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解决 Linux 挂载 NTFS 分区只读不能写的问题

有没有小伙伴也是跟我一样电脑上同时装有 Windows 和 Linux 双系统的呢?对于用不起苹果电脑但是又无法抛弃 Windows 精彩生活的我们这些穷程序猿来说,能够同时解决生活和工作需要的办法,无非就是安装双系统或者使用虚拟机这两种方式。但是对于还不太熟悉 Linux 的小伙伴来说,起初总是会踩到各种各样的坑。今天我在 Linux 上挂载 Windows 的 NTFS 分区时就遇到了一个坑,刚开始踩到这个坑时可头疼了,因为度娘竟然找不到有类似经历的小伙伴们提供的解决方案(我已经习惯了这种折磨了,总是会遇到别人一辈子都遇不到的坑),而 Google 我就不提了,国庆刚过哈哈哈~

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使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

在日常的计算化学研究中,我们经常需要将计算得到的分子或者固体/晶体体系简谐振动通过动画的方式直观地呈现在屏幕上,从而可以清楚地知道在某个特定的振动模式下是哪些原子在运动。一方面,这种振动的可视化可以在实验测量得到了振动光谱(红外、拉曼)的情况下帮助我们借助理论计算对振动谱图进行指认;另一方面,在反应机理研究的过渡态计算中,通过对虚频振动的观察,我们可以很快知道计算得到的过渡态结构是否能把反应物、产物的结构串起来。 以最常用的量化计算程序高斯为例,与之配套使用的GaussView软件可以很轻松地对振动分析 (freq) 计算结果进行可视化。类似地,Q-Chem也有一个配套的IQmol程序(免费、开源)可以呈现Q-Chem的振动分析结果。此外,一些第三方的程序如Avogadro、MOLDEN等也可以对高斯程序的振动分析结果进行可视化。计算化学公社的社长sob老师曾经写过一个可以将ORCA的振动分析结果转换为高斯输出格式的工具(http://sobereva.com/498)以及一个可以在VMD程序中显示振动模式静态矢量的工具(http://sobereva.com/567)。

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领券