首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

建立本地的Blast数据库

BLAST程序有以下几种: BLAST的在线版https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi可以方便的进行单一的同源性序列搜索,但是不方便进行大批量的数据操作,也不能建立自己的数据库...接下来小编就要教大家如何建立本地的BLAST数据库。 基于BLAST优秀的算法,BLAST程序可以轻松的在普通的个人电脑中运行。...R 输入cmd命令,再通过cd 命令进入当前的bin 文件夹,或者直接在bin文件夹内按住shift和鼠标右键,选择在此文件夹打开命令提示符 我们通过makeblastad -help命令,查看创建本地数据库的帮助文件...可以发现需要输入文件,在NCBI数据库,我们可以方便地下载我们需要的序列文件,下载后复制到bin文件夹内,方便操作。...-in 后面是空格加输入数据库文件的名称,-dbtype后面是空格加数据库类型(核苷酸是nucl,蛋白质是prot),-out后面是空格加输出数据库名称 接下来就可以拿目标序列来比对了,由于手头上没有相似的序列

6.5K91
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

MySQL数据库语法_mysql建立学生表数据库

mysql数据库基本语法 DDL操作 创建数据库 语法:create database 数据库名; 查看所有数据库 语法:show databases; 切换(使用)数据库 语法:use + 数据库名...; 创建一个表 语法:create table 表名( 字段名称1 字段类型, 字段名称2 字段类型, 字段名称3 字段类型, …… …… ); 查看数据库中所有表 语法: Show tables...修改后的内容 where (限制条件) 查看数据 语法:select 字段名称 from 表名 where 条件 删除表 语法:drop table 表名; truncate table 表名; 删除数据库...主表作为约束的字段需要是该表的主键 DQL操作 基础查询 查询所有: select * from 表名 查询指定列的数据: Select 列名1,列名2…… from 表名 写哪(几)列查哪列 在当前数据库查看其他数据库中的表...Show tables in 数据库名 查看非当前数据库下表的数据 Select 列名 from bank.user; Where 查询条件 关系运算符:> < = !

15.2K30

本地安装并创建MySQL数据库

3 新建本地数据库首先将MySQL安装路径添加到环境变量中:右键点击“我的电脑”-“属性”-“高级”-“环境变量”-“系统 变量”-双击“Path”-添加路径-“确定”。...创建新数据库,命名为mydata:create database mydata;展示本地全部的数据库:show databases;可以看到新创建的mydata数据库。...4 连接本地数据库打开Dbeaver,文件——新建——数据库连接,数据库类型选择“MySQL”,服务器地址填localhost,端口号填3306,数据库填刚刚创建的mydata,用户名和密码均为root...连接完成后,可以看到左侧已经出现了名为“mydata”数据库。点击“mydata”下的“数据库”,右键选择“新建数据库”,创建一个新的数据库,命名为“sys”。...在“约束”中,通过新增约束建立主键:图片往该表中添加数据:图片5 启动数据库每次使用前需要启动数据库:net start MySQL88否则会出现以下报错:com.mysql.cj.jdbc.exceptions.CommunicationsException

5.6K42

MySQL数据库基础——本地文件交互

从这一篇开始,大概会花四五篇的内容篇幅,归纳整理一下之前学过的SQL数据库,一来可以为接下来数据分析工作提前巩固基础,二来把以前学的SQL内容系统化、结构化。...今天这一篇仅涉及MySQL本地文本文件的导入导出操作,暂不涉及主要查询语言以及MySQL与R语言和Python的交互。...平台使用Navicat Premium(当然你也可以使用MySQL自带的workbench或者MySQL Conmand line)。...以下仅涉及MySQL中使用命令行语句导入/导出本地磁盘的文本文件(csv\txt文件)。 文件导入(csv): 在导入本地文件之前,请确保你的MySQL设置有本地文件导入导出权限。...在导入MySQL之前,需要在指定数据库中先建立空表,以备之后导入。

6.9K120

数据库建立

1, 在我们写完计划表后开始建立数据库数据库建立不是说建立完了就可以了,到后面是需要不断地改善的,因为前期的数据我们可能列举出表时不够完整,或者表与表之间的关系链接错误,重复。...2, 随着项目的功能实现,渐渐的数据库的数据显示出不足,我们就要进行改善 1, 数据库建立要先对项目的功能有足够的理解,要熟悉项目,把项目的表列举出来,那些数据是属于那个表的,一个表里面需要获取到那些表的信息...2, 然后员工表有不同的员工,有服务员,销售员,前台等等的员工,我们就建立一个员工职称,代表不同的员工类型。...1,把需要完成的表和表里面的信息连接出来后我们就开始建立模型,项目数据库建立之前需要在PowerDesigner把表建成物理模型, 2,物理模型的建立注意在建立的过程中,主键ID要把后面的主键和不可以为空勾上...8, 然后在数据库建立新的数据库,引入文件,执行。

2.6K30

MySQL数据库建立数据库和表(命令行方式)

