我正在努力学习生物信息学。我没有Linux、Ubuntu、bash、Perl、Python等方面的背景。我尝试使用以前在这台机器上安装和使用的几个程序,主要是bioperl模块。
似乎旧版本起作用了,但新版本却不行。具体来说,它是NCBI独立的一组程序。我可以使用blastall,但不能使用blastn、fastacmd或blastdbcmd,即使这些模块存在并显示为可执行文件。我得到的错误是no such file or dir。
如何卸载这组模块,然后重新安装它们?还是有其他原因让他们找不到呢?我确实试图从它们所在的目录中运行它们。