mpirun是否需要指定-np？
mpirun是一种用于在多节点并行计算中启动并行任务的命令。通常情况下，mpirun需要通过指定-np参数来指定并行任务的数量。该参数用于告知mpirun要启动多少个进程来执行并行计算任务。
-np参数是mpirun的必需参数，它用于指定并行任务的数量。通过指定-np参数，可以确保并行任务在正确的数量的进程上运行。进程的数量取决于计算任务的性质以及计算集群的规模和配置。
在使用mpirun时，必须明确指定-np参数的值。例如，可以使用以下命令来启动一个并行计算任务，其中包含4个进程：
mpirun -np 4 program_name
在这个例子中，-np参数的值为4，指示mpirun启动4个进程来执行program_name程序。
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请注意，以上推荐的产品仅作为示例，具体选择应根据实际需求进行评估和决策。
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1回答
我对MPI编程很陌生。我想在指定数量的核心上运行我的MPI程序。我通过输入mpirun --help引用了帮助选项。它提供了以下产出：
.-n个要运行的进程的数目.n个要运行的进程数目
但是，当我提到时，它在两个不同的地方指定了以下两种不同的东西：
在导言中：
mpirun通常是这样工作的。
mpirun -np
在“选项帮助”菜单中：
-np <np>
- specify the number of processors to run on
在这个场景中，-np是否指定要运行的进程的数量或在上运行的处理器的数量？此外，如何在多台PC上运行MPI程序？
在
浏览 5提问于2015-03-30得票数 1
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如何使用mpirun的-machine标志？
为了选择要在哪个集群节点上执行，我想到了使用mpirun的-machinefile选项，如下所示
> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np <integer> <executable-filename>
Host_file包含一个节点列表，每一行一个。
但是我想提交一整堆具有不同参数的进程，我不希望它们在同一个节点上运行。也就是说，我想做一件事
> mpirun -machinefile $HOME/utils/Host_file -np 1 filename
浏览 4提问于2012-12-22得票数 2
要使用mpirun在多个节点上运行作业，我将执行以下操作：
mpirun -np 2 -host myHost1,myHost2 -wdir path/to/wdir myProg
其中，-wdir允许在两台主机上执行myProg之前更改目录。但是，如果各个主机上的目录不同，该怎么办？我可以做像这样的事情吗？
mpirun -np 2 -host myHost1,myHost2 -wdir path/to/wdir1,path/to/wdir2 myProg
谢谢!
浏览 2提问于2013-06-27得票数 4
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当我跑的时候
mpirun -np 2 exec
在终端中，exec并行运行。但是，当我将命令放在bash脚本中时，
#!/bin/bash
mpirun -np 2 exec
我抛出了下面的代码
/opt/intel/composer_xe_2013_sp1.0.080/mpirt/bin/intel64/mpirun: 96: .: Can't open /opt/intel/composer_xe_2013_sp1.0.080/mpirt/bin/intel64/mpivars.sh
我的猜测是bash脚本看到了一组不同的环境变量，但我不确定如何确认这一猜测。
浏览 0提问于2014-01-16得票数 1
enter code here程序采用3个命令行参数(2个输入文件和大小，这对文件是相同的)。例如，在同一个目录中，我有这些文件。
abc.mtx, abc.txt SIZE is same for these 2 files
def.mtx, def.txt SIZE is same for these two files
qas.mtx, qas.txt SIZE is same for these two files
and so on .....
请注意:文件名相同，但扩展名不同。
我想将我的代码作为
mpirun -np 4 ./myexe file1.mtx fi
浏览 8提问于2018-03-20得票数 1
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我在集群上运行MPI代码时遇到了问题，我使用下面的命令来运行该代码，并使用ip地址进行了尝试。
mpiuser1@comp-asdf-4:~$ mpirun -np 4 -hosts master, slave1 ./myexe
并且有跟随错误
mpirun: Error: unknown option "-o"
Type 'mpirun --help' for usage.
