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    获取基因有效长度的N种方法

    我总结了几种获取基因有效长度(或非冗余总外显子长度、总转录本长度)的方法,现整理如下: 一、从上游输出文件结果中获取基因有效长度 一般而言,RNA-seq得到原始counts表达矩阵最常用到的上游软件就是...首先看看从gtf文件中获取基因有效长度的两种方法是否有差异。...,发现有一半的efflen是不匹配的?...仔细一想这也是可以理解的,因为上游中salmon是对样本中的转录本进行的统计,这说明了样本中有一半的基因并未表达其全部的转录本而已: salmon和gtf中获取的efflen比较 再将geneid_efflen_gtf1...gtf中获取的efflen比较 总结: 获取基因有效长度的最简便方法是直接从featureCounts或salmon的输出文件中提取。

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    四种获取fasta序列长度的方法

    在处理fasta序列的时候,我们经常需要获取每一条fasta序列的长度。今天小编就跟大家来分享四种获取fasta序列长度的方法。 一、awk awk '/^>/{if (l!...fai文件如下,前两列正好就是fasta序列的名字和长度。....fai文件的每一列的具体含义 第一列 NAME : 序列的名称,只保留“>”后,第一个空白之前的内容; 第二列 LENGTH: 序列的长度, 单位为bp; 第三列 OFFSET :...第一个碱基的偏移量, 从0开始计数,换行符也统计进行; 第四列 LINEBASES : 除了最后一行外, 其他代表序列的行的碱基数, 单位为bp; 第五列 LINEWIDTH : 行宽, 除了最后一行外..., 其他代表序列的行的长度, 包括换行符, 三、seqkit conda install seqkit seqkit fx2tab --length --name --header-line test.fasta

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    《剑指offer》数组中出现次数超过数组长度一半的数字

    如果您对本期有不同或者更好的见解,请后台留言,喜欢请点个好看,谢谢阅读。 题目 数组中有一个数字出现的次数超过数组长度的一半,请找出这个数字。...例如输入一个长度为9的数组{1,2,3,2,2,2,5,4,2}。由于数字2在数组中出现了5次,超过数组长度的一半,因此输出2。如果不存在则输出0。.../ 2) { return numbers[i]; } } return 0; } } 解法2: 目标值的个数比其他所有值加起来的数多...记录两个变量 1.数组中的某个值 2.次数 1.当前遍历值和上一次遍历值相等?...2.次数变为0后保存新的值。 3.遍历结束后保存的值,判断其是否复合条件 事件复杂度O(n) 不需要开辟额外空间 , 逻辑稍微复杂。

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    js获取元素的几种形式

    通过id获取元素 document.getElementById('div');//获取id为div的元素 通过class获取 document.getElementsByClassName('top'...);//获取页面中所有的class为top的元素集合 通过标签名获取 document.getElementsByTagName('p');//获取页面中所有的标签为p的元素集合 通过name获取 document.getElementsByName...('user');//获取页面中所有的name为user的元素集合 注意:通过class,name标签名抓取的元素是一个集合,即使该类只有一个符合要求的元素目标,也返回是一个集合,因此可以存储的变量,通过变量名...[0]获得第一个符合要求的标签目标....简单可以将返回的当做一个存储符合的数组,通过下标进行找到指定的位置. 当然也可以使用数组的方法返回,集合的目标数. alert(tops.length)可以提示出class为top的目标数

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    【Redis】Redis 列表 List 操作 ( 查询操作 | 根据下标获取元素 | 获取列表长度 | 增操作 | 插入值 | 删操作 | 移除值 | 修改操作 | 设置列表指定索引的值 )

    文章目录 一、List 列表简介 二、查询操作 1、根据下标获取元素 2、获取指定下标索引的元素 3、获取列表长度 三、增操作 1、插入值 2、在指定元素前后插入值 四、删操作 1、移除值 2、...List 列表中 ; List 列表 是 字符串列表 , 元素类型是 字符串 ; Redis 中的 List 列表 本质是 双向链表 , 可以将 字符串元素 添加到 列表的头部 或 尾部 ; 列表 对于...指向元素的实际内存空间 ; 同时还有 指向 前一个元素 和 后一个元素的 指针 ; 快速链表 是 链表 和 压缩列表 结合起来的产物 ; 二、查询操作 ---- 1、根据下标获取元素 根据下标获取元素..." 2) "Tom" 3) "abc" 127.0.0.1:6379> lindex name 2 "abc" 127.0.0.1:6379> 127.0.0.1:6379> 3、获取列表长度 执行...llen key 命令 , 可以 获取 key 列表 的长度 ; 代码示例 : 127.0.0.1:6379> lrange name 0 -1 1) "Jerry" 2) "Tom" 3) "abc"

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