作为一名测试人员,在测试过程中,我们需要去部署测试环境,查看服务器上面的日志,登陆数据库,甚至做一些shell脚本类的工具开发,必不可少都会用到Linux命令。所以无论是开发还是测试,Linux命令已经成为常规操作,很有必要去学习。
NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step))、批次效应处理等内容。
今天要和大家分享一份Ubuntu使用教程,帮助大家快速掌握这个功能强大、易于上手的Linux操作系统。无论是对于新手还是已有一定Linux基础的用户,这篇教程都将提供清晰的步骤和详细的内容,让您轻松上手Ubuntu。
生物信息的学习离不开Linux系统,不管自己写命令处理数据,还是使用现有的工具。Linux对我们来讲最重要的是它强大的命令行功能,可以快速、批量、灵活的处理数据的提取、统计和整理等耗时耗力的重复性工作。事实上在日常生信分析中,多数整理工作也都是用Linux命令的组合完成的,相比于写完整的Python或Perl程序更简便快捷;另外,生信分析用到的工具大都只在Linux下运行,而Linux发行版众多,更新速度不一,软件的安装是一个令人头大的事情。
Linux/UNIX中的sed命令是Stream Editor文本流编辑的缩写,它能同时处理多个文件多行的内容,比如文搜索,查找和替换,插入或删除。虽然sed命令在Linux/UNIX中最常见的用途是替代或查找。通过使用sed,您甚至可以在不打开文件的情况下编辑文件,这比先在VI编辑器中打开文件然后更改文件要快得多。
“too many open files”这个错误大家经常会遇到,因为这个是Linux系统中常见的错误,也是云服务器中经常会出现的,而网上的大部分文章都是简单修改一下打开文件数的限制,根本就没有彻底的解决问题。
把cdrom挂载到mnt下的cdrom下,如果提示cdrom不存在,则mkdir /mnt/cdrom
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当你要执行一个linux命令,在这个命令参数选项众多时,你一般怎么做?对,我们大多数人都会去求助man命令。此外,linux上帮助相关的命令还有”help””whereis””whatis”等命令。
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---- 今天分享一下在linux系统在实现对文件读写一些基本的操作,在这之前我们要掌握一些基本的技能在Linux环境。比如查看命令和一个函数的具体用法,就是相当于查手册,在Linux下有一个man手册非常有用: man查询手册 man 1 +命令 这里的1表示为查询的是Linux命令 man 2 xxx 这里的2表示为查询的是linux api man 3 xxx 这里的3表示为查询的是c库函数 在了解了这个后我们就可以开始来实现标题说的操作了。 一、在linux环境下常用文件接口函数:open、close、write、read、lseek。 二、文件操作的基本步骤分为: a、在linux系统中要操作一个文件,一般是先open打开一个文件,得到一个文件扫描描述符,然后对文件进行读写操作(或其他操作),最后关闭文件即可。 b、对文件进行操作时,一定要先打开文件,然后再进行对文件操作(打开文件不成功的话,就操作不了),最后操作文件完毕后,一定要关闭文件,否则可能会造成文件损坏 c、文件平时是存放在块设备中的文件系统中的,我们把这个文件叫做静态文件,当我们去打开一个文件时,linux内核做的操作包括:内核在进程中建立了一个打开文件的数据结构, 记录下我们打开的这个文件,内核在内存中申请一段内存,并且将静态文件的内容从块设备中读取到内存中特定地址管理存放(叫动态文件) d、打开文件后,以后对这个文件的读写操作,都是针对内存中这一份动态文件的,而不是针对静态文件的。 