我有一个由两个节点组成的集群，一个主节点和一个从节点，我遵循本教程创建集群。我使用的是ubuntu (16.04.1)，gcc版本5.4.0，openmpi版本3.0.1。其他用户报告的相
浏览 0提问于2018-04-10得票数 0
这是我从Jupyter Notebook %%bash magics单元格中观察到的初始问题/观察结果，该单元格也在IPython控制台中重现。我打算从笔记本页面启动几个MPI程序。在这里，我使用date系统命令作为一个简单的复制器。
In [1]: %%bash
...: echo "First"
...: mpirun -np 2 date
...: echo "Second"
...: mpirun -np 2 date
...: echo "End"
...:
First
mar. juin 27 1
浏览 27提问于2017-06-27得票数 0
是否有任何方法可以使用单个作业脚本同时运行多个并行作业？我写过这样的剧本。然而，它并不是同时处理四个作业。48个核心中只有12个在运行一项任务。只有一个接一个的四个代码(来自四个不同的目录)正在运行。
#!/bin/sh
#SBATCH --job-name=my_job_name # Job name
#SBATCH --ntasks-per-node=48
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --time=24:00:00 # Time limit hrs:min:s
浏览 5提问于2022-03-19得票数 0
1回答
目前，我们正在尝试编写一个使用mpirun启动多个X11客户端的程序。如果程序仅为文本，那么使用以下命令，我们可以在计算机列表上运行进程：
mpirun -np 4 --hostfile hostlist date
这里的主机列表是mpi配置的计算机的一个文件.计算机被设置为使用公钥自动进行身份验证。我们还可以只在本地计算机上运行X11程序，例如：
mpirun -np 4 xclock
按预期显示四个x时钟。但是，如果我们尝试使用主机文件运行X11程序：
mpirun -np 4 --hostfile hostlist xclock
然后两个x时钟启动，但远程计算机报告：
Error: ca
浏览 0提问于2013-01-24得票数 3
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我想在jupyter笔记本上运行C++模拟。程序需要输入三个值，即10、0.2和0.6。
这就是我现在正在做的，它工作得很好：
## Compile
! mpicxx -o main main.cpp Node.cpp Agent.cpp -std=gnu++11
## Run
! mpirun -np 1 ./main 10 0.2 0.6
但是如果尝试在之前声明这些值，它将无法识别它们。
a = 10
b = 0.2
c = 0.6
! mpirun -np 1 ./main a b c
浏览 3提问于2019-03-29得票数 1
3回答
我想用以下命令在bash中运行一个pw.x : mpirun 4pw.x< input.in通过一个-np脚本。我使用了这个：
from subprocess import Popen, PIPE
process = Popen( "mpirun -np 4 pw.x", shell=False, universal_newlines=True,
stdin=PIPE, stdout=PIPE, stderr=PIPE )
output, error = process.communicate();
print (output);
但
浏览 7提问于2017-12-27得票数 0
在运行包含openmp代码的MPI程序时，是否需要设置OMP_NUM_THREADS变量？当我看到一些教程时，我看到您必须设置OMP_NUM_THREADS (环境变量)。Im测试程序在我的家庭集群上，它使用OpenMPI 1.6.4 (MPI2.1)传递消息。我的MPI程序包括openMP函数调用(omp_get_max_threads)，在运行MPI程序之前，我不设置OMP_NUM_THREADS变量。该程序工作正常，并返回真实的线程数。如果我试图在另一个使用更新版本的MPI实现(MPI3.0)的集群上启动这个程序，程序将返回1作为omp_get_max_threads()调用的结果，在我
浏览 5提问于2014-06-28得票数 0
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2回答
我在批处理脚本中有以下代码：
mpirun -np 6 ./laplace <<END
100
100
100
0.01
100
3
2
1
END
| tail -n 1 > output
但它不起作用。我想要它做的是使用这里文件作为mpirun命令的输入，然后将输出输送到tail命令。然而，我认为这里的文件和尾部输出的东西正在变得混乱。
