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这也太简单了吧!一个函数完成数据相关性热图计算和展示

NGS系列文章包括Linux基础 (PATH和path,傻傻分不清)、R基础 (ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色))、Python基础 (Python学习极简教程)、NGS基础、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Limma差异分析、火山图、功能富集)、图形解读 (可视化之为什么要使用箱线图?)、GSEA (一文掌握GSEA,超详细教程)、WGCNA (WGCNA分析,简单全面的最新教程)等内容。

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深入对比数据科学工具箱:Python和R之争

在真实的数据科学世界里,我们会有两个极端,一个是业务,一个是工程。偏向业务的数据科学被称为数据分析(Data Analysis),也就是A型数据科学。偏向工程的数据科学被称为数据构建(Data Building),也就是B型数据科学。 从工具上来看,按由业务到工程的顺序,这个两条是:EXCEL >> R >> Python >> Scala 在实际工作中,对于小数据集的简单分析来说,使用EXCEL绝对是最佳选择。当我们需要更多复杂的统计分析和数据处理时,我们就需要转移到 Python和R上。在确定工程实施和大数据集操作时,我们就需要依赖Scala 的静态类型等工程方法构建完整的数据分析系统。 Scala和Excel是两个极端,对于大多数创业公司而言,我们没有足够多的人手来实现专业化的分工,更多情况下,我们会在Python和R上花费更多的时间同时完成数据分析(A型)和数据构建(B型)的工作。而许多人也对 Python和R的交叉使用存在疑惑,所以本文将从实践角度对Python和R中做了一个详细的比较。

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