当我们对动态文件进行读写后,此时内存中的动态文件和块设备中的静态文件就不同步了, 当我们close 关闭动态文件时,close内部内核将内存中的动态文件的内容去更新(同步)块设备中的静态文件。 三、为什么是这样操作? 以块设备本身有读写限制(回忆Nandflash、SD、等块设备的读写特征),本身对块设备进行操作非常不灵活。而内存可以按字节为单位来操作。而且进行随机操作。 四、文件描述符是什么? 1、文件描述符:它其实实质是一个数字,这个数字在一个进程中表示一个特定的含义,当我们open打开一个文件时,操作系统在内存中构建了一些数据结构来表示这个动态文件,然后返回给应用程序一个数字作为文件描述符,这个数字就和我们内存中维护这个动态文件的这些数据结构挂钩绑定上了。以后我们应用程序如果要操作这一个动态文件,只需要用这个文件描述符进行区分。简单来说,它是来区分多个文件的(在打开多个文件的时候)。 2、文件描述的作用域就是当前的进程,出了这个当前进程,这个文件描述符就没有意义了。 五、代码实现: 1、打开文件:
虽然计算机相关专业,操作系统和计算机组成原理是必修课。但是大学时和真正从事相关专业工作之后,对于知识的认知自然会发生变化。还很有可能,一辈子呆在学校的老师们只是照本宣科,自己的理解也不深。所以今天我站在真正排查解决问题时的需要层面,用白话说一说linux操作系统的那些知识。
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打算给我们部门弄个内部分享。发现大家对一些底层知识的认知停留在一句一句的,比如听说JVM使用-XX:-UseBiasedLocking取消偏向锁可以提高性能,因为它只适用于非多线程高并发应用。使用数字对象的缓存-XX:AutoBoxCacheMax=20000比默认缓存-128~127要提高性能。对于JVM和linux内核,操作系统没有系统的概念,遇到实际问题往往没有思路。所以我的内部分享,主要分为linux部分,jvm部分和redis部分。这篇是linux篇。学习思路为主,知识为辅。我也是菜鸟一枚~~
我们在写代码的过程中,免不了会对代码进行一些修修改改。但经常会出现改着改着,就不知道改完后与源文件的差异是怎样的。这里,我们就需要一个文本比对工具来进行文本比对。
AT&T公司于20世纪70年代发布了UNIX系统。经过多年的发展,Unix不再是某一个具体操作系统的名称,而是对遵循Unix规范、设计和哲学的一类操作系统的统称。还有一些操作系统,它们遵循Unix设计、有着与Unix类似的规范和标准,这些操作系统被称为类Unix系统(Unix-like),Linux就是其中的一员。
从事过软件测试的小伙们就会明白会使用Linux是多么重要的一件事,工作时需要用到,面试时会被问到,简历中需要写到。 对于软件测试人员来说,不需要你多么熟练使用Linux所有命令,也不需要你对Linux系统完全了解,你只需要学会一些常用的基本命令,这些命令足够支撑你去查看日志,定位bug,修改文件,搭建环境就完全OK了。对于Linux系统底层的实现不需要了解,甚至对于绝大多数的命令都不需要知道。 我们是如何在我们的工作中使用Linux呢? 相信很多人都知道,之所以我们会用到Linux,是因为我们的产品将Lin
If you change nothing, nothing will change
本章介绍的软件都是我在工作,生活中用到的。不是亲测也不会推荐的。拥有了这些软件,你的电脑使用效率就会大大提高。
本文章适合安装过centos及有一定Linux命令基础,有问题欢迎评论区询问和私聊。
提醒:尝试对passwd文件进行修改练习时,不要直接修改,先拷贝一个到根目录,再进行练习操作
对于IT运维人员来说,和命令打交道是必不可少的事情,拥有一个好用的CMD命令行工具,对提升效率是非常有必要的,今天给大家分享Windows常用的命令行客户端,希望对大家能有所帮助!