我应该如何写这个，这样它才能实现我想要的？
浏览 0提问于2011-05-16得票数 11
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2回答
我尝试在安装了torque和openmpi 1.3.2的集群上运行MPI作业，但总是收到以下错误：
“尝试启动进程等级0时，由于找不到可执行文件: executable：-p节点: compute-101-10.local，mpirun无法启动指定的应用程序。”
我正在使用以下脚本来执行qsub：
#PBS -N mphello
#PBS -l walltime=0:00:30
#PBS -l nodes=compute-101-10+compute-101-15
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun -npersocket 1 -H compute-101-10,compute-
浏览 3提问于2012-05-13得票数 0
2回答
是否有一种方法可以在Dockerfile入口点中作为参数执行命令？我正在创建一个映像，它应该为处理器的数量自动运行mpirun，即mpirun -np $(nproc)或mpirun -np $(getconf _NPROCESSORS_ONLN)。
下面这一行起作用：
ENTRYPOINT ["/tini", "--", "mpirun", "-np", "4"] # works
但我无法找到一种适应的形式来发挥作用：
ENTRYPOINT ["/tini", "--", "
浏览 1提问于2015-10-22得票数 3
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2回答
我有两个不同的可执行文件(run1和run2)。我想同时运行它们。它们共享一个只读输入文件，但除此之外，它们是不同的进程。是否可以同时调用call？目前，正如我所编码的，cmd2的调用等待cmd1的调用完成。
with open(dosout, "w") as dout, open(jijout, "w") as jout:
cmd1 = ["mpirun", "-np", "8", "~/WORK/run1", dosinp]
cmd2 = ["mpirun", &
浏览 4提问于2015-09-26得票数 0
我正试图为一个安全类优化开膛手约翰。我正试图使用两个处理器来运行John，方法是使用mpirun程序，如本教程中所建议的那样。我安装了mpirun，但是当我运行这个命令时，我得到了以下错误：
# sudo mpirun -np2 /usr/share/john --test=10
/usr/bin/mpirun: 1: eval: usr/share/john: Permission denied.
为什么我会得到这个错误，如何使用mpirun使用两个处理器运行John？我在一台带有英特尔核心i5的Mac电脑上运行Ubuntu12.10。
浏览 0提问于2013-02-04得票数 0
我正在尝试从python2x执行一个程序。
在终端中，作业将以下列方式运行：
mpirun -np 8 ~/WORK/scf Fe_SCF.inp > Fe_SCF.out
其中Fe_SCF.*是CWD中的输入和输出。
现在，我试图从python脚本中运行这段代码。此后，我将它们定义为变量，并试图将其调用为：
call(["mpirun -np 8 ~/WORK/scf", scfin, scfout])
给予错误：
File "./triolith.py", line 38, in <module>
call(["
浏览 0提问于2015-09-25得票数 0
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在CMake中，我有一个函数：
function(add_mpi_test name no_mpi_proc)
include_directories(...)
add_executable(...)
add_dependencies(...)
target_link_libraries(...)
# The important lines:
set(test_parameters " -np ${no_mpi_proc} ./${name}")
add_test(NAME ${name} COMMAND "mpirun" ${tes
浏览 5提问于2013-10-09得票数 3
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1回答
我正在向电脑提交一份工作。
看起来是这样的：
mpirun -np 12 example_S57 -o S57.results -r S57.final
mpirun -np 12 example_S58 -o S58.results -r S58.final
...
...
...
