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numpy ndarray索引-从元组检索索引
python、arrays、numpy
我以前也问过类似的问题，但我仍不完全确定numpy是如何组织其指数的。imFrag.append(Padded[:100, :100, :100)
将数组分割成我试图获得每个切片的原始索引。我可以使用以下方法对整个3d
浏览 2提问于2016-05-06得票数 2
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numpy中大型三维图像的下采样
python、image、numpy
我需要降采样大型3D图像(30 by +)，这些图像由一系列由任意非干涉因素组成的二维tiff切片组成。scipy.ndimage.zoom可以很好地处理输入到内存中的图像。我正在考虑读取堆栈的部分内容，并使用scipy.ndimage_map_coordintes获取插值的像素坐标。另一个想法是使用numpy.memmap创建内存映射数组，并在此基础上执行scipy.ndimage.zoom。
在我这么做之前，还有谁有更好的
浏览 3提问于2014-12-23得票数 5
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在python中从2D切片创建3D绘图
python、plot
我想从一系列的2D切片用python绘制一个3D框。切片都是黑白的。我猜最后只会看到盒子的表面，因为黑色区域会覆盖白色的内部。至少这对我的目的来说也是足够的。最好的事情将是如果我可以添加PNG格式的单个切片(大约200个)来制作3D盒子。
用python可以做到这一点吗？或者，有没有其他的程序可以替代它呢？
浏览 3提问于2012-09-18得票数 1
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移位3Dnumpy数组
python、arrays、numpy、3d、shift
我希望能够沿高度轴在任意方向上移动3D numpy数组。如果给定3的正移位，则数组中的所有值都会向上移位，并且在数组的底部会出现3个新的零片。如果给出了负移位，则会发生相反的情况，所有切片都会沿着高度轴向下移动，并且新的零切片会出现在顶部。
我已经尝试将数组重塑为1D，并左右移动，然后返回到3D。但是，这会使数组沿错误的方向移动。在重塑之前，我尝试实现了n
浏览 3提问于2013-04-09得票数 1
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从三维数组中获取和保存二维切片的问题
python、arrays、image、numpy
我试图保存用以下代码切片的3D数组的2D切片：import numpy as npnp.save(zSlice, os.path.join("D:/Volumes convertidos LIDC/slice01.npy"))
我得到了一个错误: TypeError:预期的str我需
浏览 4提问于2022-01-13得票数 1
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如何为MPR计算双片之间的空间？
dicom、slice
由于显示了，MPR视图，基于字典的。我用一系列的dicom文件制作了一个3D数组。我从冠状面和矢状面展示。My 3D array includes:
- c = column value for every dicoms我不知道如何
浏览 2提问于2013-02-18得票数 7
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使用matplotlib显示体素大小不均匀的3D数据
python、matplotlib
我正在尝试使用matplolib显示3D数据。我有一个表示DICOM切片的numpy数组列表。每个切片都包含结构点。我想在3d中显示此结构，但dicom体素形状不规则。例如，它们的形状是1.4，1.4，2。有没有一种方法可以在x，y和z维度上缩放轴，这样它就可以显示结构的真实外观？目前，当我显示它时，它看起来是变形的。
浏览 0提问于2018-07-26得票数 1
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有了复数到复数的2DFFT，如何做3DFFT？
algorithm、3d、fft、dft
假设我们实现了2D复数到复数的FFT。我们现在如何使用它来实现3D FFT --它只是N个2D切片吗？
浏览 31提问于2018-09-09得票数 1
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如何在matplotlib三维曲面图上突出显示一个切片？
python、matplotlib
我有一个三维的表面图。我还想用2D绘制这个图的切片，并以某种方式在切片的3D图上指明这些切片的来源(例如将切片上的点着色以“突出显示”该切片，或绘制一个相交平面或其他东西)。下面是一个示例，我只是将一个特定的行设置为0，这样我就可以看到切片在3D图上的位置。import numpy as np
from mpl
浏览 1提问于2019-08-13得票数 5
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如何通过3D图像生成2D裁剪？
numpy、3d、image-rotation、scikit-image、ndimage
我有一个包含一些数据的3D数组(一个光栅3D图像)。我想用合适的插值(最好是线性的--在这种情况下可能是“三线性”)得到一个通过该数组的2D剪切。然而，可以方便地描述切割的平面，例如使用法向量和距离。
如果切割平行于其中一个轴，这是微不足道的，只需对3D数组进行切片(使用numpy索引切片)。但如果切割不平行于轴，我看不到一个好的方法来开始解决这个问题。唯一想到<
浏览 19提问于2017-01-30得票数 1
