编写一个简单程序用pdb试调一下,代码如下 #!...)) minnum = getminnum(numlist) print(u'列表中最小值为:{}'.format(minnum)) 这是一个输入数字添加到列表,挑选最大最小值的程序 linux...里python程序调试pdb命令如下 python -m pdb linux_pdb.py ?...pdb的所有命令 list : 显示程序,可以带参数,比如显示第五行 list 5 break : 添加断点,比如在第5行添加断点break 5,在getlist函数添加断点break run : 开始运行程序...step : 单步运行,进入函数内部 next : 单步运行,不进入函数内部 print : 显示参数 quit : 退出pdb
PDB 文件 ---- 什么是 PDB 文件 PDB (Program Data Base) 即程序的基本数据,是 VS 编译链接时生成的文件,每个程序集(EXE 或 DLL)都有一个与之对应的 PDB...PDB 文件中都包含哪些内容 通过上一小节的例子,大家对 PDB 文件有了大概的了解,知道其中存储了 代码行号 等信息。...PDB 的唯一性和重要性 每个程序集(PE 文件,EXE 或 DLL)都会有一个与之对应的 PDB 文件,并且每次编译生成的 PE\PDB 文件都不同。...编译器会生成一个 GUID 存储在 PE\PDB 文件中,以此来映射 PE 文件和 PDB 文件。...由于 PDB 文件具有唯一性,因此 PDB 文件和 PE 文件同等重要,一旦丢失就不能通过重新编译来获取。
C++编译生成的pdb文件就是符号表。 这些符号表,程序运行的时候没有用。...但调试的时候有用,主要记录如下东西: 全局变量 局部变量 函数名及其实体指针地址 帧指针表 源代码行数 使用pdb文件进行调试,要和当前运行的程序一致。
pdb https://docs.python.org/zh-cn/3.7/library/pdb.html#module-pdb 使用方式 1、在命令行下直接运行调试 python -m pdb...2、在需要被调试的代码中添加import pdb、pdb.set_trace()再运行代码进行调试 # test.py def func(): print('enter func()') a...= 1 b = 2 import pdb pdb.set_trace() # 运行到此处启动pdb func() c = 3 print(a + b + c) ?...执行下一条语句,如果是函数,则会进入函数内,显示–call–,执行函数内第一条语句,执行完函数内语句后跳出显示–return– b 列出当前所有断点 b lineno 在某行添加断点 cl 清除断点 q 退出调试pdb
PDB文件的介绍 PDB(Program Data Base),意即程序的基本数据,是VS编译链接时生成的文件。...所以完全通过PDB文件调试,意义与作用均没有多大。如果要让其他人能够调试自已的代码,PDB文件和源码都应该提供,只提供PDB文件的意义不大。如果确实有类似的需求,可以保留相应生成的PDB文件。...微软的很多库默认是不提供PDB文件的,但是近来微软逐渐开放了一些库的PDB文件。 VS搜索PDB文件的路径顺序 MSDN中详细的讲述: 1....静态库的PDB文件 静态库也有自已的PDB文件,只不过其名字是VC80.PDB/VC100.PDB这样的名字。静态库的PDB文件会在链接时合并到EXE/DLL的PDB文件中去。...如果生成的静态库lib里有记录相应的PDB文件,却又没有相应的PDB文件,那么静态库链接成EXE/DLL时就会报警告找不到静态库对应的PDB文件。
关于pdb文件 当程序在 VS 上编译时,程序所依赖的所有动态链接库(dll 文件)也会被编译,编译过程中每个 dll 都会产生一个pdb文件,又称为“符号文件”,是一个存储数据的信息文件,其包含 dll...当使用VS 调试程序时,会默认加载你的程序以及程序依赖的dll库产生的所有pdb文件,但是结果往往是VS自己找不到依赖库的pdb文件,于是就提示给你“无法查找或打开pdb文件“。
PDB可以经由网络免费访问, 是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威,各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果提交给PDB。...PDB数据库存储结构数 据的文件是PDB文件,每一个蛋白质或核酸都对应着一个编号,即PDBID, 文件的扩展名为.pdb。...PDB文件可以由各种3D结构显示软件打开,比如pymol,Swiss-PDB viewer,VMD等。PDB文件里面的信息是有严格的格式的。...PDB数据库存储结构数 据的文件是PDB文件,每一个蛋白质或核酸都对应着一个编号,即PDBID, 文件的扩展名为.pdb。...参考资料 PDB文件的格式 PDB文件详解 有关原子坐标文件 WOLFRAM 语言 IMPORT/EXPORT 格式 PDB 教你读懂蛋白的PDB文件 PDB 文件格式
Python提供了pdb命令来对代码进行调试,下面是pdb的使用方法。...(2)() -> b = 0 (Pdb) n > c:\users\hongze\test.py(3)() -> print(1/0) (Pdb) p a...-> print(1/0) (Pdb) n --Return-- > c:\users\hongze\test.py(3)()->None -> print(1/0) (Pdb) q...import pdb,在需要的地方加上pdb.set_trace(),就相当于设置了一个断点,调试将从断点处执行,上面的命令依然可用,输入c继续执行。...import pdb a = 1 b = 0 pdb.set_trace() print(1/0) #pdb 断点调试实例 C:\Users\hongze>python test.py > c:\
