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1
回答
在"|“上使用tidyr分隔时出现问题
、
我有一个这样的对象
lncRNA
_lengths:# A tibble: 1,071 x 33 align_id:155143|asmbl_162 524
lncRNA
5 align_id:155226|asmbl_245 386
ln
浏览 64
提问于2018-12-11
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2
回答
R根据特定值是否在B列中筛选A列
、
、
例如,我有一个如下的df:但这两种方法都不能给我所需的输出。他们分别生产这些 Annotati
浏览 13
提问于2020-05-13
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1
回答
使用unite进行整齐的评估,以打开嵌套的列表数据集
、
、
", "
lncRNA
", "
lncRNA
", "
lncRNA
",
浏览 5
提问于2020-09-16
得票数 0
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1
回答
在python中使用try,但从服务器返回400个错误请求
、
、
、
= request.files['
lncRNA
_file_name'] mRNA_file_name = Case_ID+secure_filename(mRNA_file.filenam
浏览 0
提问于2017-12-31
得票数 0
2
回答
替换和删除行名中的部分字符串
*
lncRNA
.*|.*snRNA.*|.*snoRNA.*|..*", rownames(df))] <- c("
lncRNA
","snRNA","snoRNA","precursor_RNA") [3208] "URS000075AF9C-snoRNA_GTATGTGTGGACAGCACTGAGACTGAGTCT[3210] "URS000075B029-snRNA_ATTTCCGTGGAGAG
浏览 0
提问于2016-10-06
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2
回答
比较两列不同的文件,如果匹配linux,则打印
、
LINC02211 GTF2F2 SOX4head file2.txtAL137139.3
lncRNA
AL162231.5
lncRNA
AC010184.1
lncRNA
浏览 0
提问于2020-04-26
得票数 0
1
回答
迭代两个不同长度的数据帧列表,并将它们作为数据帧连接在一个循环中,以执行一个函数
、
、
correlations = pd.DataFrame() for
lncRNA
'_lncRNAs' in column]: correlations = correlations.append(pd.Series(pearsonr(df[PC],df[
lncRNA
]),index=['PCC', 'p-value
浏览 19
提问于2020-07-17
得票数 2
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1
回答
MediaWiki解析器函数#if用于未定义的模板参数
、
为此,我要:显然,{transcript.
lncrna
}}是空的,它什么也不包含。
浏览 0
提问于2014-10-09
得票数 6
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1
回答
如何将计数对象的标识粘贴到R中的新列中?
ENSG02","ENSG03","ENSG04","ENSG05")data <- data.frame(genes, biotype) genes biotype 1 ENSG01
浏览 6
提问于2022-07-27
得票数 1
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1
回答
包含Snakemake的目录中缺少输入文件
、
assembly = TACO_DIR + "assembly.gtf", output: shell: "./FEELnc_filter.pl -i {input.assembly} -a {input.annotation} > {output.candidate_
浏览 18
提问于2019-08-14
得票数 0
2
回答
用于比较不同数据集之间值的一个比迭代更好的解决方案
、
、
这是全部功能"""isolates CAGE peaks that match an
lncRNA
"""
lncRNA
['p
浏览 5
提问于2020-07-17
得票数 0
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3
回答
嵌套for-循环的data.table替代品?
、
、
、
我有两个矩阵diff.exp.protein.expr和
lncRNA
.expr,每个矩阵都有64列,但行数不同。>dim(diff.exp.protein.expr)[1] 7600 64lm.anov
浏览 4
提问于2014-04-24
得票数 0
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1
回答
从PUBMED
数据库
一次传递多个关键字获取数据
、
、
] data = response.text keywords_list = ["
lncRNA
浏览 6
提问于2021-11-04
得票数 1
4
回答
如何根据条件在python中的列上拆分74行和3234列
、
、
def correlation_analysis(
lncRNA
_PC_T): Function for correlation analysis correlations= pd.DataFrame() for PC in [column for column in
lncRNA
_PC_T.columns if '_PC' in column]:for
lncRNA
in [column for colum
浏览 5
提问于2020-07-16
得票数 0
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1
回答
在Python中使用lxml,我需要在输入xml文件中将"RNA“替换为<mark>RNA</mark>。代码如下
、
lxml.etree as ETimport re anotherString = re.sub(r'\b'+
lncrna
.lower()+'\\b', '<
浏览 2
提问于2015-01-20
得票数 1
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2
回答
当列包含字符串时使用awk提取行
、
ENST00000473358.1;Parent=ENSG00000243485.5;gene_id=ENSG00000243485.5;transcript_id=ENST00000473358.1;gene_type=
lncRNA
;gene_name=MIR1302-2HG;transcript_type=
lncRNA
;transcript_name=MIR1302-2HG-202;level=2;transcript_support_leveltranscript_id=ENST00000473358.1;gene_type=transcribed_u
浏览 20
提问于2022-09-15
得票数 0
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2
回答
使用sapply在R中使用数据帧列表的多个ggarrange图
、
、
、
我有一份清单: sample2 <- data.frame(gene_biotype= c("protein_coding", "
lncRNA
", "intr
浏览 0
提问于2020-10-05
得票数 1
1
回答
执行检查点中间命令
、
rule gtf_to_fasta: ¦ "split_gtf_file/{sample}/{sample}_{i}.gtf" ¦ "
lncRNA
_fasta¦ "gffread -w {output} -g {reference} {input}" input: ¦ "
lncRNA
_fasta/{sample}/c
浏览 16
提问于2019-05-24
得票数 2
回答已采纳
3
回答
如何将包含等号的新元素添加到R中的字符向量中
、
我有一个包含基因及其相关颜色的字符载体:我正在尝试查看另一个基因列表,如果这个基因还没有包含在载体中"IG_V_gene" [5] "IG_V_pseudogene" "
lncRNA
浏览 14
提问于2022-06-13
得票数 1
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2
回答
如何将x轴值转换为matplotlib条形图的图例
、
、
、
、
def graph_average_expressions(TAD_matches, CAGE): )#finds expression level for peaks in an
lncRNA
top 15 highest expression levels for all aver
浏览 0
提问于2020-07-16
得票数 0
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