这里以Mysql为例。比如说我安装了Mysql，但是不知道文件都安装在哪些地方、放在哪些文件夹里，可以用下面的命令查看所有的文件路径。
关于光盘的挂载，之前我们已经讲过了，这里再深入介绍一点。之前我们挂载光驱使用的命令是: mount /dev/cdrom /media，我们使用ll /dev/cdrom 可以查看到，其实/dev/cdrom是一个软链接，它指向了同目录下的sr0，即/dev/s0，所以，真正的光驱设备文件是/dev/sr0。因此，我们也可以使用 mount /dev/sr0 /media实现光盘挂载。
忽略提示。先从第一行开始，一行行run，每run一行观察左下角窗口的输出信息，没有关键词 error 且返回一个大于号 > 再run下一行
Linux系统中，软件通常以源代码或者预编译包的形式提供。（1）软件源代码需要编译为二进制的机器代码才能够使用，安装比较耗时，不过您可以自行调节编译选项，决定需要的功能或组件，或者针对硬件平台作一些优化。（2）预编译的软件包，通常是由软件的发布者进行编译，您只要将软件拷贝到系统中就可以 了。考虑到预编译软件包的适用性，预编译软件包通常不会针对某种硬件平台优化。它所包含的功能和组件也是通用的组合。
Linux软件简介 Linux上几乎所有的软件都经过了GPL授权，因此几乎所有的软件都会提供源码。 而一个软件要在Linux上执行，必须是二进制文件，因此当我们拿到软件源码后，需要将它编译成二进制文件才能在Linux上运行。 软件编译过程 将源码编译成可供Linux运行的二进制文件一共需要两步： 1. 使用gcc编译器将源码编译成目标文件 2. 再次使用gcc编译器将目标文件链接成二进制文件 这过程看似简单，实则不然。一个软件的源代码往往被封装在多个源文件中，此外这些文件有错综复杂的依赖关系，
服务是一些特定的进程，自有服务就是系统开机后就自动运行的一些进程，一旦客户发出请求，这些进程就自动为他们提供服务，windows系统中，把这些自动运行的进程，称为"服务"。
比如我在Linux下安装了Mysql，但是现在我要卸载重装，提示卸载失败，有其它的服务或软件如php-mysql-5.1.6-3；mysql-server-5.0.22-2.1依赖于Mysql。我可以加–nopeds来卸载Mysql，但是依赖于Mysql的软件或服务是不是也要卸载？
编译(compilation , compile) ，利用编译程序从源语言编写的源程序产生目标程序的过程。编译就是把高级语言变成计算机可以识别的 2 进制语言，计算机只认识 1 和 0，编译程序把人们熟悉的语言换成 2 进制的。
随着计算机互联网的迅速发展，大多数学校已经实现教学的信息化，从传统的黑板教学方式转变为现阶段的多媒体教学，教学的资源，素材课件，甚至学生的作业也都实现数字化，为了实现这一功能，运用课程所学知识，构建一种基于 Linux 系统的教学资源服务器。教师可以把资源上传到服务器，供学生下载，可以把教学大纲、课件、资料都上传到服务器，上课时可以从服务器直接下载到教室电脑，学生也可以上传作业，供给老师批改，从而让教师教学更加便利。
上述我们介绍了Linux系统软件安装的四种形式，接下来我们就通过第一种(二进制发布包)形式来安装JDK。 JDK对应的二进制发布包，在课程资料中已经提供，如下：
本次教程主要是在Ubuntu 18.04下安装Tensorflow 2.0 GPU版本，大家之前在安装Tensorflow 2.0 GPU版本时，是否经常遇到CUDA、CUDNN安装麻烦的问题，下面呢，我介绍一种可以不用安装CUDA、CUDNN的方法（ps:这些安装自动在conda install tensorflow-gpu==2.0.0安装哦）！
由于最近想自己摸索一些linux下的东西，开始玩起了Linux系统，在安装软件的过程中有诸多的不解和困惑，现在终于搞明白了具体是怎么样的安装步骤和过程，先分享给你们同时也方便自己复习查阅。
where：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
习惯了Windows电脑下的所见即所得，找到程序或文件双击即可运行或打开；于是我们被惯得以为电脑会像人一样聪明，给他一个名字就可以运行程序或打开文件；于是在命令行下或程序里不断碰壁，为啥这个命令不运行了呢？
先说说为什么开了这个专栏，我一个做嵌入式的，怎么又搞上了结构设计了？？哈哈，一般有人看到博主的博客都觉得很蒙，有Linux的、硬件设计的、嵌入式软件的、QT的、Java基础的、Web开发的等。其实也没什么意外的，博客这么五花八门，跟博主的工作内容、工作性质、工作环境、工作职责都有关系，但是都没有离开物联网这个大的领域。
在上一期的脚踏实地学中，我们介绍了如何在自己的Windows系统中安装虚拟机和CentOS系统，这个操作相当于模拟了一台远程服务器（注意，这是模拟哦。土豪的你可以考虑购买另一台物理机作为服务器，或者购买云服务，如阿里云，腾讯云等
在管理和维护Linux系统时，有一些常用的命令可以帮助您进行系统初始化和配置。这些命令涵盖了各种任务，包括系统设置、用户管理、软件安装和网络配置等。
