这个专题分享点日常运维中用到的Python脚本 在做数据库迁移后,我们可能需要知道我们的表,索引,存储过程等对象是否迁移成功 这时可以用如下脚本来进行检查 ---- 环境准备 操作系统: Windows
背景 前面介绍的都是 reads 正常的比对情况,比上或者比对不上。在实际比对过程中还会出现很多种“特殊”情况,而往往分析需要的就是这种特殊情况。...例如多重比对的 reads 分配问题,将 reads split 切割之后的比对,包括 spliced 与 clipped reads 的比对。...例如在RNAseq 分析中,由于真核生物存在可变剪切,会导致那些来自于不同外显子的 reads无法比对到基因上,所以,必须采用支持 spliced 比对策略的软件进行短序列比对才行。...比较 bowtie 和 tophat 两种比对软件,很明显发现,支持 spliced 比对的方法能够比对上更多的 reads。...一、spliced alignment read 一端比对上,跳过了中间,然后另一端也比对上【CIGAR 中用“N”表示】如果是转录组数据的比对结果,N 表示内含子;其他类型组学数据中 N
, ) mysql_cursor = mydb.cursor() # 获取当前最小 最大的id,用于后续的循环比对 get_min_max_sql = 'SELECT min(id),max(id)...记录差异行数量 diff_count = 0 while stop_id < max_id + configs.step: # 加一个步长进去,防止因为step过大,导致有遗漏的id # 拼接出比对的...stop_id = stop_id + configs.step stop_time = time.time() time_dur = stop_time - start_time print(f"比对...' mysql_port = '3306' mysql_user = 'dts' mysql_pass = 'dts' mysql_db = 'sbtest' mysql_tb = 'sbtest1'...运行效果 走公网流量情况下,9k记录,在不同step下的耗时比对: step = 100 18.5s step = 500 5s step = 1000 3.7s step = 2000
展开全部 方法一: 1、首先我e68a84e8a2ad3231313335323631343130323136353331333363393134们使用MySQL提供的命令行界面来导入数据库,确保自己的电脑中安装了...MySQL数据库,我们可以通过命令行来确认是否安装了MySQL数据库,当然,第一步是打开Mysql的数据库服务,我们使用命令行来打开, 2、启动MySQL后,我们找到需要用到的脚本文件,也就是数据库文件...;来导入数据库,先进入mysql, 4、首先要在数据库中建立好数据库,然后导入脚本,所以先建立一个数据库哦,不要脚本是不知道你要往哪个数据库中导入脚本的,如下图所示: 5、然后就可以输入导入.sql文件命令...: mysql> USE 数据库名; mysql> SOURCE d:/test.sql; 6、看到上面的画面,说明mysql数据库已经导入成功了哦!...现在来介绍第二种方法,使用mysql图形工具导入数据库,我们还是使用test.sql脚本来说明:方法二: 使用Navicat for MySQL图形界面来导入数据库,使用图形界面导入数据库的步骤很简单,
Python 操作 因为对 Excel 的函数操作不太熟,第一时间我是用 Python 来比对数据的:选取两份表格中的 id 列,分别复制到两份 txt 文档中,转化为 Python 读取 txt 文档数据...希望能给看到的各位带来点帮助吧~ 往期推荐 用Python整理Excel表格 Python读取PDF信息插入Word文档 Python 自动整理 Excel 表格 Python 合并 Excel 表格 Python 如何实时绘制数据
https://blog.csdn.net/robinson_0612/article/details/84365551 在关系型数据库建表期间,我们需要考虑很多很多的事项。...---+ | Leshami | http://blog.csdn.net/leshami | +---------+------------------------------+ 二、基于无索引情形比对...表上统计信息,mysql统计信息不是很准确,如下图,基于bigint数据类型占用的磁盘你空间与char类型占用磁盘空间等同。...image.png 二、基于索引情形比对 下面为过滤条件列mobile添加索引列,观察性能表现 CREATE INDEX uk_mobile ON tb_char(mobile); CREATE...为了更好比对性能,下面基于索引列进行分组以及聚合运算,可以看出依旧是bigint数据类型性能最佳 image.png 四、最终比对结果及结论 最终完整结果图: image.png
比如数据库名称old_db想改名为new_db MySQL修改数据库名称比较麻烦,不支持直接修改,需要通过其它方式间接达到修改数据库名称的目的。...在 MySQL 5.1.23 之前的旧版本中,我们可以使用 RENAME DATABASE 来重命名数据库,但此后版本,因为安全考虑,删掉了这一条命令。...方法一:先导出数据,再导入数据 当数据库体积比较小时,最快的方法是使用mysqldump命令来创建整个数据库的转存副本,然后新建数据库,再把副本导入到新数据库中。...(MySQL没有单个语句的操作),移动后原始数据库继续存在,但是里面没有表。...TABLE命令修改表名,将表移动到新的库里: rename table old_db.tb to new_db.tb; 2.3 完成后删除旧库: drop database old_db; 2.4 如何使用
如何将excel中的数据导入到数据库 1)你的sql server,找到要导入数据的数据库,右键——〉——〉导入数据 2)图示选择要导入的excel 3)选择导入到哪个数据库 4)导入excel选择第一项即可...phpexcel导入excel数MYSQL数据库 第三步:向数据库插入数据的insertdb.php文件。 [php] view plain copy print?...$mysql=mysql_connect(“localhost”,”root”,””) or die(“数据库连接失败!”)...; mysql_select_db(“php_excel”,$mysql); mysql_query(“set names utf8”); 我的导入效果如下: 至此,从Excel文件读取数据批量导入到Mysql...excel表格如何导入数据库中?
