NAMELIST(有名列表)是一种特殊的I/O方法,它将一组变量和数值封装在一起,进行输入/输出操作。其声明形式如下:
公众号的安装教程里常说的“Intel全家桶”指的是Intel Parallel Studio XE,里面集成了C/C++/Fortran语言的编译器(分别是icc、icpc、ifort)、MKL数学库及各种高效调试工具,甚至还有Intel MPI,可以说是编译量化软件最常用的一套“装备”。然而从2021年开始Intel不再提供旧版Parallel Studio XE下载页面,而是改成了(或称升级成了)oneAPI,又可具体细分为oneAPI Base Toolkit和oneAPI HPC Toolkit等等。
Intel oneAPI 是一种统一的跨架构的的编程模型,提供了CPU、GPU、FPGA、专用加速器的产品。
我们使用简单的测试用例来对各种高级编程语言进行比较。我们是从新手程序员的角度来实现测试用例,假设这个新手程序员不熟悉语言中可用的优化技术。我们的目的是突出每一种语言的优缺点,而不是宣称一种语言比其他语言更优越。计时结果以秒为单位,精确到四位数,任何小于 0.0001 的值将被视为 0 秒。
在编译一个大型项目的时候,往往有很多目标文件、库文件、头文件以及最终的可执行文件。不同的文件之间存在依赖关系(dependency)。比如当我们使用下面命令编译时: $gcc -c -o test.o
在Linux下用高斯做计算的过程中,大家经常会使用一些grep命令从log文件中搜索某个字段,查看计算进度。这其中最常用的恐怕要属以下两个:
ORCA官方于2021年7月1日发布了5.0版本,前期从ORCA论坛上来看,有不少同行都非常期待。除了昨天的线上发布会,今天还会有一个线上的论坛,感兴趣的朋友可以去官方论坛查看相关帖子:
R是一个常用于统计学问题和画图的免费软件(https://www.r-project.org/)。在线安装十分简单,本文主要介绍离线安装,且让R使用Intel编译器编译、调用Intel MKL库,以期提高计算速度。笔者测试安装和使用R时,所用Linux系统为CentOS 7,R版本为R-3.6.1,Intel编译器(含MKL)2018和2019都用过(分别在两台机器上)。
从 Anaconda 官文网站 https://www.anaconda.com/download 下载操作系统对就的安装文件,选择 Python 3.7 版本。
xmake 是一个基于 Lua 的轻量级跨平台构建工具,使用 xmake.lua 维护项目构建,相比 makefile/CMakeLists.txt,配置语法更加简洁直观,对新手非常友好,短时间内就能快速入门,能够让用户把更多的精力集中在实际的项目开发上。
过冷水最近一段时间接触了一个非常牛X的程序包——parsec,花了九牛二虎之力才弄懂它,它能干什么呢?
在国外的一个abaqus论坛看到了本文所要探讨的关联方法,在亲自操作成功之后觉得更简单。故而将其贴出,供参考。 首先要强调的依旧是要注意版本匹配。一般来说,要选择与Abaqus版本发行时间相近的VS以及IVF发行版本。比如Abaqus2018匹配VS2012就会出错。
2019年10月1日前后,Grimme课题组将GFN-xTB源代码推到了Github上面。这样友好的举动,无疑增加了用户使用GFN-xTB的热情。GFN-xTB源代码能成为一个很好的教材,我们也可以把它整合到一些已有的程序中,它不再是黑箱。GFN-xTB是近一年以来的热门计算软件,在网上可以找到很多教程,这里不予赘述。一句话概括,GFN-xTB能很快、比精准地完成结构优化、频率计算。本文着重于讲怎么从源代码编译GFN-xTB,以及使用它的API。
GAMESS是一款历史悠久、免费开源的量子化学软件,现今最流行的分支是GAMESS-US(下文简称GAMESS),该程序的最新版可在量化大佬Mark Gordon课题组主页
Dalton是一款开源免费的量子化学程序,主要特色是支持一大堆性质的计算,例如DFT下的二次响应计算(常规TDDFT计算仅是线性相应),MCSCF波函数下的核磁NMR计算等等,以及各类激发态方法。当然,也有一些高精度单参考方法(如MP2-R12和CCSD-R12等),但较少用到。其PDF手册在
本文适用于OpenMolcas-v22.02和v22.06,对以后的版本可能适用也可能不适用。旧版OpenMolcas、与QCMaquis联用版本的安装请见文末链接。安装前我们需要确保有必要的编译器和库:
Fortran中调用C语言的函数这部分内容在彭国伦的教材中是有的,但那是基于Fortran 90标准,写法稍微有些烦琐。在Fortran 2003标准中有较为简洁的写法,本文通过几个简单的例子展示一下如何实现在Fortran中调C函数。
By HKL, on Saturday 2022-10-15 08:48, tagged: 🏷️Linux 🏷️Operating
本公众号之前发过几篇多组态(multi-configurational)方法的介绍:
