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PyAmesp——Amesp与ASE的联姻

PyAmesp可在github进行下载: https://github.com/DYang90/PyAmesp 再按照如下方式进行安装(注:“$”表示Linux中的命令提示符,安装时不用输入): $ tar...在本例中我们的计算参数是:12核心处理器且每核心内存最大占用为1 GB,计算的方法基组为M06-2X/6-31G**,积分格点使用grid5级别,其余选项采用Amesp中的默认设置。 1....最终程序经过8个BFGS步骤达到收敛,并将优化过程中结构及相应的能量与受力等信息保存到product.traj中。...在菜单栏中的【视图】-【简要信息】,或是用快捷键Ctrl+I来查看当前结构的能量和受力。在菜单栏中的【文件】-【保存】或者通过快捷键Ctrl+S可以将整个轨迹或者当前结构导出为其他格式。 图1....的optimize模块不同,优化过程的相关信息将会记录在Gaussian的输出文件reactant.log中,也可以通过ASE的预览器查看log文件,本例经过30步优化达到收敛。

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安装使用Sybase ASE 12.5

首先下载Sybase ASE 12.5的安装文件,下载地址为http://download.sybase.com/eval/ASE_1252_DE/ase1252_de_win.zip 另外还有Sybase...ASE 12.5的客户端 ,当然在第一个下载地址中也包含了Sybase客户端,用户可以不用再专门下载客户端的。...创建表后如图所示: 在Sybase Central中好像没法像Management Studio一样直接打开表添加数据,只能够查询数据。...再回到Sybase Central中,左边选中tb1然后在右边选择“Data”选项卡,就可以看到刚才插入的数据了。...以上只是对Sybase ASE12.5的一个简单介绍,主要是为了实现SQL Server 2005与Sybase ASE的互联而准备的Sybase环境,由于本人是第一次接触Sybase数据库,所以写下本文一是方便想学习

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    主动学习加速分子模拟中的几何构型优化,附ASE优化器python包下载

    最近,卡内基梅隆大学的研究人员提出了一种基于神经网络集成的主动学习方法,可以同时加速多个分子模拟中的局部几何构型优化,计算数量减少了 50-90%,使研究人员能够在更少的时间内完成相同的工作。...因此,研究团队通过将先验数据集成到主动学习框架中,实验说明了通过使用神经网络集成在不同配置之间共享信息,与具有单一配置的主动学习相比,具有多种配置的主动学习可以实现进一步的加速,新模型将密度泛函理论(DFT...此外,该团队提供了一个原子模拟环境 (ASE) 优化器的 Python 包,以便更轻松地使用神经网络集成主动学习进行几何构型优化。 加速大量配置的主动学习的潜在方法 论文的通讯作者 John R....Kitchin 进一步解释说:「通常,当我们进行几何构型优化时,我们会从头开始,使得计算很少从我们过去所知道的事情中受益。通过在过程中添加智能体,我们使其能够依赖先前的计算,而不是每次都从头开始。」

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    【Linux】关于Linux中的权限

    而Linux的文件类型和后缀无关(后缀名可以作为提示,用户可以使用后缀区分文件类型),但是对linux来说区分文件和文件本身的后缀是无关的(但是gcc等工具对文件后缀可能有要求)。...开始之前,我们输入ll指令,来看看前面10个字符代表什么意思: 在linux中,是通过ll显示的众多属性列中的第一列的第一个字符来区分文件类型的。...则无法用ls等命令查看目录中的文件内容....可写权限: 如果目录没有可写权限, 则无法在目录中创建文件, 也无法在目录中删除文件 所以这也是为什么系统规定目录的起始权限从777开始,所有的目录被创建出来,一般都要能够被进入 换句话来讲, 就是只要用户具有目录的写权限..., 用户就可以删除目录中的文件, 而不论这个用户是否有这个文件的写权限。

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    Azure App Service 上的根证书

    原文:Amol Mehrotra 翻译:Edi Wang 导语 App Service 有一个受信任的根证书列表,您不能在 App Service 的多租户版本中修改这些证书,但您可以在应用服务环境 (...ASE) 的受信任根存储中加载自己的 CA 证书,这是一个单一 App Service 的租户环境。...在这种情况下,有两种解决方案: 使用远程服务器上 App Service 中受信任的根证书颁发机构之一颁发的证书。...如果无法更改远程服务终结点证书或需要使用私有 CA 证书,请将您的应用托管在应用服务环境 (ASE) 上并在受信任的根存储中加载您自己的 CA 证书 使用 Kudu 获取受信任的根证书列表 如何获取...接下来的步骤将取决于您使用的是 Linux 还是 Windows 应用程序。 Windows 转到 Debug console > Powershell,将出现一个 Powershell 窗口。