如果你曾使用过一些新的支持Arduino的硬件平台进行开发,那么可能你已经在你的项目中使用了在线的IoT服务。在这篇文章中,我会演示如何通过搭建一个虚拟专用服务器(VPS)并配置一些软件来为你的Arduino IoT项目提供服务。
1. 首先安装官方的cmd工具 go get fyne.io/fyne/cmd/fyne 验证: fyne 2. 准备好有效的字体文件(.ttf) 3.将字体文件转为go文件 fyne bundle Alibaba-PuHuiTi-Medium.ttf > bundle.go 4. 自动写入头 (head 命令是linux命令,win下需要在git bash中调用) head -n 9 bundle.go //文件 bundle.go (文件中无此句) // auto-generated // Co
在日常使用Linux命令时候,经常使用重定向或者管道的方式处理命令的结果。以前对这两个命令的使用场景存在一些困惑,所以本文对这两个命令进行详细的总结。
函数open(filename,mode)用于读取文件,返回一个file object。 所以现在我们的f是一个文件对象
每一个行业都有它自己的一些工具。软件行业也不例外。一个好的程序员比其他人更加熟悉那些工具,也能比一般的程序员更善于使用那些工具。但是,有一些工具你希望每一个软件开发人员都知道。下面清单列出了这样的一些工具。
德国科技管理专家斯坦门茨早年移居美国,他以非凡的才能成为美国企业界的佼佼者。一次,美国著名的福特公司的一组电机发生故障,在束手无策之时,公司请斯坦门茨出马解决问题。
首先问大家一个问题:程序员的你,编程也有一段时间了,那么你觉得一行代码,在实际编程过程中,能起到多大作用?能干成哪些事情?
在这一部分中,我们主要介绍几个常用的命令,让大家快速感受以下Linux指令的操作方式。主要包含以下几个指令:
Android凉了?前段时间刚更新了新的Logo,换了新的叫法,现在Android 10终于向亲儿子系统进行了推送。更安全,更好,更强的版本来袭,他是真的凉了吗?
对于Qt的初学者来说,Qt有很多不熟悉的地方,安装和使用时,都会遇到各种各样的“坑”。这些坑,如果经历过一次,就会发现其实是很简单的问题。但是如果不熟悉,那么可能折腾很久也没解决。因此我把我自己遇到的(也是后来常常被问到的)一些问题放在这里,供大家参考、讨论。
需要注意的是文件描述符 0 通常是标准输入(STDIN),1 是标准输出(STDOUT),2 是标准错误输出(STDERR)
Windows作为日常办公绝对是垄断地位,强大的生态链和易用性让用户工作起来很方便,但是作为一个程序开发者, Linux系统才是王道,但是Linux的局限性,使人们也离不开windows, 所以会采用PC上安装双系统或者在Windows里面安装虚拟机跑Linux系统,双系统不能做到同时共存,虚拟机又比较卡顿,所以使用WSL,即在Windows安装Linux子系统成为了很多人的选择,本文主要介绍如何开启WSL和安装Linux系统,让windows和linux共存。
文章更新: 20161025 初次成文 20170422 微小修正 问题提出: 因为小苏在很久之前就听说在安卓上可以跑Linux系统,期间各种工具也试了很多(包括这个),但是要么是使用方法不得当,要么是和ROM不兼容,总之是一直都没成功,所以这类软件总是下了用,用了卸,想起来的时候再下了用...无限循环。直到之前,看了一篇简单的关于Linux Deploy的使用教程之后茅塞顿开,在Android上成功跑起了Ubuntu,所以写这篇文章来记录一下。 解决方案: Linux Deploy
相信不少小伙伴都曾经用过/偶尔使用Windows下的命令行终端(可按键盘组合键win+R然后输入cmd启动)
作为一个程序开发者,无论你是前端开发也好,后台开发也罢。都避免不了使用Linux操作系统,那就更避免不了使用终端命令,其实也就是shell命令。今天就总结一下使用Linux的入门命令也就是常用命令。
很多用户除此之外,还喜欢Linux命令行~但是CMD的命令和Linux命令行有许多差别!
