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如何获取目标基因的转录因子()——Linux命令获取目标基因TF

) 我们知道有很多数据库可以查找启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点,但是怎么用Linux命令处理基因信息文件来得到关注基因的启动子和启动子区结合的TF呢?...文件格式处理 删除文件GRCh38.gene.bed首行,第六列正负链表示形式改为-和+,并在第一列染色体位置加上chr sed -i '1d' GRCh38.gene.bed # 如果用sed,注意下面...head GRCh38.gene.bed GRCh38.gene.promoter.U1000D200.bed检查一计算是否有误。自己选取正链和负链的一个或多个基因做计算,看看结果是否一致。...程序不细解释,具体看文后的Linux系列教程。Bedtools使用简介 # cut时注意根据自己的文件选择对应的列 # tr转换大小写。...,希望如何获取目标基因的转录因子(上)和本文能够帮助到各位小伙伴 重点总结 什么是bed文件(http://asia.ensembl.org/index.html) awk命令的使用(Linux学习 -

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恶劣天气目标检测

相比之下,表征光波的偏振图像即使在弱照明或强反射的情况,也能鲁棒地描述物体的重要物理特性。本文展示了非常规偏振成像模式如何克服传统的目标检测方法,特别是在恶劣天气条件。...然而,在恶劣的天气条件,由于缺乏用于训练策略的相关数据集,这些模型的性能大大降低。在这项工作中,我们通过引入一个新的雨驱动数据集,命名为RD,解决了雨干扰目标检测问题。...本研究提出了一种具有能见度互补模块的车辆检测系统,该系统在各种恶劣天气条件提高了检测精度。此外,所提出的系统可以在不重新训练用于不同天气条件目标检测的深度学习模型的情况实现。...,但是在恶劣天气(例如雨、雪或霾)目标检测受到的关注相对有限。...此外,我们应用了一种新的策略在光谱之间切换,使我们能够受益于每个光谱的优势,即使在恶劣的天气条件也能进行更好的运动目标检测。

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linux安装opencv_linux安装pycharm

,进入到Linux版的RabbitMQ下载页面中 7、找到Download的 rabbitmq-server-generic-unix-3.7.16.tar.xz下载链接并点击,开始进行下载RabbitMQ...三、把下载好的RabbitMQ 和 Erlang上传到Linux服务器上 1、打开WinSCP,把我们下载好的RabbitMQ 和 Erlang安装包,上传到Linux的 /mnt/ 文件目录下...2、使用putty连接到我们的Linux服务器,进入到/mnt/ 文件目录中,并解压上传的RabbitMQ 和 Erlang安装包 [root@localhost ~]# cd /mnt/ //...PID file not written; -detached was passed. 5、在浏览器的地址栏中输入你 服务器的ip地址:15672,即可访问RabbitMQ的管理登录界面,例如我的Linux...(3)策略制定者(policymaker):可登陆管理控制台(启用management plugin的情况), 同时可以对policy进行管理。

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Linux At 命令

一、安装At 取决于不同的发行版,at在你的 Linux 系统中可能有,也可能没有。 如果at没有被安装,你可以很容易地使用你发行版的软件包来安装它。...例如,想要创建一个任务,运行脚本: /home/linuxize/script.sh: at 09:00 -f /home/linuxize/script.sh 默认情况,这个命令会产生输出,一旦任务完成...at 09:00 -m 三、batch命令 batch或者它的关联at -b预定任务并且在系统负载允许的情况,批量执行任务。默认情况,当系统平均负载在1.5以下的时候,任务将会被执行。...下面是一个例子: at -t 202005111321.32 五、指定队列 默认情况,由at创建的任务被计划在命名为a的队列,并且由batch创建的任务被计划在b队列。...默认情况,仅仅/etc/at.deny文件存在,并且是空的,这意味着所有用户可以使用at命令。如果你想禁止某一个用户的权限,将他的用户名添加到这个文件中。

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基于深度学习的图像目标检测(

速度快, 效果好的均衡的推荐选择。 R-FCN问题: 依然无法实现视频基本的实时(每秒24帧图像)。...如果不使用区域推荐机制的情况, 仅仅依靠分类和回归的话, 如何进一步提升召回率呢? 如何改善滑动窗口呢? 1. 分而治之判断类别 2. 分而治之, 预测框 3....这种注意力移动的过程,也必须和具体目标对应起来, 才能应用到多目标的情况: 所以说, 不同类别就可以配置成并行的结构框架。 这样的话, 多个目标实例都要拥有一个这样的注意力移动的过程。...G-CNN问题: 速度依然太慢,难以实时应用 ION Inside-Outside Net是提出基于RNN的上下文的目标检测方法。...这样,在每个层次就可以利用类似的尺度来发现目标物体。