Liunx 中的软件安装 (详解 yum) --- 在win 下，安装软件 .exe 双击运行即可 Linux中，软件包封装类型多样 常见的软件包封装类型： - rpm 扩展名为 .rpm - deb 软件包 扩展名为 .deb - 源代码软件包 一般为 .tar.gz 或者 .tar.bz2 格式的压缩包，包含程序源代码 README - 提供安装程序的软件包（agent） - install.sh - setup - .bin RPM 软件包 --- 由 redhat
记得不久前跟大家大分享了一波个人在平时日常工作、学习、开发、写文字、做视频等过程中，一些好用高效的在线工具和网站，并且把自己的浏览器收藏夹书签离线文件都导出给大家了。
声明：个人觉得文章不错，所以转载过来分享以及自己收藏，只是原出处已经无法查明，只能附上我见文章的地址:
虽然使用源码编译安装可以具有提高速度个性化的定制等优点,但对于 Linux发行商来说,则不容易管理软件包,毕竟不是每个人都会进行源码编译的，如果能够将软件预先在相同的硬体与系统上面编译好在发布的话,不就能够让相同的 Linux 发行版,同时拥有相投的版本了吗,如果再加上简易的安装/移除/管理等机制的话,对于软体控管就会更加简单,大多数现代类 Unix 操作系统都提供了一个集中的软件包管理机制,以帮助用户搜索、安装和管理软件,而软件通常以「包」的形式存储在仓库「repository」中,对软件包的使用和管理被称为包管理,本章我们将介绍 RedHat 系统中为我们提供的解决方案,RPM和YUM包管理机制.
linux一般使用RPM或源码包进行安装软件，上一篇文章写了《Linux 软件安装管理之--源码包安装》。
包管理器是方便软件安装、卸载，解决软件依赖关系的重要工具，在不同发行版本的Linux系统中，有着不同的软件包管理器：
有一种说法： /usr/local目录类似于windows下的Program Files目录，可以存放用户安装的软件。
网上很多Linux下载软件的方法，看了很多帖子感觉Linux下载软件的方式有很多，每个人都有自己的习惯，对于一个新手来说及其不友好，有时候会看的很蒙。在这里做出总结。
今天想安装一个学英语的软件，下载下来的是一个rpm包，so，随手记录下这个rpm的命令集合吧。转摘自http://os.51cto.com/art/201001/177866.htm
Linux下软件安装的方式主要有源码安装,rpm安装,yum安装,而常用的安装包主要有以下三种： tar包：例如software-1.2.3-1.tar.gz。它是使用UNIX系统的打包工具tar打包的。 rpm包，如software-1.2.3-1.i386.rpm。它是Redhat Linux提供的一种包封装格式。(现在用的全称叫RPM Package Manager,以前叫Redhat Package Manager) dpkg包，如software-1.2.3-1.deb。它是Debain Lin
Linux软件管理程序 上一篇文章介绍了使用源码编译的方式安装Linux软件，虽然操作比较简单，但仍有如下不足之处： 1. 源码需要经过编译成二进制文件后才能供系统运行，而编译过程相对比较繁琐； 2. 软件的管理比较散乱，软件的更新、卸载没有统一的管理者。 针对源码安装的缺点，Linux上出现了软件管理程序，统一管理所有软件的安装、更新、卸载。它将当前系统中所安装的软件信息存储起来，这些信息可供用户查询，了解当前系统的软件安装情况，从而方便软件的更新与卸载。 RPM和DPKG 当前Linux上
Yum （全称为 Yellow dog Updater, Modified ）本质上 也是一个 软件包管理器。 特点: 基于 RPM 包管理，能够从指定的服务器 自动下载、 自动安装、 自动处理依赖性关系
R语言是比较常用的统计分析和绘图语言，拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库，是学习生物信息分析的必备语言之一。 Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一，支持纯R
下载官方镜像,使用官方镜像软件或者使用rufus,以dd的方式刻录,分区,主要分/,以及efi,其他分区可自定义,如 home ,opt,和交换分区,设置时区,键盘,用户,密码,等待安装
OGG 微服务架构(Microservices Architecture)起始于12.3版本，采用各种服务来管理，通过WEB接口来创建进程、启动进程以及管理底层进程等操作以及具备完善监控功能包括进程、线程等性能数据,以前非微服务架构称为经典架构(Classic Architecture)。
这是linux中一个非常重要命令，请大家一定要熟悉。它的功能是为某一个文件或目录在另外一个位置建立一个同步的链接，类似Windows下的超级链接。 这个命令最常用的参数是-s，具体用法是： sudo ln -s 源文件 目标文件
