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2
回答
将-N选项与
qsub
一起使用时出错
、
、
我试图在Makefile中使用
qsub
-N "compile-$*",但它给出了以下错误,因为在本例中,$*等于"compile-obj/
linux
/flow“。我使用的整个命令是:-
qsub
-P bnormal -N "compile-obj/
linux
/flow" -cwd-now no
浏览 11
提问于2012-07-06
得票数 0
1
回答
如何使用python作为提交脚本使用PBS调度程序?
我在
qsub
上试过,但没成功。知道怎么让它工作吗?test_
qsub
.py$ cat test_
qsub
.py.e381299
浏览 10
提问于2020-09-14
得票数 0
1
回答
如何从指定节点运行脚本并激活conda环境?
、
、
我想把它提交给
qsub
,但只是需要帮助。我的剧本是:我已经试过了:
qsub
qu=**node** scri
浏览 0
提问于2020-12-12
得票数 0
9
回答
等待一组
qsub
作业完成
我有一个批处理脚本,它从几个
qsub
作业开始,当它们都完成时,我想捕捉它们。 我不想使用-sync选项,因为我希望它们同时运行。每个作业都有一组不同的命令行参数。可以使用巴什陷阱,但我将如何与
qsub
?
浏览 8
提问于2012-07-17
得票数 41
1
回答
使用putty -m选项会给出‘未找到命令’
、
、
如果我使用:putty -load session_name在机器中打开一个外壳程序,然后执行一个命令将一个作业添加到
linux
系统(
qsub
-cwd -b hostname)上的网格队列中,一切都会正常工作但是,如果我将命令添加到文本文件中,然后执行putty -load session_name -m file.txt,则会得到
qsub
: command not found 如果我后退并将文本文件简化为仅为命令我是
linux
系统的新手,这似乎是一个简单的修复方法,可以告诉你'
qsub
‘存在
浏览 0
提问于2013-10-29
得票数 0
2
回答
unix: for循环使用字符串
、
、
、
in 3UTR 5UTR coding_genic genic non_synonymous reg synonymous for i in 1 2 3
qsub
目标是运行"
qsub
“命令(将作业提交到集群计算机),其中"compute.job”中的“compute.job”变量被替换为1、2或3,"VAR2“变量替换为由p表示的字符串之一。这个部分工作得很好: do
qsub
浏览 2
提问于2014-02-17
得票数 0
回答已采纳
2
回答
将变量脚本参数传递给另一个脚本,然后将
qsub
传递给程序
、
、
、
、
这是我的衍生剧本#$ -cwd#$ -pe fah 1因此,派生操作很好,并生成文件。而且,脚本可以很好地传递一个常量./daedalus_
linux
_1.3_64 1 1,但是传递变量不起作用。我不知道处方是否正确地将变量i传递给脚本。我不知道如何从脚本中写入错误文件-
浏览 12
提问于2013-08-25
得票数 0
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1
回答
试图让
qsub
在我的集群上工作
、
、
试图让
qsub
在我的集群上工作(现在是单个节点,但更多的节点正在到来),到目前为止,尝试提交
qsub
的尝试正在返回。gridengine.org上的一些帖子,建议:从现在起,这似乎已经取得了进展,
qsub
说:但它永远悬而
浏览 0
提问于2016-03-08
得票数 1
1
回答
如何将
qsub
作业从父目录转移到集群的子目录
、
在
Linux
中,我很难从父目录提交作业。假设在我的父目录中,有1000个名为1、2、3……、1000的子目录,其中所有子目录都有一个提交脚本submit.sh。我需要对父目录中的所有脚本执行
qsub
操作,这样所有的计算和输出都会被转储到相应的子目录中,而不是分别访问每个子目录和
qsub
,这当然会花费我大量的时间。有没有办法做到这一点? 我非常感谢你的帮助。
浏览 2
提问于2016-03-07
得票数 0
1
回答
qsub
作业数组(-t),等待完成预览任务
、
"
Linux
服务器“for i in *.sh; do echo "bash $i ZMV" |
qsub
-N ZMV -t 1-7 -cwd -l h_vmem=2G; done在“正常”情况下(没有-t),我使用-hold_jid,但在这种情况下,我不知道该怎么办。
浏览 1
提问于2018-03-09
得票数 0
1
回答
pbs/torque/maui如何选择节点?
