题，譬如现在有一串字符串s1=“agtcgtaatgc”,想将另一个字符串s2="cgaa"比对到s1上，可以看到s2并非完全比对到s1上面，其中是有一个错配的。现在我要实现的就是寻找s2比对到s1上面的错配最少的位点。
浏览 783提问于2017-11-27
我想提取两个字符串(DNA序列)并生成比对分数。我找到了解密包，但它只允许我生成比对，而不是比对分数。我也试过使用“生物字符串”，但我无法生成分数。 谢谢你的帮忙!
浏览 9提问于2019-08-30得票数 0
回答已采纳
2回答
我有两个包含100个字符的数组(最大，可以小于或不同大小)，我希望对齐。当有一个字符与另一个字符不同时，我想添加一个"-“。我发现了基于动态规划的算法和基于动态规划的通用局部比对方法算法，但它们似乎太复杂了，无法完成我想要做的事情。有没有办法用diff算法进行这种比对？如果是，有人能告诉我怎么做吗？我在biostar部分进行了搜索，但似乎我需要使用我提到的两个算法。
英语不是我的母语，所以我可能搜索错了关键词。
浏览 2提问于2013-02-24得票数 8
回答已采纳
3回答
我有数以千计的DNA序列，范围在100到5000 bp之间，我需要对指定对进行比对并计算身份得分。Biopython pairwise2做得很好，但只适用于短序列，当序列大小超过2kb时，即使使用了'score_only‘和'one_alignment_only’选项，它也会显示严重的内存泄漏，从而导致the scriptjob 4945543.1 died through signal XCPU (24)
我知道还有其他用于比对的工具，但它们主要
浏览 1提问于2015-11-10得票数 4
我决定运行一些测试并绘制一些图形，以决定如何最优地打包数据以进行加密(看看加密/解密时间根据纯文本的长度而定)，因此我测量了加密1000条递增大小的字符串的时间(第一个长度为1，第二个字符串长度为2，等等我发现解密时间随着结果纯文本的大小而增加，尽管时间/字符通常会减少。但是，对于加密，所有测试所需的时间大致相同(对一个两个字符的字符串进行加密比对一个1000个字符的字符串进行加密( ~0.003
浏览 0提问于2014-07-24得票数 3
回答已采纳
1回答
在进行成对序列比对时，序列文件的典型大小是多少？我们能把生物体的整个基因组统一起来吗？
浏览 4提问于2014-04-06得票数 0
回答已采纳
1回答
我使用的字符串如下： "JAN-5,Feb,6 dec=900" 我希望用它们各自的月份int值替换月份字符串。因此，上面的结果等同于： "1-5,2,6 12=900" 我知道使用不区分大小写的正则表达式可能是可行的，但是我只看到了如何一次将其应用于一个月的示例，这似乎效率很低，例如： re := regexp.MustCompilei)jan`)
fmt.Println(re.ReplaceAllString("JAN-5,Feb,6 dec=900", "1&quo
浏览 14提问于2020-10-08得票数 1
回答已采纳
6回答
我有一个字符串列表，这些字符串已经按不区分大小写的顺序排序。我想在列表中插入一个新字符串。Moinuddin Quadri的回答比对整个列表进行排序要快，但由于在列表上的每个项目上运行lower()，它仍然非常慢。Stefan Pochmann的回答比对整个列表的排序快一个数量级。
Jared Goguen的回答是重复插入最快的。不过，它第一次在每个元素上运行lower()。
浏览 5提问于2017-01-27得票数 6
回答已采纳
2回答
我可以在执行Node.JS时强制安装npm-package而不是触发错误吗？
它将比对每个包运行npm i package更方便。
浏览 8提问于2016-11-23得票数 3
回答已采纳
我使用AntiXssEncoder.UrlEncode对查询字符串参数中的值进行编码。空格被编码为%20，但我想使用加号代替。有没有比对结果字符串调用.Replace("%20"，"+")更好的方法呢？
浏览 1提问于2016-07-01得票数 0
2回答
在节点缓存的最佳方法
、、、
在用于Node.js的google文档中，它只推荐，对于其他语言，它有本机memcache。有没有比对redis进行外部调用更好的缓存系统？
浏览 6提问于2017-08-31得票数 2
回答已采纳
9回答
固定纵横比视图
、、、
我认为对子类进行子类化比对GridView子类化更好
编辑:我认为这需要通过编程来完成，这没有问题。另外，我不想限制大小，只想限制宽高比。
浏览 3提问于2011-08-15得票数 50
回答已采纳
1回答
外部函数调用是否比对同一契约中的函数的内部调用花费更多的气体？如果是的话，是每次调用的统一费用，还是传递给它的参数的大小？
浏览 0提问于2018-04-30得票数 25
回答已采纳
有什么最简单的方法来修剪或填充一组biopython fastfa文件，直到它们都达到一定的长度，以便我可以将它们添加到多个序列比对中？类似于这里的答案，除了多个序列，没有文本文件，最后它都应该被合并到一个多序列比对中。最终目标是所有序列都是570个字符。我打算将所有这一切合并成一个门类树。
浏览 15提问于2019-12-01得票数 0
样式似乎是支持比对象样式更多功能的主要接口。const Button = styled.button``
在StyledComponent或Emotion.js中，css-string (模板)样式比对象样式更喜欢
浏览 3提问于2019-10-13得票数 2
回答已采纳
4回答
如何计算文本字符串的多序列比对
、、、、
我正在写一个程序，它必须计算一组字符串集的。我正在考虑用Python来做这件事，但如果更实用的话，我可以使用外部软件或其他语言。数据不是特别大，我没有很强的性能要求，我可以容忍近似(即。唯一的问题是字符串是常规字符串(即，UTF-8字符串(可能包含应被视为常规字符的换行符)；它们不是DNA序列或蛋白质序列。我可以找到大量的工具和信息，用于生物信息学中的常见情况，具有特定的复杂文件格式和许多我不需要的功能，但出人意料地很难找到用于简单字符串情况的软件、库或示例代码。我可能会重新实现解决这个
浏览 1提问于2011-04-28得票数 22
回答已采纳
我只是好奇是否有自动调整大小，有点像“缩放”，以防止更大的iPhones？(6 &6+)的大量空白。我的意思是：
请注意，较大的设备有大量的空白，最好是根据设备调整顶部的UIImageView和标签的大小，就像我使用高宽比对底部按钮所做的那样。有什么想法吗？
浏览 2提问于2014-10-22得票数 0
云服务器
ICP备案
云直播
对象存储
实时音视频
腾讯云开发者