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Repulsion Loss 遮挡场景目标检测

我们思考一行人遮挡会对检测器造成什么影响。假设我们目标行人是T,旁边被另外一个行人B所遮挡。那么B的真实框会导致我们对T的预测框P,往B去移动(shift),造成类似下图的情况 ?...另外我们再考虑目标检测常用的后处理NMS,非极大值抑制。NMS操作是为了抑制去除掉多余的框。但是在行人检测中,NMS操作会带来更糟糕的检测结果。...由于行人检测算是小目标检测任务,因此我们给resnet增加了空洞卷积,并将采样改为8倍(原始224->7采样是32倍) 简单改进后的目标检测器的MR指标由15.4降到14.6,稍微提升了点。...小目标难检测原因(补充) 传统的分类网络为了减少计算量,都使用到了采样,而采样过多,会导致小目标的信息在最后的特征图上只有几个像素(甚至更少),信息损失较多 采样扩张的感受野比较利于大目标检测,而对于小目标...的分母,真实框大小area(G)是固定的,因此其优化目标是去减少与目标框重叠,即area(B∩G)。

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Linux 基础

[查找标准] [查找到以后的处理动作] 查找路径,默认为当前目录 查找标准,默认为指定路径的所有文件 -name 'filename' //对文件名作精确匹配...-gid //根据GID进行查找,当用户被删除以后文件的属组会变为此用户的GID -nouser //查找没有属主的文件.用户被删除的情况产生的文件...,只有uid没有属主 -nogroup //查找没有属组的文件.组被删除的情况产生的文件,只有gid没有属组 -type //根据文件类型来查找...文件并且删除 find / -name "abc.txt" -ok cp -r {} /home/canxun/ \; //查找abc.txt文件并且确认复制到/home/canxun/...find / -name "abc.txt" -exec mv {} /home/canxun/ \; //查找abc.txt文件并且不需要确认移动到/home/canxun/

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linux杀死全部进程,linux批量杀死进程

,又多了那个.使用命令taskkill可将这些进程一子所有杀光: C:\Users\NR>taskkill /F /im fron … Linux强制杀死进程的方法 常规篇: 首先,用ps查看进程,...批量杀死包含关键字“php-fpm”的进程. kill … linux查看当前进程以及杀死进程 ###linux查看当前进程以及杀死进程 查看进程 ps命令查找与进程相关的PID号: ps a :显示现行终端机的所有程序...,包括其他用户的程序. ps -A :显示所有程序. ps c :列出程 … Linux批量管理工具pssh安装和使用 Linux批量管理工具pssh安装和使用 pssh工具包 安装:yum -y...解决Tomcat进程 windows启动Tomcat报错,8080端口号被占用,报错信息如下 两种解决方法,一种是关闭了这个端口号,另外一种是修改Tomcat的serv … Linux查看某个进程打开的文件数...-losf工具常用参数介绍 Linux查看某个进程打开的文件数-losf工具常用参数介绍 作者:尹正杰 版权声明:原创作品,谢绝转载!

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Linux】--- Linux基本指令(1)

补: whoami作用是查看当前正在使用Linux系统的人是谁(用户)。在表述的时候,我们通常会说我们在XXX路径,此处我们就是指whoami的结果。...Linux指定的用户也有自己的家目录!且任何一个用户,首次登陆,所处的路径都是自己的家目录!!...解释一,面手册分为8章(即上图中前8个) : 1 是普通的命令(可执行程序,指令); 2 是系统调用(即是由操作系统内核(Linux系统)提供的接口),如fork,open,write之类的(通过这个...语法: mv[选项] 源文件或目录 目标文件或目录 功能: 视mv命令中第二个参数类型的不同(是目标文件还是目标目录),mv命令将文件重命名或将其移至一个新的目录中。.../test.c) 常用选项: -f:force强制的意思,如果目标文件已经存在,不会询问而直接覆盖 -i:若目标文件 (destination)已经存在时,就会询问是否覆盖!

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Linux】---Linux基本指令(2)

一、指令详细介绍 1.1 cat 指令 语法: cat[选项][文件] 功能: 查看目标文件的内容,(tac指令:逆向查看文件内容,与cat相似) 常用选项: -b对非空输出行编号 -n对输出的所有行编号...Linux理念:Linux中一切皆文件。 那么Linux可以以统一的方式来进行文件/设备访问! 基于此理念,普通文件和显示器有什么区别吗?...Linuxfind命令在目录结构中搜索文件,并执行指定的操作。 Linuxfind命令提供了相当多的查找条件,功能很强大。...由于find具有强大的功能,所以它的选项也很多,其中大部分选项都值得我们花时间来了解一。 即使系统中含有网络文件系统( NFS),find命令在该文件系统中同样有效,只你具有相应的权限。...sz指令,作用是将压缩包传到windows上;rz则是将windows上的压缩包传到Linux的当前路径

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目标推荐场景的深度学习实践

在首页这个复杂的业务推荐场景,我们面临着多业务融合挑战。...如何利用从双通道到多通道到多场景适配的深度学习模型,实现涉及连接效率提升,增加商业收入,提高用户体验,优化用户流程,支持运营活动的各种目标的平衡。...本文将以58同城首页猜你喜欢为例,将具体介绍实践多业务融合推荐场景的深度学习模型应用,以及相关的工程实践。...① 多目标优化,这也是我们未来重点的探索方向。虽然首页猜你喜欢显出了多目标平衡的特点,但是由于58的业务是非闭环的。所以我们无法直接跟踪到用户最终的交易行为,目标定义存在巨大的挑战。...多目标优化:基于现有的模型架构,采用ESSM多目标模型来做训练, ③ 重排:从规则打散到基于相似度的柔性打散策略 ④ 展示优化: 样式对齐:我们引入了特色展示元素。

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