Perl 是一种功能丰富的计算机程序语言，运行在超过 100 种计算机平台上，适用广泛，从大型机到便携设备，从快速原型创建到大规模可扩展开发。在生物信息分析领域，Perl 主要是做数据预处理、文本处理和格式转换、对算法效率要求不高的分析软件开发，系统管理和 pipeline 搭建等工作。这里对 Linux（主要是 CentOS）、Windows 下 Perl 的安装做一个备忘。
今天又有小伙伴微信问我perl模块安装的问题，因为ENSEMBL发布的大多数数据库以及软件都是基于perl的，尤其是分量很重的VEP，所以即使你再如何如何的讨厌perl，也不得不与之打交道。 这种细节问题问我，我当然无法直接给出答案咯。毕竟，我的知识积累都不是靠死记硬背的。所以需要取回过头查看一下我的博客，才意识到，我竟然已经写了7篇教程，关于perl的模块。目录如下： ubuntu服务器解决方案第七讲-perl安装模块 Perl用cpan在linux上面安装模块 Perl及R及python模块碎碎念 pe
在 Linux 中，你可以使用多种命令来统计文件的行数。以下是其中一些常用的命令：
Perl 是什么？用 Larry Wall 自己的话说，Perl 是借取了 C、sed、awk、shell scripting 以及很多其他程序语言的特性的一种语言。你可以说它是 “实用报表提取语言”（Practical Extraction and Report Language），也可以叫它 “病态折中垃圾列表器”（Pathologically Eclectic Rubbish Lister），Larry 说：“OK，我都承认”。
Centromics software (https://github.com/ShuaiNIEgithub/Centromics) was used to identify centromeres
CustomLog ” /var/log/httpd/access_log” combined
最近的MHA验证时，遭遇了DBD::mysql::dr::imp_data_size unexpectedly这个错误。而DBD这个包已经是安装过了的。下面是这个问题的描述和解决方案。
B. 当IIS中的ASP仅用于后台，同时使用人数较少.前台页面主要以HTML静态页面展示，ASP用来做的事情较少，本身对系统的负担很轻
作者：kamly，腾讯 CDC 应用开发工程师 前言 正则表达式在我们日常的软件开发过程中被广泛使用，例如编写 Nginx 配置文件、在 Linux 与 macOS 下查找文件，然而不同软件不同操作系统对于正则的应用有着不一样的行为，主要原因是正则表达式演进过程中，出现 POSIX 与 PCRE 派系之分。 一、历史 先了解一下正则表达式的演进史。 20 世纪 40 年代，两位神经生理学家 Warren McCulloch 和 Walter Pitts，研究出了一种用数学方式来描述神经网络的方法，可
原文链接:https://rumenz.com/rumenbiji/linux-rename.html
linux的发行版非常多，其实本质上差别不大，哪怕是mac的OS应该是也是同样的管理操作模式。以下针对于ubuntu适用，当然ubuntu本身也有版本的区别，目前是16，我下面的操作是在12上进行的。 java1.7.0_03的安装 1、JDK官网上 http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html选择 2、将打开终端，建立目录： Sudo mkdir /usr/lib/java 3、将下载的jdk-7u3-linux-i5
2020年年底，Docker hub推出镜像自动扫描的功能，同时Docker也支持了在本地通过Docker命令选项的方式支持镜像漏洞扫描，目前Docker Desktop for Mac以及window上的Docker都可以通过Docker scan子命令扫描本地镜像是否存在漏洞软件。
用字符串替换的方式批量改变文件名 rename 命令存在两个版本用法上有所区别 C语言版本, 支持通配符[常用通配符说明]? 表示一个任意字符* 表示一个或一串任意字符[charset]
用字符串替换的方式批量改变文件名 rename 命令存在两个版本用法上有所区别 C语言版本, 支持通配符 [常用通配符说明] ? 表示一个任意字符 * 表示一个或一串任意字符 [chars
从1991年问世以来，《Perl语言编程》很快成为无可争议的Perl宝典，如今仍是这种高实用性语言的权 Wei 指南。Perl只是作为一个功能强大的文本处理工具，不过很快发展成为一种通用的编程语言，可以帮助成千上万的程序员、系统管理员，以及像你一样的技术爱好者轻松完成工作。
centos刚装完的时候搜不到什么软件，具体yum的源怎么设置也还没弄明白，网上查，好多都让改/etc/yum.repos.d/目录里的东西，不过改了之后不太管用。
目前最新版本是1.1.1，可以通过修改版本号的方式下载最新版本，最新版本可以在这个网站下载：https://www.openssl.org/source
LVS 只实现到了四层，Keepalived 可以实现七层的简单检查，Keepalived 可以通过预设的检查逻辑来管理 LVS 配置，从而实现对 LVS 自动且动态的调配，让整个 LB 系统更加灵活且健壮
通常在获得webshell之后，如果是linux的服务器，一般会返回一个shell来对linux服务器做进一步的渗透，如：溢出提权、信息收集等。下面就说说linux自带的程序来反弹shell的姿势。
centos7不支持mysql，内部集成了mariadb， 而安装mysql的话会和mariadb文件冲突，所以需要先卸载mariadb， 以下为卸载mariadb，安装mysql的步骤
来 源：马哥Linux运维 今天我们来测试一下Linux下面删除大量文件的效率。 首先建立50万个文件 $ test for i in $(seq 1 500000);do echo text >
