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沙龙
1
回答
从电话簿联系人
生成
.
vcf
文件
android
如何在Android中以
编程
方式从PhoneBook联系人
生成
.
vcf
文件?
浏览 2
提问于2011-02-09
得票数 0
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3
回答
如何对压缩文件使用awk
linux
、
shell
、
unix
、
gzip
、
bzip2
awk 'FNR==NR { array[$1,$2]=$8; next } ($1,$2) in array { print $0 ";" array[$1,$2] }' input1.
vcf
input2.
vcf
该命令在正常文件中工作正常。
浏览 2
提问于2012-10-30
得票数 27
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3
回答
Bash:使用第n行作为命令行的一部分
bash
、
shell
、
loops
、
unix
、
tail
/bin/bash
vcf
="/path/
vcf
/"do ${tool}fastQTL.1.165.
linux
--
vcf
${
vcf
}GT.
vcf</
浏览 0
提问于2018-02-23
得票数 2
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4
回答
如何在许多文件上运行python脚本以获得许多输出文件?
python
、
linux
、
bash
、
shell
、
python-2.7
我是
编程
新手,我写了一个脚本从
vcf
文件中提取文本。我正在使用
Linux
虚拟机并运行Ubuntu。我已经通过命令行运行了这个脚本,方法是将我的目录更改为包含
vcf
文件的文件,然后输入python script.py。我的脚本知道要处理哪个文件,因为脚本的开头是:outputfile = open("outputfile.txt", "w但是,我有许多输入文件
浏览 10
提问于2015-12-02
得票数 1
回答已采纳
1
回答
无法通过CPAN安装perl包` via‘
perl
、
cpan
、
perlbrew
、
vcf-variant-call-format
我正在尝试安装perlbrew安装的perl包
VCF
,它通过
vcf
-validator访问。vcftools-vcftools-ea875e2/src/perl /home/703404669/perl5/perlbrew/perls/perl-5.30.0/lib/site_perl/5.30.0/x86_64-
linux
perl-5.30.0/lib/site_perl/5.30.0
浏览 6
提问于2019-09-23
得票数 0
回答已采纳
3
回答
文件编辑-命令行unix
linux
、
file
、
unix
、
sed
我使用的命令是:但是它会在每行的开头添加一个chr,并在每行的末尾添加一个>。我不希望这两件事发生。
浏览 0
提问于2013-04-03
得票数 0
回答已采纳
1
回答
由于输入无效,无法使用bcftools对
VCF
进行排序。
sorting
、
vcf-variant-call-format
、
samtools
、
bcftools
# code used to bgzip and tabixtabix -p
vcf
fn.
vcf
.gz Error encountered while parsing the input我尝试使用
linux
然而,当我运行下面的代码时,fout.
vcf</
浏览 19
提问于2020-12-08
得票数 1
1
回答
如何知道unix命令是否成功执行
linux
、
shell
、
unix
、
vcftools
、
bcftools
我尝试的命令如下所示 bcftools merge --force-samples -O z -o final.
vcf
.gz ethn.
vcf
.gz 然而,该命令正在工作,但需要很长时间才能合并。然而,当我醒来时,我看到系统由于电源耗尽而关闭 如何知道我在Unix/
Linux
终端上的最后一条命令是否成功? 上面显示的命令只是一个示例。虽然我确实看到了final.
vcf
.gz,但我不能说命令是成功的,因为一旦命令开始运行,我就会看到这个文件正在
生成
。所以,我不能依赖它 有什么需要帮忙的吗?
浏览 16
提问于2020-09-10
得票数 0
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1
回答
如何对Windows中的重命名文件进行批处理,并将文件名中的第一个单词与第二个字交换?
regex
、
file
、
rename
我有多个业务联系文件(.
vcf
),如下所示:Smith John.
vcf
如何大容量重命名所有文件并用第二个文件切换文件名中第一个单词的顺序?例如:John Smith.
vcf
我目前正在使用Windows,但是如果它能使它更容易完成的话,可以很容易地切换到OSX或
Linux
发行版。
浏览 4
提问于2015-08-08
得票数 0
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1
回答
以
编程
方式将
vcf
保存到Android中的联系人,而无需打开联系人应用程序
android
、
android-contacts
、
vcf-vcard
我尝试以
编程
方式将
VCF
(我有文件和字符串)保存到Android联系人中,而不必打开联系人应用程序(或任何第三方应用程序)。然而,我能找到的所有示例都使用了一个意图来启动带有
VCF
信息的联系人应用程序。除了手动解析
VCF
数据并将其添加到原始联系人之外,是否有任何方法可以直接将数据从
VCF
推送到ContactsProvider中?