mpirun -np 12 example_S74 -o S74.results -r S74.final
我如何循环这个命令，并在脚本中为S57运行此命令直到S74，而不必键入每个命令？
浏览 0提问于2019-08-22得票数 1
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1回答
有了PBS调度程序，就可以在没有脚本的情况下以这种方式启动批处理命令：
qsub -l select=1:ncpus=12:mem=112GB -l walltime=00:30:00 -- /usr/bin/bash -c "mpirun -np 12 sleep 10"
有可能在斯隆和赛巴奇一起做吗？
浏览 3提问于2017-12-13得票数 5
1回答
我正在尝试使用Intel Vtune来分析我的MPI应用程序。在尝试运行以下两个命令时，我遇到了错误。
I_MPI_DEBUG=5. I尝试了两种方法：exportI_MPI_DEBUG=5 mpirun -np 4 aps ~/binary/vasp_std_2022mpirun -genv I_MPI_DEBUG=5 -np 4 aps ~/binary/vasp_std_2022
警告:在虚拟机中不支持内存带宽收集，因为无法收集uncore事件。要获得完整的功能，请考虑使用裸金属环境。警告:此平台不支持CPU频率数据收集。错误: perf :使用CPUID GenuineIntel-6-
浏览 7提问于2022-11-03得票数 0
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我在OS X的单机模式下使用mpirun有问题。当使用mpirun -np 5 my_program运行我的程序时，我得到以下错误输出：
[...-MacBook-Pro.local:85936] [0,0,0] ORTE_ERROR_LOG: Timeout in file /SourceCache/openmpi/openmpi-8/openmpi/orte/mca/pls/base/pls_base_orted_cmds.c at line 275
[...-MacBook-Pro.local:85936] [0,0,0] ORTE_ERROR_LOG: Timeout in file
浏览 2提问于2011-03-03得票数 1
我想知道如何在Sun Grid引擎中在一个作业脚本文件中提交多个mpirun程序。
假设我已经编译了program1，program2，program3。program100并希望同时运行它们，以便在一个作业脚本中每个cpus使用16个cpus，而不生成100个作业脚本。
mpirun -np 16 program1 &
mpirun -np 16 program2 &
mpirun -np 16 program3 ....
如何将节点分配到Sun Grid引擎中的每个程序？(我能否将SGE的主机文件拆分为100，并将它们提供给每个mpirun？)
谢谢。
浏览 1提问于2015-05-21得票数 2
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1回答
mpirun是否需要指定-np？
、、、、
我以前跑起来就像 mpirun -np N ./c_or_python_script 但是，在具有PBS作业提交队列的集群上(我不知道这种类型的提交被称为什么)，示例脚本不需要这个-np N参数！我还是会给你的。有什么关系？我在下面的集群中指定了一个模拟示例脚本。 #!/bin/sh
#PBS -V
#PBS -N mpi_job
#PBS -q normal
#PBS -A etc
#PBS -l select=4:ncpus=64:mpiprocs=64
#PBS -l walltime=04:00:00
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun ./test_mpi.ex
浏览 493提问于2021-02-03得票数 0
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1回答
我在一个有36个cpus和72个线程(超线程)的节点上使用mpirun运行了几个进程。当我使用不同的mpirun调用(每个都是-np 2)运行它们时，它们在相同的cpus中运行，降低了进程的效率。使用ps命令，我可以看到当我发送7
mpirun -np 2 ./foo
调用，所有进程都在4个线程中运行。有人知道怎么解决这个问题吗？我希望将进程分布在所有线程上，以最大限度提高效率。
浏览 11提问于2021-03-09得票数 1
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我有一个C文件存储在我的机器上，我希望使用外部服务器上的程序来执行这个文件。这样做的原因是空间需求--我在外部服务器上没有存储空间，但我在本地机器上确实有空间。如果我使用外部服务器在我的本地机器上运行程序，我还能利用它的好处吗？
例如，我使用"mpirun -np 16 ./ c.x“运行当前代码，但这是在我登录到服务器并且c.x位于服务器可以访问的机器上的时候。有没有一种使用"ssh“运行"mpirun”的方法？
浏览 0提问于2016-07-21得票数 0
我在mpirun上是个新手，我遇到了一个小问题。我只想在机器的2个核心上运行n个作业，所以我打开了n个终端窗口，并在每个终端窗口中使用通常的mpirun -np 2 [program]，但它并没有使用2*n个内核，而是只使用了其中的一小部分，并且应用程序非常慢，这让我相信mpirun在相同的核心上堆叠了多个作业，而不涉及同一CPU上的其他内核，使得作业变得令人无法忍受，总体上降低了工作流效率…… 我尝试在每个调用中使用选项--bind-to core，但这似乎并没有改变mpirun的行为…… 是什么导致了这种行为，我如何处理它，使它不会在相同的核心上堆叠作业，直到没有足够的核心来满足需求？
