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数组计算模块NumPy

NumPy是Python数组计算、矩阵运算和科学计算的核心库。...提供了高性能的数组对象 提供了大量的函数和方法 NumPy使用机器学习中的操作变得简单 NumPy是通过C语言实现的 NumPy的安装  pip install numpy  数组的分类 一维数组 跟Python...属性和transpose方法实现  数组的增加 水平方向增加数据 hstack()函数 垂直方向增加数据 vstack()函数  数组的删除 使用delete()函数  矩阵 矩阵是数学的概念,而数组是计算机程序设计领域的概念...在NumPy中,矩阵是数组的分支,二维数组也称为矩阵 。...创建矩阵    numpy.mat()函数 矩阵运算    可以对矩阵进行加、减、乘、除运算  矩阵的乘法运算 import numpy as np A = np.array([[1, 2], [3,

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Python-Numpy数组计算

参考链接: Python中的numpy.greater 一、NumPy:数组计算  1、NumPy是高性能科学计算和数据分析的基础包。它是pandas等其他各种工具的基础。...(dim1,dim2)              创建dim1*dim2的零矩阵 numpy.arange numpy.eye(n) /numpy.identity(n)     创建n*n单位矩阵 numpy.array...)               计算绝对值 numpy.square(array)                 计算各元素的平方 等于array**2 numpy.log/log10/log2(array...)         计算各元素的各种对数 numpy.sign(array)                   计算各元素正负号 numpy.isnan(array)                 ...计算各元素是否为NaN numpy.isinf(array)                  计算各元素是否为NaN numpy.cos/cosh/sin/sinh/tan/tanh(array) 三角函数

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使用numpy计算分子内坐标

以下是几个相关的关注点: 在计算距离、角度和二面角的过程中,我们都会使用到序列原子之间的相对矢量(B, A-1, D),那么在计算过一次之后我们应该保存下来以供几个不同的函数使用。...在numpy或者是一些常用的深度学习框架中,我们最好在代码实现阶段就去避免 \frac{x}{0} 这种情况的出现,一般在遇到除法、反三角函数或者对数函数的时候,我们可以在对应的位置加一个小量 \epsilon...在计算相对矢量的时候我们一般使用的是错位相减,比如可以使用crd[1:]-crd[:-1],但是这里我们在计算过程中使用的是numpy.roll对数组进行滚动之后做减法,最后再去掉一个结果。...# inner_crd.py import numpy as np np.random.seed(1) EPSILON = 1e-08 def get_vec(crd): """ Get the...总结概要 本文主要介绍了在numpy的框架下实现的分子内坐标的计算,类似的方法可以应用于MindSpore和Pytorch、Jax等深度学习相关的框架中。

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科学计算Python库:Numpy入门

前言 NumPy 是 Python 中科学计算的基础包。...科学计算离不开numpy,学习数据分析必先学numpy!!! 本文由浅入深,对numpy进行入门介绍。讲解了创建数组、索引数组、运算等使用。...科学计算64位浮点型最为常见 ndarray.dtype # 数组每一个元素的字节大小 ndarray.itemsize # 数组重塑 ndarray.reshape() ---- 常用常量 # 正穷大...传入的参数最好为元组,元组参数为你想重塑的最终形状 # 使用resize()会改变原数据,不推荐使用 a.resize((2,3)) 小技巧:如果想自动推导shape形状,可以使用-1值占个位,计算机会自动处理...array2) diff=np.setdiff1d(array2,array1) ---- Axis轴的个人理解 网上有人把axis=0理解为行,axis=1理解为列;这个只能用于理解二维数组,但是科学计算

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详解Python科学计算NumPy

NumPy是Python中最受欢迎的科学计算库之一,它提供了高效的多维数组操作和数值计算工具。本文将详细介绍NumPy库的使用方法,包括数组的创建与操作、数学函数、统计函数以及数组的读写等。...通过代码示例和详细解释,帮助你全面了解和应用NumPy库进行科学计算和数据分析。一、安装和导入NumPy库在使用NumPy之前,首先需要安装NumPy库。...NumPy库的数学函数提供了广泛的数值计算能力,方便进行科学计算和数据分析。统计函数NumPy库还提供了许多统计函数,可以对数组进行统计分析,例如求和、均值、标准差等。...通过安装和导入NumPy库、数组的创建与操作、数学函数和统计函数、数组的读写等示例,我们全面了解了NumPy库在科学计算和数据分析中的强大功能。...NumPy库提供了高效的多维数组操作和丰富的数值计算工具,是进行科学计算和数据处理的重要工具之一。希望本文能够帮助你理解和应用NumPy库,提升数据分析和科学计算的能力。

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Numpy计算近邻表时间对比

在Python中的实现,因为有numpy这样的强力工具,我们在计算原子两两间距时,只需要对一组维度为(N,D)的原子坐标进行扩维,分别变成(1,N,D)和(N,1,D)大小的原子坐标。...之所以这样分开计算,是为了减少原子跟自身间距的这一项重复计算。那么对于整个空间的原子,就需要计算(N,27M)这么多次的原子间距,是一个复杂度为O(NlogN)的算法。...Numpy代码实现 这里我们基于Python中的numpy框架来实现这两个不同的计算近邻表的算法。其实当我们使用numpy来进行计算的时候,应当尽可能的避免循环体的使用。...import time from itertools import chain from operator import itemgetter import numpy as np # 在格点法中,为了避免重复计算...总结概要 本文介绍了在Python的numpy框架下计算近邻表的两种不同算法的原理以及复杂度,另有分别对应的两种代码实现。在实际使用中,我们更偏向于第二种算法的使用。

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