/configure --prefix=$(pwd) make 编译成功后，需要设置如下的环境变量 export PERL5LIB=/soft/tRNAscan-SE-2.0/lib:$PERL5LIB...另外，该软件依赖infernal，需要将infernal的可执行程序拷贝到bin目录下 wget http://eddylab.org/infernal/infernal-1.1.2-linux-intel-gcc.tar.gz...tar xzvf infernal-1.1.2-linux-intel-gcc.tar.gz cp infernal-1.1.2-linux-intel-gcc/binaries/* bin 为了确保程序的正确运行
目录如下： ubuntu服务器解决方案第七讲-perl安装模块 Perl用cpan在linux上面安装模块 Perl及R及python模块碎碎念 perl模块终极解决方案-上 perl模块终极解决方案-...perl -MNet::Server -e1 上述步骤适合于 Linux/Unix下绝大多数的Perl模块。...当然每次写程序添加这个也实在是太麻烦了，其实你也可以直接打开 ~/.bashrc，然后写入下面的内容 PERL5LIB=$PERL5LIB:/PATH_WHERE_YOU_PUT_THE_PACKAGE...PATH="/home/jmzeng/perl5/bin${PATH:+:${PATH}}"; export PATH;PERL5LIB="/home/jmzeng/perl5/lib/perl5${PERL5LIB...:+:${PERL5LIB}}"; export PERL5LIB;PERL_LOCAL_LIB_ROOT="/home/jmzeng/perl5${PERL_LOCAL_LIB_ROOT:+:${PERL_LOCAL_LIB_ROOT
安装和使用 统一配置环境变量，一劳永逸 把export PERL5LIB=${PERL5LIB}:~/perl5lib/加到~/.bashrc中 把export PATH=${PATH}:~/bin 加到...PERL5LIB配置：在系统中新建目录 ~/perl5lib，将其完整路径加入到环境变量。...orthomclSoftware-v2.0.9.tar.gz cd orthomclSoftware-v2.0.9 ln -s `pwd`/bin/* ~/bin/ ln -s `pwd`/lib/perl/* ~/perl5lib
而在目标环境Linux6.8 + Oracle 11.2.0.4 就正常，起初我没多想这个问题，以为是10g的自带perl版本过低不支持，第一轮测试使用了系统自带perl可执行。...需要设置PER5LIB环境变量： perl xttdriver.pl fails: Can't locate Getopt/Long.pm in @INC (文档 ID 1912400.1) 临时设置PERL5LIB...环境变量： $ export PERL5LIB=$ORACLE_HOME/perl/lib 再次使用Oracle自带的perl执行xttdriver.pl不再报之前的错误，这里测试没加参数，就正常列出了
把下载的patch解压后，可以使用opatch调用安装，示范如下： $ opatch apply 2990321 PERL5LIB=/opt/oracle/product/9.2.0/Apache/perl.../opatch_modules; export PERL5LIB /opt/oracle/product/9.2.0/Apache/perl/bin/perl ..../opatch_modules; export PERL5LIB /opt/oracle/product/9.2.0/Apache/perl/bin/perl ....bash-2.03$ opatch lsinventory PERL5LIB=/opt/oracle/product/9.2.0/Apache/perl/lib/5.00503:..../opatch_modules; export PERL5LIB /opt/oracle/product/9.2.0/Apache/perl/bin/perl .
gist. export cd=$HOME/vep export VEP_DATA=$HOME/.vep mkdir $VEP_PATH $VEP_DATA; cd $VEP_PATH export PERL5LIB...=$VEP_PATH:$PERL5LIB export PATH=$VEP_PATH/htslib:$PATH ## 这一块代码就创建文件夹和下载数据，理论上不会出错，取决于网速 perl -e '{...binary down the same path, and make it executable: curl -L http://hgdownload.soe.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86
https://blog.csdn.net/haluoluo211/article/details/77752331 本文主要内容是使用linux软件安装 以及运行时常出现的一些问题，主要如下：...caffe_test/caffe-caffe-0.15/.build_release/lib/:$LD_LIBRAYA_PATH LD_LIBRARY_PATH: native code libraries (on Linux...PERL5LIB: Perl libraries (e.g. /usr/local/lib/site-perl:/usr/lib/perl:/usr/share/perl).
perl5`' >> ~/.bashrc; 此处perl包的安装目录是/data/10.xuxiong/software/perl5，其实这步是在~/.bashrc的配置文件里面配置了环境变量PERL5LIB
find_block.pl find_block.pl是一个perl脚本，脚本里集成了dd或kfed命令来从ASM磁盘中抽取一个块，脚本可以在Linux和Unix的ASM版本下工作，且不管是单实例还是RAC...这个脚本可以运行在任意节点上，在运行脚本前，请检查ASM的环境变量，确定ORACLE_SID, ORACLE_HOME, LD_LIBRARY_PATH设定正确，而且对于10G和11GR1版本，需要设置PERL5LIB...环境变量： export PERL5LIB=$ORACLE_HOME/perl/lib/5.8.3:$ORACLE_HOME/perl/lib/site_perl 可以以如下的方式运行脚本： $ORACLE_HOME...+DATA/cat/datafile/users.259.783204313 SQL> 以上我们造取了两条数据，并且定位到了数据所在的文件和BLOCK号，切换到ASM环境，注意设置正确的环境变量PERL5LIB...，然后运行脚本： $ export PERL5LIB=$ORACLE_HOME/perl/lib/5.8.3:$ORACLE_HOME/perl/lib/site_perl $ $ORACLE_HOME
编辑buildenv.pl文件，并且增加一个 PERL5LIB 变量 指向解压得到的归档中的lib子目录。例如： $ENV{PERL5LIB}=$ENV{PERL5LIB} .