浏览 71提问于2021-02-09得票数 2
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2回答
我试图使用"nohup“命令来避免在linux伙伴上退出终端时杀死后台进程。
我想运行的进程是一个MPIrun进程，我使用以下命令：
nohup mpirun -np 8 solverName -parallel >log 2>&1
当我离开终端时，运行在不同核心上的进程就会被杀死。
另外，我在日志文件中注意到的另一件事是，如果我试图只运行以下命令
mpirun -np 8 solverName -parallel >log 2>&1
然后，对于CTRL+Z (停止进程)，日志文件指示：
Forwarding signal 20 to job
实
浏览 2提问于2018-01-17得票数 2
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2回答
我写了一个bash脚本，我得到了这样的信息：
/home/myname/documents/myscripts/run_tearingmode.sh:第44行: mpirun2:找不到命令：
这里是脚本的相关部分
if [[ "$run_jobs" == "y" ]]
then
printf "The jobs run one after the other. Have fun with the analysis. \n "
for ((i=1;i<=$number_subfolders;i++))
do
sub_folder
浏览 0提问于2013-10-10得票数 3
我想从Hello.java和Ring.java运行中的两个java示例。我用
./configure --enable-mpi-java
这条线没出任何问题。
然后我打电话给这条线：
mpirun -np 2 Hello.java
但我知道这个错误：
mpirun无法找到指定的可执行文件，因此没有启动作业。此错误首先报告为进程级别0；它可能也发生在其他进程。
注意:造成此错误的一个常见原因是拼写错误的mpirun命令行参数选项(请记住mpirun将第一个未识别的命令行令牌解释为可执行文件)。
节点:联盟
可执行文件: Hello.java
当我打电话的时候也发生了同样的事情
mpirun -
浏览 3提问于2015-08-19得票数 0
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1回答
到目前为止，我一直在使用OPEN(fid, FILE='IN', ...)，而且似乎所有MPI进程都读取相同的文件IN而不相互干扰。
此外，为了允许在多个输入文件中选择输入文件，我只是将IN文件作为指向所需输入的符号链接。这意味着，当我想要更改输入文件时，必须在运行程序(mpirun -n $np ./program)之前运行mpirun -n $np ./program。
我非常希望能够以mpirun -n $np ./program < input-file的身份运行这个项目。为此，我删除了OPEN语句和相应的CLOSE语句，并将所有READ(fid,*)语句更改为R
浏览 0提问于2018-02-27得票数 4
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我使用的是gcc和。通常我使用mpirun包装器运行MPI程序--例如，
mpirun -np 4 myprogram
启动4个进程。
然而，我想知道是否有可能很容易地生成一个自动生成二进制文件(可能使用一些硬编码的选项，如上面的-np 4 )。
我知道我可以编写一个C包装器来调用我的程序，如下所示：
#include <stdlib.h>
#include <unistd.h>
int main() {
char *options[] = { "mpirun", "-np", "4", "myp
浏览 2提问于2012-06-24得票数 11
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我想使用一个节点的两个套接字，用于单个作业提交时的两个单独mpirun，如下所示：
socket ---- 0 ---- ---- 1 ----
core 0 1 ... 14 15 0 1 ... 14 15
task mpirun#1 with 16 process mpirun#2 with 16 process
此外，我想运行没有多线程。
因此，下面是我在Slurm头文件中所放的内容：
#SBATCH --nodes=1
#SBATCH --sockets-per
浏览 9提问于2022-02-21得票数 0
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1回答
在我们的集群中，当我提交请求超过40个节点或640个核心的作业时，$LSB_HOSTS变得空了，所以作业停止了。我使用这个变量生成一个nodelist文件，我在mpirun命令行中使用该文件如下：
#BSUB -q cpu
#BSUB -J gromacs
#BSUB -o job.out
#BSUB -e job.err
#BSUB -n 640
#####################################################
#####################################################
INPUT=test1840
浏览 0提问于2013-09-12得票数 2