安装好了mysql监控神器innotop，正得意，innotoop不可用，其错误提示为install_driver(mysql) failed: Can't load '/usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/DBD/mysql/mysql.so' for module DBD::mysql: libmysqlclient.so.15: cannot open shared object file:...经查原有又是DBD惹的祸，这个问题已经发生过好几次了。 1、故障现象 [root@dbsrv1 ~]# cat /etc/issue CentOS release 5.11 (Final) Kernel \r on an \m [root@dbsrv1 ~]# innotop localhost PROCESSLIST_NO_IS: install_driver(mysql) failed: Can't load '/usr/lib64/perl5/vendor_perl/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/auto/DBD/mysql/mysql.so' for module DBD::mysql: libmysqlclient.so.15: cannot open shared object file: No such file or directory at /usr/lib64/perl5/5.8.8/x86_64-linux-thread-multi/DynaLoader.pm line 230. at (eval 504) line 3 Compilation failed in require at (eval 504) line 3. Perhaps a required shared library or dll isn't installed where expected at /usr/bin/innotop line 7601 2、安装perl-DBD-MySQL [root@dbsrv1 ~]# yum install perl-DBD-MySQL Loaded plugins: fastestmirror, security Repository base is listed more than once in the configuration Repository updates is listed more than once in the configuration Repository extras is listed more than once in the configuration Repository centosplus is listed more than once in the configuration Repository contrib is listed more than once in the configuration Loading mirror speeds from cached hostfile * base: mirrors.163.com * epel: mirrors.ustc.edu.cn * extras: mirrors.skyshe.cn * updates: mirrors.pubyun.com Setting up Install Process Package perl-DBD-MySQL-3.0007-2.el5.x86_64 already installed and latest version Nothing to do ###上面描述已经perl-DBD-MySQL已经安装，且为最新的版本 [root@dbsrv1 yum.repos.d]# rpm -qa |grep -i dbd perl-DBD-MySQL-3.0007-2.el5 ###首先先卸载perl-DBD-MySQL，然后再次使用yum安装 [root@dbsrv1 yum.repos.d]# rpm -e --nodeps perl-DBD-MySQL-3.0007-2.el5 [root@dbsrv1 yum.repos.d]# rpm -qa |grep -i dbd [root@dbsrv1 yum.repos.d]# yum install perl-DBD-MySQL Loaded plugins: fastestmirror, security Repository base is listed more than once in the configuration Reposit
Perl 是 Practical Extraction and Report Language 的缩写”实用报表提取语言”是一种功能强大功能丰富的脚本编程语言，最初的设计者为拉里·沃尔（Larry Wall）诞生于20世纪80年代末期并由他不断更新和维护的编程语言。
百问网为 【百问网D1h开发板】提供了投屏功能需要使用的源码，直接git下载即可：
Generate a strong password in Linux using pwgen
我们写完一个正则表达式后，并不知道是否与预期结果相符。比如：在 Nginx 中使用的正则表达式。这时我们一般会用 service nginx reload 命令来不断尝试，以判断其中的正则表达式是否符合预期，这样做显而易见效率极低。如果使用一些在线正则表达式测试工具，可能又会因为使用的正则表达式的库不同，存在差异。
git bash 是 Windows 用户安装 git 时默认安装的命令行工具,不仅界面漂亮功能也不错,大多数情况下可以替代 Windows 原生的 cmd 命令行.
