背景 使用服务器的R语言，安装poppr包过程中，报错： In file included from vendor/cigraph/src/community/optimal_modularity.c...解决方案 1.安装Glpk到用户目录，用于R依赖 cd ~ wget http://ftp.gnu.org/gnu/glpk/glpk-4.54.tar.gz tar xfzv glpk-4.54.tar.gz.../src/contrib/Rglpk_0.6-5.1.tar.gz tar xvf Rglpk_0.6-5.1.tar.gz 3.让R可以识别到依赖 因为我的R安装是使用conda安装的，所以我先激活了环境...移动文件，并设置变量，让R可以识别到依赖。...R CMD INSTALL Rglpk 安装完，Rglpk则可以正常使用，依赖于Rglpk的其他R包也可以正常安装了。 写在最后：有时间我们会努力更新的。
为什么要在Linux下安装ASP环境？且看这几个原因够不够： A. 作为Linux下的开发环境 B....在Linux下安装ASP环境必须的环境支持为： Apache+Apache的perl模块+perl的Apache::ASP包，请看安装步骤： 1.安装Apache::ASP(也可在第3步之后安装) perl...： perl Makefile.PL make make test make install 2.安装Apache, 在Linux环境下模拟ASP环境目前仅能查到Apache+ASP的方案 #下载...Linux下要用的主用环境，主用环境是Nginx，所以将Apache监听端口修改为80端口之外的端口，我修改为81 Listen 81 网站根目录也需修改成Nginx网站根目录，例如我的Nginx网站根目录为...PerlSetVar StateDir /tmp/asp ok，ASP环境安装完成，启动Apache试试:) /usr/local/apache/bin/apachectl start
说明 R 语言是一个功能十分强大的工具，几乎绝大多数的数据分析工作都可以在 R 中完成，并且拥有很极强的绘图功能支持，能让你手中的数据以各种姿势进行可视化呈现，而且支持 Windows、Mac OS、Linux...安装完成之后，你将会看到一个朴实无华的图标，没错，这就是 R 语言本尊了。 ?...R 语言简单实例 主要工作已经完成，让我们动动小手，优雅的单击（或双击）R Studio 图标，来感受一下R 语言的魅力。...小结 到此为止，R 语言就已经顺利的收入囊中了，恭喜你，又掌握了一门语言（的 Hello world）了。...【此处应有掌声】 接下来，会继续介绍 R 语言的基本用法和其中比较重要的函数使用方法，目标是能使用 R 语言对数据进行初步分析，以便能在生活和工作之中有所应用。
R R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。...简单来说，R是一门统计计算语言，是一套开源的数据分析解决方案。...anaconda安装R 最开始接触Anaconda，应该是18年3月，还是在机器学习的时候用过，Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版，支持 Linux, Mac, Windows系统...，提供了包管理与环境管理的功能，可以很方便地解决多版本python并存、切换以及各种第三方包安装问题。...R语言的注释 “#”后面的内容表示注释； 如果有多行注释则在每一行注释前加上“#” 在注释行结尾加上4个“#”，则这一行会被当做一个节标题 2.函数调用 head(iris) # R语言语法
背景 R 语言已经广泛的应用与生物信息分析中，包括 RNAseq，单细胞，生物统计，绘图等都要用到 R 语言。R 语言是生物信息分析平台重要的组成部分。...本章节中我们将在服务器中配置完整的 R 语言分析环境。...#利用 bioconda 安装 R mamba install -y r-base 还可以编译安装R语言，之前介绍过 #下载 wget https://cloud.r-project.org...{R_VERSION}/bin/Rscript /usr/local/bin/Rscript 二、安装 Rstudio-server Rstudio 是 R 的集成开发环境，非常的好用，...在配置 Rstudio-server 之前需要注意，首先需要安装 R 软件。另外使用免费版本的 rstudio-server 软件只能使用一个版本的 R 语言。
