DOCK是经典的分子对接软件,很多对接软件的思路都是它的基础上发展起来的,但是无奈操作太复杂,上手的或者用来做科研的论文上少见。...http://ringo.ams.sunysb.edu/index.php/DOCK_Tutorials
如果链表中有某个节点,可以通过连续跟踪 next 指针再次到达,则链表中存在环。 为了表示给定链表中的环,评测系统内部使用整数 pos 来表示链表尾连接到链表中...
---- DOCK教程 ---- 简介: DOCK是基于Unix的科学计算软件。 遵循通用的安装方法:下载,解压缩,配置,构建和测试。DOCK的简单配置方案基于纯文本文件。...DOCK的安装是如此简单和透明,以使用户有机会自己解决问题。 DOCK是经典的分子对接程序,用于识别潜在的结合构象以及分子与靶标的相互作用。...DOCK能做的 预测小分子-蛋白质复合物的结合模式 搜索配体的数据库,以模拟经过实验验证的抑制剂的抑制性结合相互作用的化合物 在配体数据库中搜索与特定蛋白质的特定位点结合的化合物 搜索与核酸靶标结合的化合物的配体数据库...---- 对接步骤: (1)下载蛋白结构文件: 1ABE.pdb (2)准备受体文件 删除配体分子文件 使用chimera的dock prep功能对受体文件进行准备(删除) 删除水分子,加氢,加电荷 保存为...或者说对接口袋) 需要程序/指令:showsphere sphere_selector (5)生成Grid 围绕着活性位点建立一个box 生成Grid (6)Docking 进行对接(半柔性): 需要程序/指令:dock6
Dock从初级到高级全套教程 dock是iMac中很常见的一个功能,而且非常实用,那么dock到底是什么意思呢?...1.经常使用苹果电脑的小伙伴,和大家讨论时总会听到有人在说dock栏,不过还是有很多小伙伴不知道dock到底是什么意思,接下来小编就给大家普及一下。...2.dock一般指的就是苹果操作系统中的停靠栏,也就是苹果电脑桌面中最下方,类似于Windows系统下方的任务栏,不过要比Windows任务栏更加有趣味性。...3.dock的主要作用就是启动、切换运行中的应用程序,是一种很实用的功能界面,适用于Mac OS X操作系统。不过如今不同的操作系统中,都有很多不同的dock程序。...4.如今dock已经不仅仅是用在苹果电脑中了,苹果的所有产品都有这个功能了,比如说iPad中最下方,类似于毛玻璃的那一栏,就是dock系统。同理iPhone下方那一栏也是。
要安装最新的 Docker 版本,首先需要安装 apt-transport-https 支持,之后通过添加源来安装。要安装最新的 Docker 版本,首先需要安...
对接 直接进行半柔性对接,刚性对接不感兴趣 使用指令: dock6 -i dock.in 创建文件dock.in 参数详解: http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/tutorials.../ligand_sampling_dock/ligand_sampling_dock.html 格式为: conformer_search_type...../3_grid/grid multigrid_score_secondary no dock3.5...20 rank_ligands yes 输入指令,进行运算: dock6...-i dock.in -o dock.out 输出文件: dock.out为总结的参数文件 anchor_and_grow_ranked.mol2为输出文件,里面有20个排名较高的mol 使用chimera
FF/ UUUUUUU/ CC/ CC\ SSSSSS/ FFFFFFFFF/ University of California at San Francisco, DOCK...-1 working_directory /Users/sujiaqi/Desktop/PyDrug.0.4/PyDrug_going/PyDrug_DOCK...0.75 ____________________File_Input____________________ receptor_file rec-1htp-dock-prep.mol2...box_file rec_box.pdb vdw_definition_file /Users/sujiaqi/Program/dock6
此外,HyperDock还支持对Dock中的文件夹、文档和网站进行快速预览和访问。它还允许用户自定义所需的快捷键和手势,以进一步提高工作效率。
DockView for Mac(Dock窗口预览工具)以下是DockView的一些特点:预览窗口:DockView允许用户在Dock中预览不同应用程序的打开窗口,无需切换到该应用程序即可通过鼠标悬停在...Dock图标上进行查看。
生成Spheres 官方教程链接: http://dock.compbio.ucsf.edu/DOCK_6/tutorials/sphere_generation/generating_spheres.htm...步骤 接上文,已经完成了蛋白受体以及配体的准备,加氢加电荷 现在开始准备生成Spheres 生成Sphgen是DOCK的必须 Sphgen生成多组重叠的球体,以描述分子或分子表面的形状。...生成Sphgen (1)使用chimera的工具生成dms File -> Open -> rec-1htp-dock-prep.mol2.