使用Python写了个最基本的表结构比对告警脚本, 目前这个版本只能做到发现表结构存在差异的表。后续考虑再迭代下,看如何把差异的表和列的明细也报出来。...configs.py 内容如下: # MySQL数据源的信息 mysql_source_host = "localhost" mysql_source_port = "3306" mysql_source_user...dest_tb_set): # s1.add(i[0]) # 如果要全部都报出来,用下面这种写法 s1.add(i[0]) print('表结构(只比对了列和索引...,未包括字符集和排序集)检查完成,存在差异的表如下 ---> ', s1) else: print('表结构(只比对了列和索引,未包括字符集和排序集)检查完成,没有发现存在差异的表') stop_time...= time.time() time_dur = stop_time - start_time print(f"耗时 {time_dur} 秒") readme 内容如下: 上面程序里面,我们没有比对表中的字符集和排序集
MonacoEditor用来做代码比对 Monaco Editor 不仅是一个功能强大的代码编辑器,它还内置了一个代码比对组件(DiffEditor)(如下图)。...在Vite-React环境下接入DiffEditor 下面将完整演示如何在Vite、React环境下接入微软开源组件 Monaco Editor,并使用它的代码比对(DiffEditor)特性。...HTMLDivElement>(null); 创建DiffEditor MonacoEditor 的代码比对能力...,由 DiffEditor 组件提供,可以通过monaco.editor.createDiffEditor创建,并通过setModel接口设置需要比对的代码片段。..., { diffCodeLens: true, readOnly: true, automaticLayout: true, }); // 给 DiffEditor 设置需要比对的代码
序列比对和序列特征分析总目录 多序列比对的软件很多,具体可参考https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/ 另外还有http://www.bioinformatics.utep.edu...BIMER/tools/msa.html https://www.expasy.org/genomics/sequence_alignment 工具很多,以下为推荐的在线版本工具: - DNA多序列比对...- 蛋白质多序列比对推荐 Clustal Omega....image.png Alignment进行比对:Alignment--Do complete alignment,结果如下 ?
注意,这其中有自身比对的问题。...: 参与比对的两条序列里面的所有字符进行比对。...优点是非常精确 缺点是运行时间长,不适合数据量庞大的序列数据库搜索 ---- 3 目前大多数数据库搜索工具中使用的算法:BLAST算法(Basic local alignment search tool...注意:动态规划和BLAST适用于不同比对情况。...前者适合较少量序列间比对,BLAST适合从一组大量序列中搜索与查询相似的序列 BLAST总体比对算法的思想是:首先通过完全匹配来查找序列,然后通过允许有误匹配的方式来扩展比对区域。
desc table_name 二、查询表中列的注释信息 select * from information_schema.columns where table_schema = ‘db’ #表所在数据库
今天有个做数据库的前同事,在群里发了自己的数据库,并把主机,端口,用户名,密码一并发了出来,然而,我尝试着去连接访问。...首先我下载了一个Navicat for MYSQL Mac 破解版 ,连接如下:http://www.cnblogs.com/xiaopin/p/5867954.html,下载的注册机打不开,但是并不影响...下载安装好之后,打开navicat,点击左上角的connection-mysql,将主机,端口,用户名,密码,一并输入,点击Test Connection就可以了,如果成功,就会显示successful
Go原生就支持连接数据库,所以在使用 Golang 开发时,当需要数据库交互时,即可使用database/sql包。 ?...通常DB选型MySQL,所以选型驱动为:github.com/go-sql-driver/mysql,需引入包: "database/sql" _ "github.com/go-sql-driver/mysql...上面的MySQL驱动中引入的就是MySQL包中各个init()方法,你无法通过包名来调用包中的其他函数。...charset=utf8"}, "") //打开数据库,前者是驱动名,所以要导入:_ "github.com/go-sql-driver/mysql" DB, _ = sql.Open(..."mysql", path) //设置数据库最大连接数 DB.SetConnMaxLifetime(100) //设置上数据库最大闲置连接数 DB.SetMaxIdleConns