import os from math import sqrt import numpy import torch from Bio.PDB import PDBParser from torch.utils.data...P450Dataset(Dataset): def __init__(self, testp450, transform=None, target_transform=None): # 处理pdb...testp450' arr = [] max_num = 0 index = 0 self.data = [] # 遍历文件夹下的pdb
In a nutshell here’s how the PDB looks like - Stream No....Contents Short Description 1 Pdb (header) Version information, and information to connect this PDB to...https://github.com/microsoft/microsoft-pdb #pragma once #define _CRT_SECURE_NO_WARNINGS #include <windows.h...{ public: // // Default constructor. // PDB(); // // Instantiates PDB class with particular...PDB file. // PDB( IN const CHAR* Path ); // // Destructor. // ~PDB(); // //
脚本 -- 步骤1、启动pdb到受限模式(在pdb里边操作) alter session set container=pdblhr3; alter pluggable database pdblhr3...pluggable database pdblhr3 open restricted; -- 或: shutdown immediate startup open restrict -- 步骤2、进入pdb...里边对pdb进行重命名 alter session set container=pdblhr3; select * from global_name; alter pluggable database...pdblhr3 rename global_name to pdbprod3; -- 步骤3、正常关闭和启动pdb alter pluggable database close immediate;...to JDEPROD; alter pluggable database close immediate; alter pluggable database open; 注意事项 1、必须进入目标PDB
)() -> s = '0' 以参数-m pdb启动后,pdb定位到下一步要执行的代码-> s = '0'。.../sicp/err.py(4)() -> print 10 / n 任何时候都可以输入命令p 变量名来查看变量: (Pdb) p s '0' (Pdb) p n 0 输入命令q结束调试,...(4)() -> print 10 / n (Pdb) q Try 这种通过pdb在命令行调试的方法理论上是万能的,但实在是太麻烦 pdb.set_trace() 这个方法也是用pdb,...但是不需要单步执行,我们只需要import pdb,然后,在可能出错的地方放一个pdb.set_trace(),就可以设置一个断点: # err.py import pdb s = '0' n = int...(s) pdb.set_trace() # 运行到这里会自动暂停 print10 / n 运行代码,程序会自动在pdb.set_trace()暂停并进入pdb调试环境,可以用命令p查看变量,或者用命令c
ncbi-blast-2.9.0+-x64-win64.tar.gz 对安装包进行解压: [wangh@master Softbacks]$ tar -zxvf ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz...-2.9.0+]$ source ~/.bashrc #刷新你的环境配置文件,使得系统识别你刚加入的环境变量(也可以关闭当前终端再次打开,系统自动刷新环境配置文件) blastp 的用法: 数据库从PDB...中下载: ftp://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/derived_data/pdb_seqres.txt 用cd-hit处理去冗余(解压后加变量后就能用) $: cd-hit -i /path.../pdb_seqres_simp.fasta -o PDB_simp.fasta -c 0.9 格式化数据库: $: makeblastdb –in PDB_simp.fasta –dbtype prot...–out PDB -in:待格式化处理的fasta文件(一般是从PDB/NCBI里下载所有的相关或者整个库中的序列); -dbtype: 数据库类型,prot或者nucl; -out: 输出的数据库名