像下图的链表: 上面的链表是一个简单的环形链表,我们可以试着用两根手指来代替两个指针,开始两个指针都在头部,开始循环后快指针走两步,慢指针走一步;稍加模拟之后就会发现,快指针虽然比慢指针快,但因为环的存在
如果用户启用 Space 模式,只需把鼠标移到 Dock 正在运行的程序上,即可显示该应用程序属于第几个 Space。...HyperDock for Mac(Dock优化工具)
如何在没有 Ubuntu Dock 的情况下访问活动概览 如果没有 Ubuntu Dock,你可能无法访问活动的或已安装的应用程序列表(可以通过单击 Dock 底部的“显示应用程序”按钮从 Ubuntu...Dock 访问)。...方法 1: 移除 Gnome Shell Ubuntu Dock 包 摆脱 Ubuntu Dock 的最简单方法就是删除包。...Ubuntu Dock 只对你的桌面隐藏,当你进入叠加模式(活动)时,你仍然可以看到并从那里使用 Ubuntu Dock。...to Dock 的一个很好的替代品(Ubuntu Dock 是从 Dash to Dock 分叉而来的)。
环形链表 空间换时间:哈希表法 这个问题有几种解决方案。
解题思路 通过快慢双指针解决环形链表问题(Floyd 判圈算法又称龟兔赛跑算法),满指针每次增1,快指针每次增2,若是环形快指针一定会超慢指针一圈。...若是快指针或快指针的下一节点为null则链表不为环形链表输出false。
下面是实现程序--实现程序是自己想学Esp8266连接机智云的时候无意中看到的,,,,,记得 天鲁哥 曾经说过环形队列实现的很巧妙,,,改天有空再研究下当初天鲁哥给的程序 往里面加数据尾指针向右增加....rb_t pRb; ///< 环形缓冲区结构体变量 uint8_t rbBuf[RB_MAX_LEN]; ///< 环形缓冲区数据缓存区 void rbCreate(rb_t*...rb,u8 *Buff,uint32_t BuffLen)//创建或者说初始化环形缓冲区 { if(NULL == rb) { printf("ERROR: input...(a):(b) ///< 获取最小值 /** 环形缓冲区数据结构 */ typedef struct { size_t rbCapacity;//空间大小...LOOPLIST_C_ uint8_t rbBuf[RB_MAX_LEN]; ///< 环形缓冲区数据缓存区 LOOPLIST_C_ void rbCreate(rb_t *rb,u8 *Buff
利用数组通过取模的方式实现环形队列,使队列达到复用的效果。 ?...当front和rear都指向2的时候代表队列空了,第二行中,在队列空了的情况下继续添加数据,会在队列下标为2和0的位置上添加, 当rear指向下标为1的位置时,队列再一次满了,从而实现了环形队列的效果,
给你两个单链表的头节点 headA 和 headB ,请你找出并返回两个单链表相交的起始节点。如果两个链表不存在相交节点,返回 null 。
环形队列可以使用数组实现,也可以使用循环链表实现。
1 (1)、安装插件 安装Vue插件 npm install loading-vue-component 使用 // main.js import loading from 'loading-vue-component
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