在关系型 数据库 建表期间,我们需要考虑很多很多的事项。诸如表存储什么数据,列上使用的数据类型,选择什么样的存储引擎等等。...---+ | Leshami | http://blog.csdn.net/leshami | +---------+------------------------------+ 二、基于无索引情形比对...表上统计信息,MySQL统计信息不是很准确,如下图,基于bigint数据类型占用的磁盘你空间与char类型占用磁盘空间等同。...-- 下面执行以下三条SQL语句比对性能 SELECT * FROM tb_char WHERE mobile = '17998335908'; SELECT * FROM tb_varchar WHERE...为了更好比对性能,下面基于索引列进行分组以及聚合运算,可以看出依旧是bigint数据类型性能最佳 四、最终比对结果及结论 最终完整结果图: 结论: 1)满足需求的前提使用更小长度的数据类型(更少磁盘占用
今天我们一起来看看pymysql是怎么操作数据库的,后续也有利于我们开发一些自动化运维的工具和脚本,减轻DBA的工作。...数据库连接 #!...cursor.execute("select VERSION()") #获取单条结果 data=cursor.fetchone() #打印输出 print("Mysql...version is:%s" %data) #关闭数据库连接 db.close() 输出:Mysql version is:5.7.26-log 2....% (name,age)) #关闭数据库连接 db.close()
本文将详细介绍如何备份和恢复MySQL数据库。...在MySQL Workbench中备份MySQL数据库的步骤如下: 打开MySQL Workbench,连接到要备份的MySQL数据库。 在Navigator面板中,选择要备份的数据库。...二、恢复MySQL数据库 使用mysql命令恢复数据库 使用mysqldump备份MySQL数据库后,可以使用mysql命令将备份的数据重新导入到数据库中。...使用MySQL Workbench恢复数据库 在MySQL Workbench中恢复MySQL数据库的步骤如下: 打开MySQL Workbench,连接到要恢复的MySQL数据库。...我们可以使用mysqldump命令或MySQL Workbench来备份MySQL数据库,使用mysql命令或MySQL Workbench来恢复MySQL数据库。
mysql如何导出数据库 导出方法 1、使用命令mysqldump导出数据时,默认直接在终端显示。 2、保存文件时,需要与>重定向输出相结合的操作。 3、导出指定库中的部分表或完整的库。...库中的user表导出为mysql-user.sql文件,并采用语法基本格式,将整个auth库导出为auth.sql文件,两种语法基本格式的所有操作都需要root用户进行验证。...[root@localhost ~]# mysqldump -u root -p mysql user > mysql-user.sql Enter password: [root@localhost ...~]# mysqldump -u root -p --databases auth > auth.sql Enter password: 以上就是mysql导出数据库的方法,希望对大家有所帮助。...更多mysql学习指路:MySQL 推荐操作系统:windows7系统、mysql5.8、DELL G3电脑 收藏 | 0点赞 | 0打赏
您将需要安装MySQL。您可以选择下面的方案进行安装 四步教你搭建保护MySQL服务器!(不够稳定) 购买腾讯云数据库(稳定好用) 安装MySQL后,继续以sudo用户身份登录服务器。.../var/lib/mysql保存MySQL数据的目录由mysql用户组拥有。我们可以将backup用户添加到mysql组中以安全地允许访问数据库文件和目录。...我们将创建以下脚本: backup-mysql.sh:此脚本备份MySQL数据库,加密和压缩进程中的文件。它可以创建完整和增量备份,默认情况下,该脚本维护3天的备份。...这样,用户可以手动验证创建的备份内容和日志文件,并决定如何处理MySQL数据目录的当前内容。退出命令时,将显示完全还原文件所需的命令。 完成后保存并关闭文件。...自建数据库难免会遇到上面的问题,那么,我们还是建议您使用云数据库进行搭建,省去数据迁移等麻烦操作,购买数据库详见:https://cloud.tencent.com/product/cdb-overview
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云