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使用Miniconda配置python虚拟环境

用到了不同版本,以及适合于32位、64位机器的版本,电脑上的python有点乱,安装的第三方库也不知道去哪了,有时候安装了也不能用,大概率是使用pip的时候,安装到其他版本的python那儿去了,然后学了一下miniconda...首先在miniconda官网下载适合自己的版本,然后进行安装,安装过程中有个设置环境变量的选项,可选可不选吧,反正我安装了几次,选与没选都可以在终端中使用,如果不能在终端使用的话,就手动配置一下环境变量...配置方法如下: 右击此电脑->属性->高级系统设置->环境变量->系统环境变量,双击Path,新建,输入以下内容: 安装路径\Miniconda3 安装路径\Miniconda3\Library\bin...安装路径\Miniconda3\Scripts 其中第一个是最重要的。...然后配置清华镜像 conda config --add https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ conda config --add

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Miniconda——搭建Python开发环境的最优解

最近,在重新组织自己个人电脑的Python开发环境时,因为原生Pip无法安装某个包,较为简单的解决办法是使用conda,于是便又重新折腾了一番,最终发现Miniconda或许可以成为自己搭建Python...Miniconda文档及下载:https://conda.io/en/latest/miniconda.html 首先陈述下自己对搭建Python开发环境的状态和需求: Windows 10操作系统,主用...于是,一边厌恶于Anaconda的臃肿和繁杂,另一边又似乎存在对conda管理虚拟环境的刚需——二者结合,似乎Miniconda便顺其自然成了最优解!尝试一番,体验果真不错!...简单来说,安装了Miniconda相当于安装了一个Python+conda工具,其中不同的Miniconda内置不同的Python版本,其安装文件大小仅有60/70M,虽然比原生的Python安装文件大概大了一倍...更重要的是,安装了Miniconda就相当于可以在命令行中使用conda工具,conda工具可以直接管理Python第三方库的安装,也可以管理虚拟环境。

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简述Python、Anaconda、virtualenv和Miniconda之间的区别

今天我们来捋一捋Python、Anaconda、virtualenv和Miniconda之间的区别。     .../4 Anaconda和Miniconda区别/     说人话就是:两个都是一个东西。     Anaconda安装好之后,会安装一堆堆东西,特别大,1000多个库,占用好大小几个G。    ...Miniconda安装好之后,什么都不带,需要啥安装啥,很小,我没安装,就不截图了,Miniconda大小可能会在1G左右。     除此之外,两者没有其他区别了,命令一摸一样。.../5 小结/     本文主要围绕Anaconda和直接安装Python、virtualenv、Miniconda之间的区别进行展开,行文比较基础,主要是为初次接触Anaconda的小伙伴科普一下,Python

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第三天生信内容学习笔记-微信公众号生信星球

--第三步,安装和配置miniconda--第四步(重点),使用miniconda,也就是查看已安装的软件、安装、卸载(生信需要的)软件,我们以fastqc为例,其实安装软件很复杂,甚至有专门的一门课来讲这个...软件管理Miniconda最方便快捷的软件下载器,没有之一。它的作用就相当于App store,90%以上的软件都能搜到,一键安装。日常生信使用小而精的Miniconda即可. conda介绍. ...如何将miniconda下载到服务器上百度/谷歌搜索“miniconda 清华”(是清华的conda镜像网站)=》进入:https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda.../Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh如果你的网速有限制,下载速度很慢(这个一般不会,因为清华的镜像做的还是不错的),你可以直接拷贝我下载好的,命令是:cp /home/doudou...不成功就将miniconda这个目录删除,然后从“怎么安装miniconda”开始重来!!注意不要删除.sh结尾的脚本哈,要不还得浪费时间在下载上。

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RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具

清华园镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/# 获取下载链接-应用软件-miniconda3(linux 64) 复制地址 mkdir src cd src...~/src$ wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-4.5.4-Linux-x86..._64.sh ~/src$ bash Miniconda3-4.5.4-Linux-x86_64.sh 配置conda环境 先启动conda环境 source ~/miniconda3/bin/activate...conda search bwa 结果搜索不到,需要添加channels 添加频道 去清华镜像源,anaconda小问号打开 复制以下命令 conda config --add channels...conda不要添加到环境变量中,用source activate启动 -3 官方的channel靠后,避免channel之间依赖关系混乱 -4 新建一个或多个安装环境安装生信软件 -5 国内用户利用好清华源镜像

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