1找到并打开打开R语言官网 2点击主页面上的download R 3在跳转的镜像界面，下拉选择中国的镜像，这里选择第一个清华大学地址。...4根据自己的操作系统选择相应的版本，选择 Download R for Windows 5在base一行，点击 install R for the first time 6...点击Download R 3.3.3 for Windows，保存，然后双击安装程序像其他软件一样按照提示进行正常安装即可。...7 选择下载地址，尽量安装在非C盘 8 安装地址不要出现中文，否则会有意外错误。其他安装按照默认即可。...9 打开R软件，看到这个页面即代表安装成功。 image.png
一、R语言安装 首先进入官网：https://cran.r-project.org 下载相应版本的安装包 点击base 点击Download R4.1.2 for Windows，即可开始下载...下载完成后，点击该安装包，开始下载 我要安装的是64bit，把32bit的勾划掉，继续点击下一步，直到安装完成 二、Rstudio安装 下载地址为：Download the RStudio...IDE – RStudio 点击free下的download 选择合适的版本，开始下载安装包 下载完成后，点击安装包，开始安装 点击下一步，直到安装完成 发布者：全栈程序员栈长，转载请注明出处：
最近星球里面的小伙伴提到了一个问题，如何安装老版本的R3.6，Linux系统。...安装是可以的，但是安全的安装是值的推荐的，所谓安全的安装，就是不和系统已有的R语言和R包有冲突，不能把现有的系统搞崩了…… 所以，写篇博客，介绍一下。...对方没有说话，发送了一个链接，走了…… 1，系统中需要有conda环境 如果没有，安装一个，这里不做介绍。 2，看一下conda中能不能搜索到R3.6 如果没有，可以设置一下condarc。...3，不要直接用conda安装，新建一个conda环境（非常重要） conda create -p ~/R3.6 conda activate ~/R3.6/ 激活后，显示：R3.6： 4，安装R3.6...conda install r-base=3.6.0 -c pkgs/r 点击y之前，确保是R3.6 测试一下R语言： (/home/gwas/R3.6) [gwas@192 ~]$ R
_64/mariadb-10.5.0-linux-systemd-x86_64.tar.gz 首先把安装包下载到本地，然后解压到/usr/local目录： tar -zxvf mariadb-10.5.0...-linux-systemd-x86_64.tar.gz -C /usr/local/ ln -s /usr/local/mariadb-10.5.0-linux-systemd-x86_64/ /usr...Examinethelogsin /udata/mariadbformoreinformation. … 说明系统缺少组件库libaio，需要安装手动安装： # centos yum install libaio...如果修改了socket的路径，还要修改[mysql]和[mysqladmin]段的socket路径，要和[mysqld]中的socket路径一致 设置路径权限： chown mysql.mysql -R.../usr/local/mysql /appdata/mysql 1 chownmysql.mysql-R/usr/local/mysql/appdata/mysql 添加mysql命令到系统路径，修改/