、
、
每次我们使用:或提交作业,因为我们可能有数百台具有
linux
特性的机器。我想知道扭矩如何选择正确的节点?
浏览 5
提问于2015-04-13
得票数 1
回答已采纳
3
回答
在anaconda环境下运行
qsub
、
、
、
我有一个程序通常在
Linux
中的conda环境中运行,因为我使用它来管理我的库,下面是说明:python hello_world.py# script.sh如何使用我的anaconda环境使用
qsub
运行hello_world.py?
浏览 2
提问于2018-11-16
得票数 7
回答已采纳
1
回答
使用GNU并行时以最快的方式输出文件
、
、
、
、
test10 我正在使用multiple-nodes.sh运行
qsub
,其中我正在执行10个文件,以便它们在CPU上的不同节点(和核心)上运行。要花几个小时才能完成。然而,在multiple-nodes.sh完成执行之后,我没有看到它出现在qstat中,但当我在
linux
中检查top进程时,我仍然看到R脚本正在运行(command1...etc)。我认为这可能是因为
linux
(或者它是并行的)只有在脚本执行完成之后才会写入文件。但是这看起来真的很慢,因为从执行开始到现在已经有15个小时了,这个过程已经在
qsub
中完成了,
浏览 3
提问于2015-08-20
得票数 1
4
回答
如何在命令行中与Python一起使用
qsub
?
我刚试过这个命令:并收到此错误: 我正在一个计算集群上运行这个程序,该集群通常可以很好地实现
qsub
.csh文件。
浏览 5
提问于2012-12-11
得票数 2
1
回答
暂停shell脚本,直到上一个命令完成
、
、
、
我有一个shell脚本,它有一个
qsub
命令,后面跟着其他依赖于
qsub
命令输出的命令。我有一个shell脚本,它看起来像cat <some_files>我希望在脚本转到cat命令之前,
qsub
完成运行。我把"wait“放在
qsub
后面,但没有起作用。
浏览 1
提问于2015-10-31
得票数 1
3
回答
如何在python中向命令行提交不同的脚本-
、
、
虽然这对给定的文件有效:这不会:os.system('
qsub
浏览 2
提问于2011-08-28
得票数 0
回答已采纳
4
回答
将文本附加到不包含模式的第一行?
、
、
例如,输入文件将类似于
qsub
job2.sh #DONE
qsub
job4.sh
qsub
job1.sh #DONE
qsub
job2.sh #DONE
qsub
job4.sh 我对这种类型的脚本没有经验,我已经搜索过了,但是没有找到正确的解决方案。
浏览 2
提问于2017-12-11
得票数 1
回答已采纳
1
回答
Querydsl加入条件
、
、
、
QSub
any = exp.sub.any(); any.selected.isTrue().and(any.sub.person.id.eq(user.getId
浏览 0
提问于2018-05-18
得票数 0
回答已采纳
2
回答
具有带有输入的作业脚本的
Qsub
、
、
、
、
我正在尝试将java代码作为作业提交给
qsub
。该命令为
qsub
假设-cp是它的一个参数,并抛出一个错误。
浏览 49
提问于2017-02-23
得票数 1
1
回答
如何在unix中运行批处理命令
/Codes>
qsub
69sk_01_800999.sham@tinaroo1:~/.../Codes>
qsub
69sk_04_800999.sham@tinaroo1:~/.../Codes>
浏览 0
提问于2022-08-26
得票数 0
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