1.创作背景 在我们日常做项目的时候,避免不了的一件事就是进行项目的更新部署,如果是windows服务的话,还是没什么苦恼的,但是如果服务器是linux的话,部署系统的时候,每次都需要输入一堆的命令,进出文件目录,很繁琐,也很浪费时间,有时还需要修改文件里面的配置信息,因为开发环境和正式环境不一样,有时还需要修改文件里面的配置信息,这一切的原因促使我有了一个想法:就是利用批处理帮我实现自动化部署的需求 2.技术简介 本次写的脚本主要是利用了Windows环境下使用SSH的开源图形化SFTP客户端 WINSC
---上一篇文章我们详细的讲解了lseek函数的用法,其实还是那句话,在linux系统下,对于一个陌生的命令、函数、库函数,完全可以用man手册去查看,为了给大家了解一些基本的linux命令使用,这里
我是中途退学进入这个行业的,算是半路出家,入门还是得从我在学校的专业说起,我在学校的专业是自动化,需要学习一门编程语言,C语言,这是我接触的第一门语言,也是我最喜欢的语言,最初学习C语言是为了学习单片
在Windows环境下用Notepad++写了个shell脚本,上传到Linux平台后运行报错如下:
今天的学习内容是Linux,主要学习的是一些Linux命令行。在windows电脑上使用Linux的方法有很多,这次学习特别要感谢花花和豆豆老师提供的云服务器。首先需要下载Xshell软件,填写账号和密码之后就进入到服务器系统。
我们安装的 Ubuntu 是桌面版本,这样我们可以像在 windows 系统下操作一样,相对于平时所说的 Linux命令行下操作来说,这种体验非常舒适。但是一般我们使用 Linux 都是在命令行下进行操作,所有的操作我们的都可以通过输入命令来完成,绝大多数情况下使用命令行来操作 Linux 系统比通过在 GUI 下操作的效率高很多,虽然说我们使用的 Ubuntu 是包含了 GUI 的 Linux 发行版,然而我们可以像在 windows 下那样唤出 Ubuntu 的终端,打开 Ubuntu 的终端非常简单,以我们使用的 Ubuntu18.04 为例,有有种方法可以直接在 Ubuntu 的用户界面下。
前面我们讲解了在Ubuntu图形界面下怎么新建目录、新建文件等等。 来提个问题:除了这个图形界面,Ubuntu下面有没有其它的方式也可以创建目录、创建文件呢? 我们回到比较熟悉的Windows界面,或许大家听说过dos命令行工具,没有听说过也没关系,同时按下“Windows键”和“R键”,输入cmd,再点击“确定”,就出现了命令工具。
微软6月26号发布core 1.0版本后,园子里关于这方面的文章就更加火爆了,不管是从文章数量还是大家互动的热情来看,绝对是最热门的技术NO.1。我从去年底开始接触.net core到现在也大半年了,一直停留在浏览各种帖子上,偶尔新建个项目敲几行代码练习一下。可是对于core最大的卖点——跨平台,一直没法实际体验一回,因为压根没接触过Linux,完全不会那些命令,甚至虚拟机都没玩过,想在Linux上实战操作一下可想有多困难。虽然园子里很多文章都有教程,但大神们一开始直接就上各种命令代码,看不懂啊,不知道怎么下手。。。可是这些都不是阻挡自己的理由,那就从装虚拟机开始一步一步来吧,中间各种蒙逼踩坑请教,于是有了这次的总结记录。
文章目录 1、文件的基本操作 2、文件的读取操作 3、文件的写入操作 4、文件的追加操作 5、文件读写模式拓展(了解,看到能明白意思即可) 6、文件备份案例 7、rename和remove 8、文件夹的操作 9、批量修改文件名案例 10、面向对象的思维方式 11、类和对象 12、类的定义 13.类的实例化 14、self 1、文件的基本操作 文件打开的格式: file = open(文件路径,读写模式) 文件路径:可以写相对路径,也可以写绝对路径 读写模式:r(读取) w(写入) a(追
今天第一次接触这个vim文本编辑器,拿到一个陌生的工具,我们想的当然是最短的时间掌握它的基本操作,体会到成就感。如果你跟我一样,那么这篇教程或许对你有所帮助。
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