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如何对不同范围的医学图像进行插值
itk、tomography-reconstruction
我希望对PET和CT的数据进行插值，以便底层阵列具有相同的维度-在正常情况下，这很简单，但我有PET和CT扫描范围不同的数据集-因此，我需要首先修剪更大的研究。问题是，选择切片的子集将导致较大图像的小而可见的部分从较小的图像中突出(因为体素的大小不同)，如果我理解正确的话，这可能会破坏插值。我想这是一个常见的问题，那么如何在不仅体素维度不同，范围也不同的情况下实现
浏览 6提问于2021-10-18得票数 0
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Numpy ndarray的动态轴标度
numpy、indexing
我希望在三维数组的给定方向上获得2D切片，其中direction (或提取切片的轴)由另一个变量给出。假设idx是3D数组中2D切片的索引，并假定direction是获取该2D切片的轴，则最初的方法是： return A[idx, :, :]
elif directionnumpy有捷径吗？/更快的功能，因为
浏览 9提问于2015-06-27得票数 10
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Python:如何查找dataframe中特定列中的离群值
python、pandas、dataframe、outliers
我正在尝试从Python中的dataframe中的特定列中删除异常值。我从一篇几年前的文章中找到了一个解决方案，它应该可以工作，但可以搜索整个数据帧：由于我的Timestamp'df_final[(np.abs(stats.zscore(
浏览 0提问于2019-11-14得票数 0
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将3D Numpy Array的切片存储为变量
python、numpy
我有不同的3D阵列，我正在观察的二维切片，沿着X，Y或Z轴。为了简化我的代码，我希望有一个声明切片的位置，例如my_view = [10, :, :] # my_view = [:, 4, :] # my_view= [:, :, 7]
浏览 3提问于2021-12-07得票数 0
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生成3D对象(例如通过Mayavi)并将其导出为3D图像堆栈(例如tiff)
python、numpy、3d、vtk、mayavi
我当前的任务是生成一个3D图像空间，其中有我设计的3D对象(等值面)，并将其导出为图像堆栈(numpy或tiff)。 我开始使用Mayavi来生成3D等值面。我知道Mayavi最初是为了提供3D可视化而设计的，但我想找到一种方法，可以将3D对象导出到3D图像堆栈中，就像(z，y，x)的数值形式一样。我最初的想法是沿着z轴迭代地从Mayavi mlab对象中
浏览 143提问于2021-06-30得票数 0
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在不使用列表理解的情况下为列表中的每个列表切片熊猫系列
python、pandas
我有一个熊猫系列，我想根据切片索引列表进行切片。但由于我有1.5百万行和1.5百万切片，这需要相当长的时间。我在想能不能用一种更快的矢量化方式？
结果可能是从numpy数组，列表，系列，元组，这并不重要。
浏览 4提问于2022-11-16得票数 1
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如何在numpy中获得n维数组的切片的总和？
python、arrays、multidimensional-array、numpy
我在NumPy中有一个n维数组。我想计算一个切片中所有元素的总和。例如：z = 13 4
5 6当我得到z=1的切片时，我希望得到10，而对于z=2，我希望得到26。我可以在3D空间中使用以下内容，但如何在n维空间中使用呢？
(array.sum(axis = 0)).sum(axis = 0)
浏览 0提问于2012-12-05得票数 0
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第一任意尺寸的Numpy切片
python、numpy
关于切片最后一个维度有一个很好的问题/答案：：对于切片一个numpy数组以获得最后一个维度中的第一个索引，可以使用.或者是椭圆，如果需要第一个N维呢？对于3D myarray，N=2：对于4D阵列，N=2：这可以推广到任意的维度吗？
浏览 1提问于2018-09-21得票数 0
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在不使用数值数组的情况下转置h5py数据集
python、arrays、h5py
我需要转置h5py数据集，以访问3D数组作为2D图像堆栈。
我希望能够在3个可能的方向中的任何一个方向切片3D体积，同时保持第一个维度作为图像索引。我不想将我的数据集转换为numpy数组，以避免在只需要显示部分图像时从磁盘读取整个数据集。
浏览 1提问于2016-12-16得票数 3
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从3D numpy.MaskedArray中删除切片
python、python-3.x、numpy、masked-array
我有一个3D numpy.MaskedArray，我想删除第三个切片。如果我是一个numpy.array，我可以只使用numpy.delete函数，例如np.delete(arr, obj=3, axis=0)。但是，此功能不适用于np.MaskedArrays。如何才能在不更改数组类型的情况下以pythonic方式完成此操作？
浏览 7提问于2019-11-06得票数 0
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