首先要说明的是，此处安装的VCS2016和Verdi_2016版本均不支持Linux 4.x以上的内核，否则即使安装成功后也可能无法使用，并且由于Linux发行版之间的差异，在其他系统上进行安装时会有各种各样麻烦的问题（libpng12库依赖问题、/usr/tmp文件夹及权限问题、bash和dash脚本执行问题等），故此处采用CentOS 7系统（省心）。不过该版本的VCS和Verdi也能在Ubuntu16.04系统（非Linux 4.x内核版本？）上安装，Ubuntu下该软件安装教程可以参考：
5.2 如何获取目标基因的转录因子（上）——biomart下载基因和motif位置信息
上面说的是打包.是指文件可以合并到一起.但不能压缩. 压缩有两种方式,一种是 gzip 一种是bzip2 (2念做two)
linux环境下的软件安装下载miniconda到服务器step 1：查看服务器位数uname -awget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #复制的链接# wget 是Linux用于从web上下载的命令，支持通过 HTTP、HTTPS、FTP协议下载step 2: 进入https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/
1.通过miniconda 清华镜像uname -a务必通过此代码查看服务器位数查找适合自己的版本，注意区分X86_64与ppc64le的区别
在生信分析人员如何系统入门R(2019更新版) 里面，我提到过Linux基本上几十年都没有怎么变动过基础知识的，哪怕你现在搜索到十几年前的Linux教学视频，也不会觉得尴尬。而且Linux属于IT工程师必备技能，IT的发展程度远超于我们，再加上各种马哥鸟叔，还有黑马训练营公开30天完整教学视频，按照道理我是没有必要在他们IT专业人士面前班门弄虎的， 毕竟他们随便拿几个偏门知识点就可以问倒我了！不过我们生信技能树的特色是主打生物信息学方向技能建设，而它作为一个典型的教交叉学科，想在此领域成为一个专业靠谱的生信工程师，我们实在是做不到在任何一个非核心知识点投入过多的时间和精力。
哈喽，大家好呀！这里是码农后端。今天来聊一聊Linux下的yum源及其配置相关的内容。简单来说，yum源就相当于一个管理软件的工具，可以想象成一个很大的仓库，里面存放着各种我们所需要的软件包及其依赖。
不同ubuntu版本的ISO File: https://cn.ubuntu.com/download 注意: windows虚拟机中的显卡是物理CPU模拟出来的，没有调用物理GPU，所以虚拟机装ubuntu是无法进行深度学习训练。
学习Docker，免不了的就是搭建环境了。搭建环境是一个复杂的工程，而且还是相当费时间的，不过话又说回来了，磨刀不误砍柴工嘛，光有理论是不够的，还需要自己动手实践才行。
添加环境的指令。-n是--name的意思，python代表软件是基于python开发，其他的不用管
工欲善其事必先利其器，这一节课主要以Windows系统为例，介绍了用Linux编程之前需要下载并安装的软件：Xshell，git，markdown，Winscp，幕布以及notepad++。介绍了如何下载并安装R及R的操作软件Rstudio，在Rstudio里进行了简单的命令演示以及如何安装并调用包，需要注意的是，所有软件推荐从官网进行下载，并且在安装的时候默认进行，基本不需要改动任何选项。对于Windows用户要把所有软件装在C盘，对于Mac用户则默认安装，安装软件时勿出现中文路径。
4) 配置 jdk 环境变量，打开/etc/profile 配置文件，将下面配置拷贝进去。export 命令用于将 shell 变量输出为环境变量 第一步: vi /etc/profile 第二步: 通过键盘上下键 将光标拉倒最后面 第三步: 然后输入 i, 将一下内容输入即可
今天初步了解了Linux环境，第一次进入了完全用命令行的世界，充满好奇的同时，也希望自己能尽快适应这个世界，当代码在黑色背景的屏幕上乱舞，啧啧，可以的！！！
命令运行监测 监测命令的运行时间 time command ct@ehbio:~$ time sleep 5 real 0m5.003s # 程序开始至结束的时间，包括其它进程占用的时间片和IO时间 user 0m0.001s # 进程真正执行占用CPU的时间, sys 0m0.002s # 进程在内核中调用所消耗的CPU时间 user+sys是进程实际的CPU时间。如果多线程执行，这个时间可能大于Real。如果IO是瓶颈，则real会大于user+sys (单线程)。 查看正
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh （这里用tab键的自动补全功能很方便） 一顿enter加yes就安装好了激活Minicondasource ~/.bashrc
说明：super binary 超级的 二进制 许多“指令”对应的可“执行程序文件”目录，该目录文件对应指令都是"root"用户可以执行的指令普通用户不能使用该目录里的命令：
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
云服务器
ICP备案
实时音视频
对象存储
即时通信 IM
