNA-seq数据，对癌症线粒体基因组进行了全面的分子表征。
前言： 最开始意识到深拷贝的重要性是在我使用redux的时候（react + redux）， redux的机制要求在reducer中必须返回一个新的对象，而不能对原来的对象做改动，事实上，当时我当然不
目录 前言 一维数组 创建一维数组 一维数组的使用 数组作参数 认识 JVM 内存区域划分 数组做参数基本用法 理解引用类型 认识 null 数组作为方法的返回值 二维数组 二维数组的长度 二维数组的遍历 数组练习 ---- 前言 ---- 本章主要讲解： 一维数组的定义和使用 数组在内存的基本存储知识 二维数组的定义和使用 数组练习 一维数组 ---- 什么是数组： 数组本质上就是让我们能 "批量" 创建相同类型的变量（相同的类型） 注：特别是表示大量的数据，用数组非常便捷 创建一维数组 基本
三阴乳腺癌（TNBC）是乳腺癌的一种侵袭性亚型，是指雌激素受体（ER），孕激素受体（PR）和原癌基因（HER-2）均为阴性的乳腺癌，常对化疗产生耐药性。而耐药性的产生到底是之前存在的稀有突变细胞受到选择还是新基因突变导致的，仍是一个谜团。
三阴乳腺癌（TNBC）是乳腺癌的一种侵袭性亚型，是指雌激素受体（ER），孕激素受体（PR）和原癌基因（HER-2）均为阴性的乳腺癌，常对化疗产生耐药性。而耐药性的产生到底是之前存在的稀有突变细胞受到选择还是新基因突变导致的，仍是一个谜团。 为研究该问题，Charissa Kim等人利用混合细胞外显子测序以及单细胞DNA和RNA测序，对新辅助化疗（NAC）期间20名TNBC患者进行跟踪分析。深度外显子组测序结果显示10例病人化疗后原始突变消失，清除了所有肿瘤细胞；10例病人化疗后突变依然存在。对其中8位患者（
👆点击“博文视点Broadview”，获取更多书讯 lodash里的cloneDeep函数可以用来解决深拷贝的场景，但你有没有思考过lodash里的cloneDeep函数是如何实现的呢？ 虽然我们可以直接使用lodash，但是学习深拷贝函数的实现原理仍然是非常有意义的，深拷贝也是一道非常经典的前端面试题，其可以考察面试者的很多方面，比如基本功、代码能力、逻辑能力。 深拷贝看似简单，但要想实现一个完美的深拷贝却并不容易，通过笔者的面试考察经验来看 ，只有 50%的人能够实现基础版本，能实现完美版本的竟然不到
默认情况下，推断CNV在整个样本水平上运行，例如从单个患者中提取的某种细胞类型的所有细胞。这是推断CNV的最快方法，但往往不是最优方法，因为给定的肿瘤样本可能有具有不同CNV模式的亚群。 通过设置infercnv::run(analysis mode='subclusters")，infercnv将尝试将细胞分成具有一致的CNV模式的组。CNV预测(通过HMM)然后将在子聚类而不是整个样本的水平上执行。
Genomic comparison of esophageal squamous cell carcinoma and its precursor lesions by multi-region whole-exome sequencing
我们假设一个变量 name 具有一个与之关联的原始值（number，string，boolean，undefined 和null）。 如果我们将此变量 name 复制到另一个变量name2 ，则原始变量的任何修改都不会影响到第二个变量，因为它们是原始值。
先前的中国人肝癌研究队列规模有限，且集中在WES，对于 WGS 上研究较少。PCAWG 大规模的全基因组研究因为测序深度较浅而无法完全分析肝癌基因组的亚克隆结构。因此作者开展了 Chinese Liver Cancer Atlas（CLCA）中国人肝癌图谱项目。
基本类型值是指在栈内存保存的简单数据段，在复制基本类型值的时候，会开辟出一个新的内存空间，将值复制到新的内存空间，举个栗子：
数组是一个基础的数据结构，它用来存储一组相同类型的元素的集合。数组非常有用，例如Java提供的集合类ArrayList、HashMap等都是基于数组来实现的。
在 main 主函数中 , 调用 get_memory 子函数 , 返回 malloc 初始化的堆内存 , 可以 正常 使用指针 操作该 堆内存 ;
我们先来看一下cplusplus.com - The C++ Resources Network网站上memmove()函数的基本信息：
随着生物技术在医学领域的快速发展和人们在细胞分子水平对肿瘤发病机制认识的深入，肿瘤治疗逐渐从前基因组的细胞毒性药物治疗时代过渡到后基因组的靶向治疗新时代。提到基因检测，前几年，临床医生在向患者推荐时还心存疑虑，而近两年，基因检测已成为癌症诊疗的标准动作，基本上每一个癌症患者都有一套自己的基因检测报告。不得不说，一个患者一套方案的个体化诊疗时代已经到来。比如，一位患者患了癌症，不仅要做病理诊断还要做全基因检测，发现突变位点，进而为患者制定包括化疗，靶向，免疫治疗方案，以及家族癌症风险评估。
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