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    linux udp编程_linux中socket编程

    在前面的文件中,我们介绍了linux网络编程中与IP相关的知识和常用的函数总结,本文针对具体的UDP通信,来详细的介绍UDP通信的使用,包括UDP通信中的点对点通信,多播,广播等。...2、在上面的通信框架中,客户端并没有使用bind的操作,确实如此,因为客户端一般作为通信的发起者,都是主动往外发送数据,如1中的描述,这个过程由系统聪明的帮我们记录的端口信息,当服务端有数据回复的时候,...3、关于服务端的bind操作,在存在组播,多播等多种通信方式的情况下,也还有一些需要注意的点,这个我们在下面的章节中描述 二、UDP通信的基本函数说明 在UDP中,完成一个基本的通信涉及到的几个函数如下...IP信息,addr_size存放addr数据的长度,但是,在实际使用中,这样调用后,我们打印addr中的信息,确实一个错误的IP信息或者0.0.0.0这样的地址信息,这是什么原因呢,在那个男人的中的描述...但是我们在实际的使用中,通常只是某些主机对通信数据感兴趣,而不是整个局域网上的所有主机都需要这个数据,这种情况就需要组播登场了。 3.1、组播中的IP地址 组播的地址是特定的,D类地址用于多播。

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    Linux 在 linux 中搭建 FTP 服务

    service vsftpd restart # 关闭ftp服务 service vsftpd stop ---- 配置FTP服务 多数的VSFTPD配置项都在/etc/vsftpd.conf配置文件中。...这个文件本身已经有非常良好的文档说明了,因此,在本节中,我只强调一些你可能进行修改的重要选项。...使用man页面查看所有可用的选项和基本的 文档说明: man vsftpd.conf 根据文件系统层级标准,FTP共享文件默认位于/srv/ftp目录中。...write_enable=YES 允许本地(系统)用户登录: 为了允许文件/etc/passwd中记录的用户可以登录ftp服务,“local_enable”标记必须设置为YES。...在配置文件中增加/修改下面配置开启根目录限制(Chroot Jail): chroot_list_enable=YES chroot_list_file=/etc/vsftpd.chroot_list

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    【Linux】进程信号(中)

    在上一个文章中,关于信号的产生,还有没补充完的,所以在这篇文章补充一下 1.信号的产生 硬件异常产生信号 a/=0问题 创建mysignal.cc文件 #include using...当代码除0时,程序运行后就崩溃了,程序运行变为进程,进程运行代码时出现了非法代码,进程退出了 ---- 将内存中的指令数据load到CPU中 状态寄存器中有比特位表示当前计算的状态 CPU中有的寄存器保存未来的计算结果...2是 p作为nullptr,*p取的是内存中的0号地址 *p=100,相当于向0号地址处写入100,但是0号地址并没有申请过, 所以就造成了野指针问题 ---- 运行可执行程序后,发生段错误 --...容我慢慢来说 ---- Linux在系统级别提供了一种能力,可以将一个进程异常的时候, 操作系统可以将该进程在异常的时候,核心代码部分进行核心转储 (将内存中进程的相关数据,全部dump到磁盘中) 一般会在当前进程的运行目录下...1中运行可执行程序,在终端2中发送8号信号干掉进程,并出现core dump即核心转储 ---- 再次使用 ls -l 指令,发现多出来一个 core.2257的文件 即核心转储文件 ---- Term

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    聊聊Linux IO(中)

    由图可见,从系统调用的接口再往下,Linux下的IO栈致大致有三个层次: 1.文件系统层,以 write(2) 为例,内核拷贝了write(2)参数指定的用户态数据到文件系统Cache中,并适时向下层同步...3.设备层,通过DMA与内存直接交互,完成数据和具体设备之间的交互 结合这个图,想想Linux系统编程里用到的Buffered IO、mmap(2)、Direct IO,这些机制怎么和Linux IO栈联系起来呢...假设要去读一个冷文件(Cache中不存在),open(2)打开文件内核后建立了一系列的数据结构,接下来调用read(2),到达文件系统这一层,发现Page Cache中不存在该位置的磁盘映射,然后创建相应的...然后请求继续到达块设备层,在IO队列里排队,接受一系列的调度后到达设备驱动层,此时一般使用DMA方式读取相应的磁盘扇区到Cache中,然后read(2)拷贝数据到用户提供的用户态buffer中去(read...除了传统的Buffered IO可以比较自由的用偏移+长度的方式读写文件之外,mmap(2)和Direct IO均有数据按页对齐的要求,Direct IO还限制读写必须是底层存储设备块大小的整数倍(甚至Linux

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