以Linux为例： 我们要查看一个在自己家目录下的文件 I_am_home.txt，那登录后，直接可见： YSX@ehbio:~$ tree . ├── I_am_home.txt └── train...以上就是Linux系统的环境变量设置，Windows系统的环境变量择日再推一期，喜欢的话不妨多多关注。...其它被忽略的事情 软件可执行属性 其它环境变量 环境变量PATH： 定义可执行程序的目录 LD_LIBRARY_PATH： 定义动态库的目录 PYTHONPATH： 定义Python包的目录 PERL5LIB...软件安装 Linux - 命令运行监测和软件安装 Linux - 应用Docker安装软件 Linux - Conda软件安装方法 Nature Method：Bioconda解决生物软件安装的烦恼 手把手教你生信分析平台搭建...Windows轻松实现linux shell环境：gitforwindows Bioconda软件安装神器：多版本并存、环境复制、环境导出
newxx --源端AIX上传rman-xttconvert_2.0.zip至/exp/newxx cd /exp/newxx unzip rman-xttconvert_2.0.zip --目标端Linux...tmp mkdir -p /exp/newxx/dump mkdir -p /exp/newxx/backup_incre chown -R ora11g:dba /exp/newxx --目标端Linux...cd /exp/newxx --full_backup.sh脚本内容如下 export ORACLE_SID=sourcedb export TMPDIR=/exp/newxx/tmp export PERL5LIB...exp/newxx --增量备份脚本incre_backup.sh内容如下 export ORACLE_SID=sourcedb export TMPDIR=/exp/newxx/tmp export PERL5LIB...4.3 目标端开启闪回 目标端Linux开启在导入元数据前开启闪回 SQL> alter system set db_recovery_file_dest_size=100g scope=both;
Linux 文件系统 目录 说明 bin 存放二进制可执行文件 sbin 存放二进制可执行文件，只有 root 才能访问 boot 存放用于系统引导时使用的各种文件 dev 用于存放设备文件 etc...是超级管理员 localhost 表示主机名 ~ 表示当前目录（家目录），其中超级管理员家目录为 /root，普通用户家目录为 /home/chan $ 表示普通用户提示符，# 表示超级管理员提示符 Linux...test.tar.gz 文件搜索命令 locate：在后台数据库搜索文件 updatedb：更新后台数据库 whereis：搜索系统命令所在位置 which：搜索命令所在路径及别名 find：搜索文件或文件夹 用户和组 Linux
Linux文件操作 Linux中，一切皆文件(网络设备除外)。 硬件设备也“是”文件，通过文件来使用设备。 目录(文件夹)也是一种文件。...boot:这里存放的是启动Linux时使用的一些核心文件，包括一些连接文件和镜像文件。...deb:deb是Device(设备)的缩写，该目录下存放的是Linux的外部设备，在Linux中访问设备的方式和访问文件的方式是相同的。...系统会自动识别一些设备，例如U盘、光驱等，当识别后，Linux会把识别的设备挂载到这个目录下。...---- Linux文件的操作方式 文件描述符fd fd是一个大于等于0的整数。 每打开一个文件，就创建一个文件描述符，通过文件描述符来操作文件。
背景 由于 Linux 命令行没有图形化界面，因此，所有的设置都采用文本的方式来完成，而其中最重要的用户设置则为 bashrc 文件，bashrc 配置文件非常重要，相当于图形化界面的设置选项...二、PS 部分 2.1 修改 PS 变量 Linux 系统中的 PS变量用来控制命令行设置，其中PS 即是Prompt String,命令提示符的意思，可以看到有 PS1，PS2，PS3，PS4...Linux 命令行终端颜色是通过一些数字来显示的。.../:/usr/bin:$PATH" export PATH="$PATH:/Software/bin/:$PATH" export PERL5LIB="/Software/biosoft/tRNAscan-SE...Linux 系统中常见的软件找不到“command not found...”多是因为 PAHT 变量没有设置成功引起的。
为了解决内存紧缺的问题，Linux引入了虚拟内存的概念。为了解决快速存取，引入了缓存机制、交换机制等。...要深入了解Linux内存运行机制，需要知道下面提到的几个方面。 首先，Linux系统会不时地进行页面交换操作，以保持尽可能多的空闲物理内存。...其次，Linux进行页面交换是有条件的，不是所有页面在不用时都交换到虚拟内存中，Linux内核根据“最近最经常使用”算法，仅仅将一些不经常使用的页面文件交换到虚拟内存中。...Linux虽然可以在一段时间内自行恢复，但是恢复后的系统已经基本不可用了。...Linux下可以使用文件系统中的一个常规文件或者一个独立分区作为交换空间。同时Linux允许使用多个交换分区或者交换文件。
linux安装.net 下载.net https://dotnet.microsoft.com/download/thank-you/dotnet-sdk-2.1.4-linux-x64-binaries...下载安装包后执行命令： dotnet-sdk-2.1.302-linux-x64.tar.gz yum install libicu -y cd /root ln -s /data1/soft /data.../soft tar zxvf dotnet-sdk-2.1.302-linux-x64.tar.gz -C /data1/soft/dotnet/ echo 'export DONET_ROOT=$PATH
Linux ESC :wq 和:wq!的区别 Linux ESC:wq 和:wq!...的区别 发布者：IT人在线 ｜ 发表时间：2018-12-4 17:20:43 Linux ESC :wq esc(键退出)->:(符号输入)->wq(保存退出) wq(存盘并退出 write%quite
---- O_SYNC 缓存同步 为了保证磁盘系统与缓冲区内容一致，Linux系统提供了sync,fsync,fdatasync三个函数。...---- Linux文件IO流程图 内核中会有一个线程，不断地将高速页缓冲区中的数据写入到物理磁盘中。
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