CFOUR程序的全称为Coupled-Cluster techniques for Computational Chemistry,是一款专注于高精度量子化学计算的程序。从名字可以看出,其专长为耦合簇方法,支持在CC级别下做单点、几何结构优化(如CCSD(T)级别)、激发态计算(如EOM-CCSDT)、性质计算(如CCSD(T)级别的NMR计算)。其官方网站为
Wannier函数是周期性体系里和分子轨道对应的概念。很多固体物理教材都详细介绍了Wannier函数,如南京大学教材《固体理论》[1]的第八章。Wannier函数定义为Bloch函数的一个傅立叶变换:
本公众号之前发过《离线编译OpenMolcas+QCMaquis》一文,成功安装后可进行DMRG-NEVPT2和DMRG-PDFT计算。但其中需要编译QCMaquis、 HDF5、GSL和Boost库,过程颇为繁琐。笔者发现有的小伙伴不需要做DMRG计算,只想用OpenMolcas中最核心、最特色的功能——CASSCF、CASPT2、ic-MRCISD和MC-PDFT方法,则安装过程可以大大简化。
convert_mpas可以将MPAS模式输出结果插值到等经纬度网格,其中整数变量使用最近邻方案映射到目标网格,浮点数(单精度或双精度)采用重心插值(barycentric interpolation)。
高小四,英文名G2C4,是Gaussian通过external关键词调用CFOUR的接口程序,进而可以在Gaussian中实现高级别post-HF方法的能量、梯度、频率计算,同时也避免了CFOUR结构优化必须用Z矩阵坐标、结构升级异常等问题。由于MRCC程序与CFOUR是无缝对接的,因此也可以通过CFOUR实现MRCC的各种更高理论级别的计算。 程序主页
它使用 xmake.lua 维护项目构建,相比 makefile/CMakeLists.txt,配置语法更加简洁直观,对新手非常友好,短时间内就能快速入门,能够让用户把更多的精力集中在实际的项目开发上。
网上说要分c为主程序和fortran为主程序两种情况讨论,其实我觉得不用,只要你了解生成可执行文件的机制。这个机制就是:不论是单一语言模块之间的 链接还是不同语言之间的混合链接,本质目的都是要链接器能找到定义于其他模块中的符号,如果全部找到,则链接成功,生成可执行的二进制文件。 下面的内容比较基础,看烦了就跳过。 比如简单的一个c程序:
文 | 糖豆 图 | 来源网络 糖豆贴心提醒,本文阅读时间6分钟,文末有秘密! Linux cat命令 cat 命令用于连接文件并打印到标准输出设备上。 Linux chattr命令 Linux chattr命令用于改变文件属性。 Linux chgrp命令 Linux chgrp命令用于变更文件或目录的所属群组。 在UNIX系统家族里,文件或目录权限的掌控以拥有者及所属群组来管理。您可以使用chgrp指令去变更文件与目录的所属群组,设置方式采用群组名称或群组识别码皆可。 Linux chmo
在许多UNIX说明文件里,都有RLF控制字符。当我们运用shell特殊字符">"和">>",把说明文件的内容输出成纯文本文件时,控制字符会变成乱码,col指令则能有效滤除这些控制字符。
文 | 豌豆 来源 | 菜鸟教程 豌豆贴心提醒,本文阅读时间5分钟,文末有秘密! Linux col命令 Linux col命令用于过滤控制字符。 在许多UNIX说明文件里,都有RLF控制字符
Linux对我们的生活有着很大的影响。对于新手来说,头一次入手Linux只会让你觉得不适。因为在Linux上,你通常应该使用终端命令,而不是只要点击启动器图像(就像你在Windows上操作那样)。不过别担心,本文介绍的这10个基本的Linux命令和重要命令会帮助你尽快入门。
在计算机操作系统的发展史上,Unix是一个重要的里程碑。Unix操作系统最早由贝尔实验室于1969年开发,并在1971年发布。Unix操作系统以其简洁、灵活和可扩展的设计理念而受到广泛的赞誉。它基于分时操作系统的思想,允许多个用户同时访问计算机系统,并提供了许多功能强大的工具和命令行界面。Unix的设计被广泛采用,并成为后来操作系统的重要影响因素。
在Linux操作系统中,路径之间的层级关系,用/表示:/tmp/hello.txt
https://www.cnblogs.com/davis12/p/14548367.html
本文介绍了Linux文本编辑器vim的使用方法,包括命令模式、插入模式和编辑模式,以及插入命令、定位命令、删除命令、复制和剪切命令、替换和取消命令、搜索和搜索替换命令、保存和退出命令等。同时还介绍了vim的高级操作和常用命令。
从Linux服务器上传或者下载文件到本地除了使用FTP外,还可以通过Linux命令来实现,Linux服务器与本地电脑之间传输文件的命令及使用方法:
在执行任务时,我们都需要快捷方式。快捷键能帮助我们快速完成任务。Linux 自带的这些命令只有一到两个单词,使用这些命令,你可以在短时间内完成多项操作。作为初学者,你必须了解这些基本的 Linux 命令来完成操作。