实例: 直接用它来处理结构文件 #读取结构文件 #(1)读取mmcif文件 #创建一个mmcif解析器 from Bio.PDB.MMCIFParser import MMCIFParser parser...= MMCIFParser() #导入mmcif结构文件 structure = parser.get_structure('1fat', '1fat.cif') #(2)读取pdb格式文件 #创建一个...pdb解析器 from Bio.PDB.PDBParser import PDBParser p = PDBParser() #导入pdb文件 structure = p.get_structure('...1d3z','1D3Z.pdb') #这样就拿到了蛋白结构 #看下结构的表示 #一个 Structure 对象的整体布局遵循称为SMCRA(Structure/Model/Chain/Residue
pdb模块是python自带一个调试模块,在没有pycharm的iIDE环境情况下,最佳调试方式就是使用pdb模块调试。...一、介绍pdb调试环境的常用命令命令备注ll 或 l查看全部代码n执行下一行代码c执行全部代码b 行数某行打断点,程序运行到断点处会停下clear清除断点s也是一行一行执行代码,但可以进入函数内部执行s...函数名直接跳到具体某个函数内部执行r快速执行到函数最后一行p打印某一个变量的值a打印所有形参的数值q退出调试环境二、pdb调试使用1、一个py文件的调试执行py文件并进入调试 python -m pdb...2、一个项目的调试一个项目代码庞大,像上面调试就显得吃力,不过,我们可以在代码植入pdb的方法,认为容易出错的地方,进入pdb调试 导入pdb模块 import pdb pdb.set_trace()...官方文档:https://docs.python.org/3.6/library/pdb.html
一、调试模块 >>> import pdb >>> import mymodule >>> pdb.run('mymodule.test()') >(0)?...() (Pdb) continue >(1)?() (Pdb) continue NameError: 'spam' >(1)?...() (Pdb) 二、调试脚本 python3 -m pdb myscript.py 三、代码中打堆栈(3.7版本内置了该功能) import pdb; pdb.set_trace() 四、查看crashed.../mymodule.py(3)test2() -> print(spam) (Pdb) 五、主要函数 六、实现自定义功能可以修改pdb.Pdb类 class pdb.Pdb(completekey='...tab', stdin=None, stdout=None, skip=None, nosigint=False, readrc=True) eg:跳过特定模块 import pdb; pdb.Pdb
alter session set container=pdb1; SYS@cdb1> show con_name 方法二:使用服务名连接 查看 pdb1 服务名 SYS@cdb1> select...[oracle@orcl19c ~]$ sqlplus sys/oracle@pdb1 as sysdba SYS@pdb1> show con_name SYS@pdb1> show pdbs cdb...使用 connect 命令切换到 pdb 查看当前容器 SYS@cdb1> show pdbs sqlplus 中使用 connect 命令直接切换到 pdb1 SYS@cdb1> conn sys/...oracle@pdb1 as sysdba SYS@pdb1> show pdbs 1.7 pdb 切换回 cdb 1.7.1 方法一:alter session set container SYS@pdb1...> alter session set container=cdb$root; SYS@pdb1> show pdbs 建议通过服务名的方式切换或连接 SYS@pdb1> conn sys/oracle
前言: 早上上班按照正常流程打开Visual Studio,调试本地项目,然后奇怪的是一直提示未加载mscorlib.pdb,导致项目无法正常运行,经过一番折腾最后解决了这个突如其来的bug!
近期在某银行生产环境做的一次PDB迁移,使用的是PDB refresh方式,记录一下流程及遇到的坑。...DG相较于PDB refresh配置更麻烦 PDB refresh的前置条件比DG多 停机时间来看,DG略短于PDB refresh 最后还是定的使用PDB refresh,主要是因为没在生产上做过,积累下经验...,另外也简单:) 三、什么是PDB Refresh 简单来说:创建目标端到源端的DBlink,目标端create pluggable database,指向源端PDB,这样就将源端PDB copy过来,...注意: PDB Refresh支持三种类型的源端数据库,分别是 Local PDB/PDB in a remote CDB/Non-CDB PDB Refresh不支持跨平台、不支持跨大版本 四、迁移流程...六、小结 条件合适的情况下,使用PDB Refresh方式迁移PDB简单快捷,但是目前感觉坑多一点。
答案是用pdb,这是python内置的一个模块,具体看参考这里:http://docs.python.org/2/library/pdb.html 具体怎么使用呢,举个简单的例子吧。...一个简单的场景,我想跟踪下django的启动过程,那就用pdb来演示下。...当然,你得现有个django的项目,在你的manage.py的程序入口处,也就是if __name__ == '__main__':下面插一句代码: import pdb;pdb.set_trace()...你help一下,会有一个简单的提示,目前我只用到n(下一步)和s(步入),另外pdb会记录你上一次输入的命令,因此,你第一次输入n(下一步)之后,直接打回车就会自动执行n。
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