Unity3D打包android应用程序时，如果不对DLL加密，很容易被反编译，导致代码的泄露。通常的做法是通过加密DLL或者对代码进行混淆。本文的所要探讨的是通过加密的方式来对DLL进行保护，并详细记录加密的操作过程。
关于Th3inspector Th3inspector是一款功能强大的网络侦查信息收集工具，该工具整合了多种信息收集组件，可以帮助广大研究人员在网络侦查活动中完成各种信息收集任务。 值得一提的是，该工具支持在Linux和Windows，甚至是Android操作系统平台上运行。 工具安装 Linux安装 广大研究人员可以使用下列命令将该项目源码克隆至本地： git clone https://github.com/Moham3dRiahi/Th3inspector.git（向右滑动，查看更多）
C 缓冲区溢出背后的基本思想非常简单。您有一个缓冲区，这是一块保留用于存储数据的内存。在堆栈的外部（在 x86 和 x86_64 上向下增长，这意味着随着内存地址变大，内存地址会下降），程序的其他部分被存储和操作。通常，我们进行黑客攻击的想法是按照我们认为合适的方式重定向程序流。对我们来说幸运的是，对堆栈的操作（堆栈“粉碎”）可以让我们做到这一点。通常，您会希望获得特权，通常是通过执行 shellcode - 或者无论您的最终目标是什么，但出于本教程的目的，我们只会将程序流重定向到我们无法访问的代码（在实践，这几乎可以是任何事情；甚至包括执行未正式存在的指令）。这是通过写入越过缓冲区的末尾并任意覆盖堆栈来完成的。
vi /etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0
不必太纠结于当下，也不必太忧虑未来，当你经历过一些事情的时候，眼前的风景已经和从前不一样了。——村上春树
circos对于小伙伴们应该都不会陌生，现在应用场景非常的广泛。小编在工作的时候也为了做出惊艳的circos曾大伤脑筋。为了能够让小伙伴们不再做重复性的基础工作，小编系统的整理分享perlcircos 的安装、配置和使用。perl 版本的circos 是Martin Krzywinski在2009年发表在Genome Research 上的一篇题为“Circos: An information aesthetic for comparative genomics”开发的软件。从发表到今天（2019/05/03）引用次数竟高达4296次。很多作图都是非常好看，甚至让人惊艳的。下边小编从官网转过来一些，请大家鉴赏。
卸载旧的epel仓库，重新安装epel仓库，删除冲突软件包，重装rpmconf并执行rpmconf，在交互界面一直输入Y和回车即可
1、virtual box 官网下载最新 (opens new window)（本次笔记使用的是 VirtualBox-6.0.4-128413-Win.exe），安装完成之后，需要先配置下虚拟电脑的默认位置：管理 -> 全局设定 -> 虚拟电脑位置
环境：AIX 6.1 + Oracle 10.2.0.4 现象：在做xtts测试时，源环境使用Oracle自带的perl执行xttdriver.pl报错如下：
电影里的黑客们聊天不想我们生活中的一样，用QQ、微信的客户端，都是通过命令行来进行聊天交流的，大概是为了提升逼格吧。
相信大家对于正则表达式都不陌生，在文本处理中或多或少的都会使用到它。但是，我们在使用linux下的文本处理工具如awk、sed等时，正则表达式的语法貌似还不一样，在awk中能正常工作的正则，在sed中总是不起作用，这是为什么呢？
缓冲区溢出攻击方法是黑客入门的基础，本文以具体实例一步步介绍如何进行最初级的缓冲区溢出攻击。
小编欢乐豆又放出一个珍藏多年的脚本，2749 行的长度，长到已经难以用 GPT 解读啦，不过用起来还是很方便的！这个 perl 脚本用于将 GenBank 格式的文件转换为 GFF3 格式。
在实际的渗透测试中，有的时候需要自己创建一个http服务，来辅助我们的渗透测试，往往我们会遇到各种各样不同的环境，所以使用简单的方式在不同环境下创建一个HTTP服务还是非常有用的。下面我们就简单介绍下，在不同环境下使用一句话启动HTTP服务的各种姿势。
由于需要管理服务器的一些参数，比如CPU使用率，IOwait之类的指标，管理方通过snmpwalk进行五分钟一次对受管服务器的轮询。
Linux环境每天用得最多的命令就是grep，这里把一些稍微进阶的用法整理一下 常用选项 可以参见man grep或者grep命令，最常用的选项如下： -v 反转查找 -w 只显示全字符合的列 -i 忽略字符大小写的差别 -o 只输出文件中匹配到的部分 -n 显示列号 -F 禁用正则表达式（用来搜索包含正则表达式特殊字符的的场景） 正则表达式 命令示例： grep -E "[0-9]+" sentence.txt -E 扩展的正则表达式 -P Perl正则表达式（支持一些高级用法，比如先行断言、后发断
接手以前别人做的项目，发现SVN里的ignore里并没有对*.db处理，导致图片的缓存缩略文件都被提交了，而我只要打开图片文件夹，就意味着Thumbs.db发生了改变。
1、Python 1.1 format方法： 2.7版本以上直接用format设置千分位分隔符 Python 2.7 (r27:82500, Nov 23 2010, 18:07:12) [GCC 4.1.2 20070115 (prerelease) (SUSE Linux)] on linux2 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. >>> format(1234567890,',') '1,
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