回答: Linux是基于Linux内核的操作系统。它是一个开源操作系统,可以在不同的硬件平台上运行。它为用户提供了免费的低成本操作系统。这是一个用户友好的环境,他们可以在其中轻松修改和创建源代码的变体。
随着现在互联网时代的爆发,越来越多的企业开始需要Linux工程师,相对应的Linux工程师的薪资待遇也越来高,那么Linux到底是什么?如何快速入门呢?今天我就为大家讲一讲如何快速入门学习Linux。
文章目录 一、报错信息 二、解决方案 一、报错信息 ---- 首先 , 更新 pip ; 执行如下命令 : /usr/local/bin/python3 -m pip install --upgrade pip 执行结果 : octopus-2:~ octopus$ /usr/local/bin/python3 -m pip install --upgrade pip Requirement already satisfied: pip in /Library/Frameworks/Python.fram
下面介绍在 Linux 操作系统中重启和关闭相关的命令:shutdown、reboot、init、halt、poweroff、systemctl,你可以根据需要来选择适合的 Linux 命令关闭或重新启动系统。其中 shutdown、halt、poweroff、reboot 命令是用来停机、重启或切断电源, systemctl 命令管理 systemd,是 Linux 系统和服务器的管理程序。
第一章 linux之帮助命令 第二章 linux命令行快捷键 第三章 linux之防火墙 第四章 linux之服务开机自启 第五章 linux之关机与重启 第六章 linux之环境变量 第七章 linux之目录操作命令 第八章 linux之目录结构 第九章 linux之使用ssh连接被拒 第十章 linux之搜索命令 第十一章 linux之统计命令 第十二章 linux之网络命令 第十三章 linux之文件操作命令 第十四章 linux之文件系统命令 第十五章 linux之压缩解压缩 第十六章 linux之用户管理 第十七章 linux之权限管理命令 第十八章 linux之scp命令文件传输
2018年里,Linux运维的职位数量和平均薪资水平仍然持续了去年的强劲增幅,比很多开发岗位涨的都快。从研究机构的数据来看,Linux职位数量和工资水平涨幅均在IT行业的前五之列,比去年的表现还要好一点。
linux不同于Windows,它是一种开放源码的电脑操作系统。现在全世界存在着很多不同的Linux 版本,它们的共同点是都使用了Linux 的系统内核。Linux 可以安装在各种的计算机当中,平板手机和台式计算机都可以安装Linux 系统。linux命令行工具是可以使用在Linux 系统当中的命令行。命令行更加直观而富有逻辑,便于对电脑系统的操作。
我们在谈论Linux命令时,其实是在谈论Linux系统本身。就这么区区10个基本的Linux命令不会让你成为天才或Linux专家。对于老手来说这都是再简单再基础不过的几个命令,但它会帮助Linux新手使用这些Linux基本命令或者说Linux常用命令来处理日常的基本任务。
今天是2018年的第一天,在迎来新年喜悦的同时,又即将开始新的一年的奋斗。不知道文章面前的你是怎样计划你的Linux学习的。如今有很多关于Linux的书籍,博客。大多数都会比较“粗暴“的将一大堆的命令塞给读者,从而使很多Linux初学者望而却步,未入其门就路过了。 下面给大家找了一下一个资深Linux用户关于学习Linux的一些建议: 随着Linux应用的扩展许多朋友开始接触Linux,根据学习Windwos的经验往往有一些茫然的感觉:不知从何处开始学起。作为一个 Linux系统管理员,我看了许多有关L
Linux系统内核、发行版本有很多,那么如何查看当前Linux系统的内核信息、Linux系统发行版本等信息呢?Linux百科网分享查询Linux系统详细信息的方法:
在不同操作系统之间传输文件是日常工作中常见的任务之一。scp(Secure Copy)是一种安全的文件传输协议,可以在不同的操作系统之间进行文件复制,并保证数据的安全性。本文将介绍如何使用scp命令在Windows系统和Linux系统之间相互传输文件。
一、应该需要比较熟练的掌握 Linux 系统中必须的命令 当你把学习Linux比作是森林的话,那Linux 命令就是维护这片地域的树木。所谓的命令,就是我们在输入命令行时的一串字符。shell 主要是负责理解并执行这些字符串。shell 命令可以分为以下几种类别: 1)可执行文件 2)shell 内建函数 3)别名(alias)。 当有人问:现在有许多的命令功能都是可以通过图形化界面而实现,那么学习 Linux 命令还有什么价值呢在 Unix 发展的过程中,用户对 Unix 的操作都是通过命令实现的。其发展
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