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2回答
我知道资源经理(R.M.)向openmpi传送插槽信息，但是
R.M.如何确定多核处理器中的插槽数(1核== 1时隙总是这样吗？)和,
如果我在一个4核处理器上运行a.out，那么在以下几个方面有什么区别：
- myshell$ mpirun --host n1,n1,n1,n1,n1 ./a.out
- myshell$ mpirun -np 5 --host n1 ./a.out
我的意思是，在这种情况下，我是不是“超额订阅”节点？
浏览 3提问于2014-03-19得票数 3
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3回答
我正在我的桌面上测试一个简单的MPI程序(Ubuntu 16.04/ Intel Core™i3-6100 U CPU @ 2.30GHz×4/ gcc 4.8.5™3.0.0)，mpirun不允许我使用我机器上的所有核心。当我跑步时：
$ mpirun -n 4 ./test2
我得到以下错误：
--------------------------------------------------------------------------
There are not enough slots available in the system to satisfy the 4 slots
t
浏览 6提问于2018-02-16得票数 13
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2回答
我在Windows 7机器上的Cygwin上使用Open (1.8.3)。我想在这台机器上单独运行MPI代码，而不是在任何外部网络上交谈。我知道我应该能够使用MCA选项将mpirun限制为self和共享内存通信，如下所示：
mpirun -n 8 --mca btl sm,self ./hello.exe
然而，当我尝试这样做时，Windows会问我是否想要设置防火墙异常，这表明我的工作是试图通过TCP进行外部对话。此外，mpirun将挂在大约一分钟，然后完成当且仅当我在无线网络之前，你好世界工作完成。如果我关闭我的无线网卡或切换到有线以太网连接，它完成大约1秒如预期。
为什么mpirun不观
浏览 5提问于2014-10-13得票数 2
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我试图在一个VPS上同时执行两个进程，VPS有16个核，我希望每个工作都使用8个核，最大限度地利用可用的核数。
因此，我想我可以这样执行两个独立的进程：
$ mpirun -np 8 pmemd.MPI -O -i input_proc1.in -o output_proc1.out
$ mpirun -np 8 pmemd.MPI -O -i input_proc2.in -o output_proc2.out
在我看来，这将把进程1放在核心1-8上，进程2放在核心9-16上，尽管情况显然不是这样。检查htop输出显示，这两个进程都拥挤在1-8核之上，留下8个核心没有被使用。
我在后台运行这
浏览 0提问于2019-07-30得票数 1
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3回答
我正在尝试构建一个简单的web服务，它使用apache和mod_perl2在ubuntu机器上运行。该服务运行mpirun并返回调用的输出。我通过web浏览器调用apache响应处理程序。问题是mpirun命令似乎挂起了。
重要：这个问题发生在运行、mod_perl和openmpi的Ubuntu12.04.4服务器上。在我的mac (Macos 10.9.3)上运行它时，它工作正常，mpirun返回。在这两台机器上，openmpi都安装在相同的版本(1.6.5)中。
在这里，我的mod_perl处理程序：
package MyHandler;
use Apache2::Const '-
浏览 2提问于2014-07-11得票数 3
我不明白在调度程序下使用MPI运行时，计算节点上的环境是如何设置的。
我有：
mpirun -np 1 --hostfile ./hostfile foo.sh
使用foo.sh
#!/usr/bin/env zsh
echo $LD_LIBRARY_PATH
然后我不能恢复我在交互式外壳中获得的LD_LIBRARY_PATH ...在与MPI连接时执行/获取的初始化文件是什么？
注意:我在zsh下，
浏览 3提问于2015-05-27得票数 8
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我正在尝试构建一个可执行文件，在手册中它提供了两个选项来构建这个文件，使用make和cmake。(请注意，该程序运行在linux上)
因此，我遵循了这个过程，当我尝试运行一个由mpirun提供的代码的基准测试示例时，一切似乎都进行得很顺利。
└─$ mpirun -np 1 $HOME/sparta/bench spa_mac \< in.free
\[proxy:0:0@kalig\] HYDU_create_process (utils/launch/launch.c:73): execvp error on file /home/gioggior/sparta/bench (Pe
浏览 15提问于2022-03-23得票数 1
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我已经安装了开放MPI的用于性能测试。当我向mpirun添加一个选项：“-前缀= /my-path”时，无法执行“”(中止)。
我的命令：
