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用Python操控Word

4月底,我带着自己水的一篇文章,从深圳奔赴美帝西雅图参加了一个制药行业软件用户组2018年年会(PharmaSUG 2018)。听了一些报告,收获不少。在众多报告中,有一篇题目为Why SAS Programmers Should Learn Python Too的报告有点意思。不过在我看来,文章中的例子并没有很好地体现出Python的强大,因为那几个例子用Linux Shell脚本实现也很简单。不可否认,如果你想选择一种语言来入门编程,那么Python绝对是首选!但是对于SAS程序猿/媛来说,我觉得现阶段没有太多必要去学Python,因为行业的原因,Python对SAS程序猿/媛日常的编程工作几乎没有什么用。除非你和我一样,喜欢折腾代码,或者你想转行业做深度码农,那Python是必须掌握的语言,因为Python有各种强大的库。下面就让我们来感受下python-docx库的强大之处吧!

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生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)

在生信分析人员如何系统入门R(2019更新版) 里面,我提到过Linux基本上几十年都没有怎么变动过基础知识的,哪怕你现在搜索到十几年前的Linux教学视频,也不会觉得尴尬。而且Linux属于IT工程师必备技能,IT的发展程度远超于我们,再加上各种马哥鸟叔,还有黑马训练营公开30天完整教学视频,按照道理我是没有必要在他们IT专业人士面前班门弄虎的, 毕竟他们随便拿几个偏门知识点就可以问倒我了!不过我们生信技能树的特色是主打生物信息学方向技能建设,而它作为一个典型的教交叉学科,想在此领域成为一个专业靠谱的生信工程师,我们实在是做不到在任何一个非核心知识点投入过多的时间和精力。

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使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

在日常的计算化学研究中,我们经常需要将计算得到的分子或者固体/晶体体系简谐振动通过动画的方式直观地呈现在屏幕上,从而可以清楚地知道在某个特定的振动模式下是哪些原子在运动。一方面,这种振动的可视化可以在实验测量得到了振动光谱(红外、拉曼)的情况下帮助我们借助理论计算对振动谱图进行指认;另一方面,在反应机理研究的过渡态计算中,通过对虚频振动的观察,我们可以很快知道计算得到的过渡态结构是否能把反应物、产物的结构串起来。 以最常用的量化计算程序高斯为例,与之配套使用的GaussView软件可以很轻松地对振动分析 (freq) 计算结果进行可视化。类似地,Q-Chem也有一个配套的IQmol程序(免费、开源)可以呈现Q-Chem的振动分析结果。此外,一些第三方的程序如Avogadro、MOLDEN等也可以对高斯程序的振动分析结果进行可视化。计算化学公社的社长sob老师曾经写过一个可以将ORCA的振动分析结果转换为高斯输出格式的工具(http://sobereva.com/498)以及一个可以在VMD程序中显示振动模式静态矢量的工具(http://sobereva.com/567)。

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领券