ggbiplot画主成分图的案例，让人印象很深，但是用起来好像没那么容易，需要在github上下载安装。但是，ggbiplot在安装的时候经常遇到问题。...按照网上的安装流程： install.packages("devtools") library(devtools) install_github("vqv/ggbiplot") 但是总有许多问题，比如：...library(devtools) Error in library(devtools) : 不存在叫‘devtools’这个名字的程辑包 如果只是警告还好，不过总是无法安装这个库就让人头疼了。...有人说到github直接下载ggbiplot 尝试之后首先警告，R版本不对，升级R到最新版本后，依然提示不对 install.packages('D:/ggbiplot-master.zip') Installing...最后意外在R的提醒中发现，需要安装 usethis 的包 再次重试： install.packages('usethis') library(usethis) install.packages('devtools
1、下载安装 arch： yaourt -Sy --noconfirm go 其他的可以官网下载安装： https://golang.org/dl/ （可能需要访问外国网站，o(╯□╰)o）...golang版本查看 go version 3、开发工具 推荐使用JetBrains的GoLand 4、GoLand中设置GOROOT、GOPATH GOROOT : golang安装后的根目录...GOPATH变量可以同时制定多个目录，这些目录在Mac和Linux系统上通过:分隔，而在windows系统上通过;分隔。在大部分情况下都将是第一个路径优先。
导语 GUIDE ╲ 你是否有过这样的困扰：想使用一个R包，但由于没有root权限而感到束手束脚？ 别慌……你只需要用自己的账户重新安装一款R软件，进入到自己目录下的R就可以自由安装R包啦！...背景介绍 非Root权限的账户在linux上安装R时，会遇到各种各样的问题，小编作为资深“踩坑”专家，今天就好好为大家“排排坑”！...配置环境所需文件 在配置环境时，你可能用到的文件及下载地址有（可以直接用wget+下载地址获取）： 环境配置 01 安装R语言（以3.6.2 version为例） 首先将R-3.6.2.tar.gz.../xz-5.2.2/lib -Wl,-rpath=/your/path/bzip2-1.0.6/lib -Wl,-rpath=/your/path/xz-5.2.2/lib make instal R语言安装成功后...安装R包命令1： if (!
0x00 安装环境和GO版本 本篇是源码安装，非使用包管理工具安装。...# Centos 7.4 # GO v1.11.2 0x01 下载GO安装包 # wget https://dl.google.com/go/go1.11.2.linux-amd64.tar.gz 或者直接下载...0x02 安装GO 执行tar解压到/usr/loacl目录下，得到go文件夹 # tar -C /usr/local -zxvf go1.11.2.linux-amd64.tar.gz 添加/usr...loacl/go/bin目录到PATH变量中，添加到/etc/profile 或$HOME/.profile都可以 // 习惯用vim，没有的话可以用命令`sudo apt-get install vim`安装一个...local/go export PATH=$PATH:$GOROOT/bin // wq保存退出后source一下 source /etc/profile 执行go version，如果现实版本号，则Go环境安装成功
首先做一件事——Seurat降级 原因就是这篇文章使用的是Seurat V2，想用V3也可以做，只不过想更好地重现文章代码 两步走：删除原文件（直接remove.packages删掉原来包的文件夹）+ 源代码安装...remove.packages('Seurat') pkgs = c( 'mixtools', 'lars', 'dtw', 'doSNOW', 'hdf5r' ) BiocManager::install...(pkgs,ask = F,update = F) # 以后只需要修改这个版本号即可 packageurl <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive...packageurl, repos=NULL, type="source") # 最后检查一下包的版本 library('Seurat') packageVersion('Seurat') 有个问题，怎么自己去寻找要安装包的路径呢...step3：自由安装想要的版本（右键复制链接赋给上面的packageurl） ?