scalasca -analyze mpirun -np 1 --host localhost --prefix /home/as/lib/bin /home/as/Documents/a.out
"/home/as/lib“是已安装的Open目录。
和错误：
S=C=A=N: Abort: Target executable/home/as/lib/bin‘是一个目录！
如果没有"--前缀“，它通常运行.But i需要”-前缀“选项来在集
浏览 3提问于2016-05-09得票数 0
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1回答
我在使用Oprofile来分析我通过mpirun调用的并行程序时遇到了问题。我想使用的命令是：
$ operf mpirun -n 4 [program and arguments]
不幸的是，当我这样做时，operf会开始日志记录，但是当MPI程序完成时会发生一些有趣的事情-- operf似乎不认识到它已经返回了(MPI生成的进程不再出现在htop中，但operf仍然出现)，事情只是挂起等待我打断它们。
有没有一个选择，我可以传递给operf或mpirun，这将使这两家公司很好地合作？如果没有，当我的MPI程序完成时，我可以用bash技巧自动杀死operf吗？
编辑：以前认为Opro
浏览 3提问于2013-10-17得票数 1
2回答
通常，当我使用mpirun时，我可以让它“过载”，使用比我电脑上实际使用的处理器更多的处理器。例如，在我的四核mac上，我可以毫无问题地运行mpirun -np 29 python -c "print 'hey'"。我现在在另一台机器上，它抛出了以下错误：
$ mpirun -np 25 python -c "print 'hey'"
--------------------------------------------------------------------------
There are not enough slo
浏览 6提问于2016-03-01得票数 29
回答已采纳
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mpirun (和mpiexec)似乎没有将命令行参数传递给我的c代码。
直接从命令行运行我的可解释的“壁虎”会给出预期的结果：
$ ./gecko -np 2
main:There are 3 arguments:
arg=./gecko
arg=-np
arg=2
但是通过mpirun进行相同的运行是不同的：
$ mpirun -np 2 ./gecko
main:There are 1 arguments:
arg=./gecko
这意味着MPI_init(argc，argv)没有任何可以使用的参数。我在Ubuntu12.04和MPICH 2上。
有人能看出为什么没有发生这种事吗？
浏览 14提问于2014-10-13得票数 1
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我经常使用类似下面的简化的2脚本来在集群中分发令人尴尬的并行工作，并使用PBS/MPI。我想知道这些命令是否可以合并到一个文件中，以便清晰和减少杂乱。我更感兴趣的是理解bash/mpirun的局限性，而不是寻找解决原始问题的替代方法，比如PBS数组。
PBS脚本：
#PBS -l nodes=2:ppn=2
#PBS -q debug
#PBS -V
mpirun -n $PBS_NP $PBS_O_WORKDIR/worker_script.sh
worker_script.sh
#!/bin/bash
NDATA=25
DATA_ARRAY=()
for ((DATA=${OMPI_CO
浏览 0提问于2014-06-23得票数 1
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1回答
我正在学习如何使用MPI，在调用脚本时，我对-n和-np的区别感到困惑。作为参考，我正在尝试使用OpenMPI 3在Slurm集群上运行该脚本。
例如，我可以像这样运行我的脚本：
mpirun -n 4 --oversubscribe python par_PyScript2.py
或者像这样：
mpirun -np 4 --oversubscribe python par_PyScript2.py
有人能描述一下这些选项的实际含义吗？
浏览 586提问于2019-06-21得票数 1
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我完全没有经验使用makefile的MPI程序与OpenMP。我通常在命令提示符下运行
mpicc main.c -fopenmp -o Out
mpirun -np 4 Out
所以现在我需要使用makefile，我的理解是我们使用makefile以更方便的方式运行命令，所以在逻辑上我们应该在makefile中输入相同的命令，对吗？所以我的makefile现在看起来像这样
all:
mpicc main.c -fopenmp -o Out
mpirun -np 4 Out
是否有关于如何为绝对初学者创建makefile的一步一步的指南？
浏览 1提问于2019-10-17得票数 0
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在我发出mpirun命令之后，我想得到这个进程的pid，这样以后我就可以终止这个进程了。如何做到这一点而不必在mpirun命令的末尾添加'&‘才能将其发送到后台？
另一个条件是机器上可能运行多个mpirun进程。
浏览 4提问于2014-09-12得票数 2
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