浏览 3
提问于2015-12-03
得票数 1
2
回答
如何以
编程
方式解析联系人.
vcf
文件?
android
是否有任何方法以
编程
方式解析联系人
VCF
文件? 我能够从联系人创建.
vcf
,但无法在代码中解析。
浏览 24
提问于2014-11-06
得票数 0
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1
回答
生成
.php.
vcf
文件而不是.
vcf
文件
php
、
vcf-vcard
我在我的PHP网站上有一个功能,用户可以为员工下载vcard文件,但是
生成
的文件是.php.
vcf
的,在mobile.How上不支持,我可以将文件格式更改为.
vcf
,
生成
vcf
的简化PHP代码如下所示。'John', 'Smith');echo $generated_text; vcard正在下载,问题出在上面提到的扩展名,即
生成
的是'
浏览 6
提问于2021-09-13
得票数 1
1
回答
与命令中的引号并行
ubuntu
、
terminal
、
bioinformatics
、
gnu-parallel
我在
linux
终端中的原始输入是bcftools filter-e 'TYPE="snp"' input2.
vcf
-O v -o output2.filter.
vcf
bcftools filter -e 'TYPE="snp"' inp
浏览 0
提问于2019-05-17
得票数 1
1
回答
如何在bash中从python脚本的一组不同输入文件中输出多个文件
python
、
bash
、
iteration
、
file-io
、
multipleoutputs
我已经有了我的python脚本,通过向它传递5个不同的inputfile来
生成
我想要的输出文件。每个输入文件都位于不同的文件夹中,每个文件夹中都有更多的文件,它们都以"chr“开头,并以扩展名".
vcf
.gz”结束。因此,我执行的
生成
一个输出的命令是: python myscript.py /folder1/chrX.
vcf
.gz /folder2/chrX.
vcf
.gz /folder3/chrX.
vcf
.
浏览 0
提问于2013-12-01
得票数 1
回答已采纳
1
回答
从R循环中列表中的S4对象访问插槽
r
、
vcf-variant-call-format
我正在尝试从R循环中列表中的一个对象访问一个特定的槽: mysamples<-'a_
vcf
', 'b_
vcf
', 'c_
vcf
' for(i in mysamples){a<-
vcf
$i@rowRanges trying to get slot "rowRanges"from
浏览 27
提问于2020-04-24
得票数 0
回答已采纳
2
回答
迭代bash命令
linux
、
bash
、
loops
我需要使用
linux
命令处理我的数据(关于400+文件)。我正在设法将相同的命令迭代到我的所有文件。这是我的bash命令我试过这样做,但没有成功。for f in *.
vcf
; do echo cat *.
vcf</em
浏览 7
提问于2015-11-05
得票数 1
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1
回答
当试图为工作流创建目录时,ChildIOException [Snakemake]
snakemake
/scratch/groups/xxx/xxx/neand_sQTL/filtered_
vcf
/merged_filtered_chr1.
vcf
.gzrule mkdir_
vcf
: directory("gtex_
vcf
/"), direc
浏览 0
提问于2019-09-06
得票数 3
回答已采纳
1
回答
将所有联系人导出到
VCF
(vcard)文件Windows phone
c#
、
windows-phone
、
vcf-vcard
我想要将电话簿联系人导出到单个
VCF
文件。我不熟悉
VCF
文件。谢谢
浏览 0
提问于2013-08-23
得票数 2
1
回答
vcf
文件的第一个基因型在输出中作为通配符
python
、
snakemake
、
gatk
在第二条规则中,我想从包含bob、clara和tim的
vcf
文件中选择,只有roder中字典的第一个基因型(即bob)才能在第二个规则bob.dn.
vcf
中获得输出。rule somerulename: lambda w: d[w.family]
vcf
a single
vcf
file with bob, clara and tim
浏览 9
提问于2022-02-03
得票数 0
回答已采纳
1
回答
我可以在
vcf
.gz文件上使用tabix吗?
indexing
、
merge
、
gzip
、
vcf-vcard
作为初学者,我可能有一个愚蠢的问题,但我有几个不同个人的
VCF
文件被压缩( .
vcf
.gz)。我希望通过使用
vcf
-merge将这些文件合并到一个包含所有个人的
VCF
文件中。有谁知道我是否可以从一个.
vcf
.gz文件转到一个索引和bgzip文件,而不首先解压缩它(它需要大量的存储,文件非常大)。 谢谢!
浏览 0
提问于2016-11-24
得票数 1
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