PART1 开篇前言 本期R语言教程，暂定分为两大部分：第一部分为“R语言快速入门和数据处理”，第二部分为“R语言可视化及绘图”。...关于R和RStudio安装在这里就不再介绍了，网上有很多相关内容，如果安装过程有困难可以后台私信我。 PS.本次内容为R包安装及初识向量。 ? PART2 R包安装 问：什么是R包？...答：包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合。它们提供了种类繁多的默认函数和数据集。...（对于刚接触R的同学来说可能看起来比较抽象，但是没关系，我们会在后续的学习中慢慢了解R包的概念） 1.R包安装：第一次安装一个包，使用命令install.packages()即可。...中 2.R包载入：安装完成后，想要调用这个包中的命令、数据等信息，就需要先载入这个包，需要用到的命令为library()。
和Linux。...双击打开就是R语言的交互界面了。 ? 环境变量的配置 我的电脑》》右键》》属性》》高级系统设置 ? 高级模块下选择环境变量 ? 在系统变量中找到Path变量，点击编辑 ?...Rstudio安装 R语言是用于统计分析，图形表示和报告的编程语言和软件环境；Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一。...下载后安装和安装其他软件一样，这里就不多说了。如果在安装Rstudio之前已经安装R，那么Rstudio会自动配置好R环境。...请注意在windows、unix、macOS操作系统下安装文件的后缀名是不一样的： 1）linux环境编译运行：tar.gz文件 2）windows 环境编译运行 ：.zip文件 3）MacOS环境编译运行
语言环境安装 软件的安装常用三种方式 1. 在线安装 这种安装方式是通过系统提供的安装工具，自动下载安装包，并自动安装到系统的固定目录下 2....离线源码安装 在本地对源码进行make操作，将其编译为二进制的可执行程序。并将其copy到执行的目录下并加入到PATH环境变量中 以上对三种安装的原理做了简单的阐述。go语言环境同样适用。...选择喜欢的安装方式，在go语言中文网下载对应的包，安装以上的说明进行安装 GOPATH环境变量 GOPATH是一个go语言的环境变量，官方给出的说明 The GOPATH environment variable...简单的说，就是go语言依赖的一个环境变量，在编译时会在该目录下查找第三方依赖的包 在1.11版本之前，需要引用第三方包的项目需要将代码放到该目录下，在该路径下存在三个目录 ~/go tree -L...sublime内置python脚本语言，可以进行宏命令和插件的开发，也是小编平时使用最多的工具 使用sublime作为go开发工具，只需要安装godef(用于代码跳转)和goSublime(go工具集)
语言环境安装 软件的安装常用三种方式 1. 在线安装 这种安装方式是通过系统提供的安装工具，自动下载安装包，并自动安装到系统的固定目录下 2....离线源码安装 在本地对源码进行make操作，将其编译为二进制的可执行程序。并将其copy到执行的目录下并加入到PATH环境变量中 以上对三种安装的原理做了简单的阐述。go语言环境同样适用。...选择喜欢的安装方式，在go语言中文网下载对应的包，安装以上的说明进行安装 GOPATH环境变量 GOPATH是一个go语言的环境变量，官方给出的说明 The GOPATH environment variable...简单的说，就是go语言依赖的一个环境，在编译时会在该目录下查找第三方依赖的包 在1.11版本之前，需要引用第三方包的项目需要将代码放到该目录下，在该路径下存在三个目录 ~/go tree -L 1...sublime内置python脚本语言，可以进行宏命令和插件的开发，也是小编平时使用最多的工具 使用sublime作为go开发工具，只需要安装godef(用于代码跳转)和goSublime(go工具集)
下载安装包到官网找到go的安装包，根据操作系统和架构，选择对应的包。...这里以linux为例解压将下载下来的二进制包解压到/usr/local/目录下tar -zxvf go1.19.13.linux-amd64.tar.gz -C /usr/local/修改环境变量vim...~/.bash_profile将/usr/local/go/bin添加到PATH中如果环境中已经存在预装的其他版本的go，又想优先使用新安装的版本。...那么可以把/usr/local/go/bin添加到PATH的前面go环境的一些配置go env -w GO111MODULE="on"go env -w GOPROXY="https://goproxy.cn...这个值一般不需要修改GOROOTgo语言的安装目录，这个值切记不用修改，保持默认即可GOSUMDB官方设定的go module校验库。服务器地址为sum.golang.org。
最近需要在内网的windows环境下部署R分析平台，内网遇到的最大困就是安装R语言的软件包和对应的依赖包。...第一步 先下载安装包和依赖包Getpackage <- function(packs){ packages <- unlist( tools::package_dependencies(packs...zip压缩包复制到内网环境下，我这里以D:/packages目录为例。...# 内网环境下library(tools)install.path <- 'D:/packages' write_PACKAGES(install.path, type='win.binary')mypackages...<- c('tidyverse') # 需要安装的包名install.packages(mypackages, contriburl = paste('file:',install.path,sep
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