最近在学数据库系统概论,以前建表都是直接用workbeach,但是作为一个计算机专业的学生,我觉得能敲的时候就少点,所以分享一个自己用命令创建数据库和表的过程,希望对一些人有点用!...安装好数据库后,我们可以看到这些东西 可以这么简单的认识,划红线的是通过命令行来操作数据库,划绿线的是操作数据库的图形化界面,这里我分享的是通过命令行来操作,以《数据库系统概论》第五版第三章为例创建一个我们平时练习操作数据库所需的数据库...首先我们运行MySQL 8.0 Command,进入后需要输入密码,之后我先选择查看当前数据库中服务器中所有的数据库:show databases;(请别忘记了后面的分号) 如上这些都是系统自带的数据库...接下来创建我们需要的数据库,我创建一个存放学生-课程信息的数据库stu_cour:create database stu_cour; 接下来我们开始建表,建表前先确认我们是在stu_cour数据库中建表...20) UNIQUE, /*Sname 取唯一值*/ Ssex CHAR(2), Sage SMALLINT, Sdept CHAR(20) ); 由此就完成了数据库表的建立

4.8K10

使用MySQL Workbench建立数据库建立新的表,向表中添加数据

初学数据库,记录一下所学的知识。我用的MySQL数据库,使用MySQL Workbench管理。下面简单介绍一下如何使用MySQL Workbench建立数据库建立新的表,为表添加数据。...点击上图中的“加号”图标,新建一个连接, 如上图,先输入数据库的账号密码,帐号默认为root,填好密码后 点击“OK”,连接就建立好了,建立完成后,会出现一个长方形的框框,双击它,出现下图所示页面...点击图中的红圈里的按钮,新建一个Schema,即数据库(个人理解。。)...一下刚刚建立好的数据库mydatabase,然后再创建表,不然会出错,右键点击Tables 然后点击Create new tables ,填写表名,以及表列的信息,之后点击 apply ,一张表就建完了...中向数据库中的表中添加数据大致就是这个样子。

9.7K30

Python建立数据库

Python建立数据库 所谓数据库,即存储数据的仓库。每一个数据库可以存放若干个数据表,这里的数据表就是我们通常所说的二维表,分为行和列,每一行称为一条记录,每一列称为一个字段。...检查数据库是否存在 你可以通过使用“SHOW DATABASES”语句列出系统中所有数据库,检查数据库是否存在: 实例 返回系统中数据库列表: import mysql.connector mydb...= mysql.connector.connect( host = “local host”, user = “your user name”, passwd = “your pass word...mycursor = mydb.cursor( ) mycursor.execute(“SHOW DATABASES”) for x in mycursor: print(x) 或者你可以在建立连接时尝试访问数据库...: 实例 尝试连接数据库”mydatabase”: import mysql.connector mydb = mysql.connector.connect( host = “local host

2.4K20

MySQL数据库物理备份本地恢复方案

阿里云:《RDS MySQL物理备份文件恢复到自建数据库》 腾讯云:《云数据库 MySQL - 使用物理备份恢复数据库》 华为云:《通过备份文件恢复到自建数据库MySQL)》 本文将基于容器工具的方式进行数据恢复处理.../restore:/var/lib/mysql-files:rw 上面的配置中,我声明了两个目录用于保存数据,首先是用于放置云数据库备份的 restore 目录,其次是用于暂存还原后的数据库文件的 data...进行数据恢复 将你需要恢复的数据复制到本地的 restore目录中(对应容器内 /var/lib/mysql-files/ 目录),也可以使用 docker cp 命令直接向容器复制,不过对于大文件来说...导出数据文件 在上文的操作过程中,考虑数据库实例需要稳定运行,所以并没有直接将数据恢复到 /var/lib/mysql 目录,而是在 mysql-files 目录进行解压缩处理。...| sys | +--------------------+ 5 rows in set (0.01 sec) 会发现云端的 MySQL 数据库已经被正确的还原在了本地

3.5K20

MySQL数据库物理备份本地恢复方案

阿里云:《RDS MySQL物理备份文件恢复到自建数据库》 腾讯云: 《云数据库 MySQL - 使用物理备份恢复数据库》 华为云:《通过备份文件恢复到自建数据库MySQL)》 本文将基于容器工具的方式进行数据恢复处理.../restore:/var/lib/mysql-files:rw 上面的配置中,我声明了两个目录用于保存数据,首先是用于放置云数据库备份的 restore 目录,其次是用于暂存还原后的数据库文件的 data...进行数据恢复 将你需要恢复的数据复制到本地的 restore目录中(对应容器内 /var/lib/mysql-files/ 目录),也可以使用 docker cp 命令直接向容器复制,不过对于大文件来说...导出数据文件 在上文的操作过程中,考虑数据库实例需要稳定运行,所以并没有直接将数据恢复到 /var/lib/mysql 目录,而是在 mysql-files 目录进行解压缩处理。...---------------+ 5 rows in set (0.01 sec) 会发现云端的 MySQL 数据库已经被正确的还原在了本地

5K20
领券