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R语言读取 xlsx 和xls 文件

「前言:」 ❝今天我用openxlsxread.xlsx读取xls文件时,竟然报错了。我记得有一个包是可以读取Excel2003,搜索了一下,发现不太容易查找,就写一遍博客记录一下。...毕竟,很多东西放到网上,一搜索看到自己写东西,那种爆棚感觉,好像互联网成了我笔记本,666……,所以对自己有帮助,才是对别人有帮助。搜到答案,自己总结一下,然后写一篇博客。...❞ xlsx文件,是2007,2013,2016版本Excel文件,R语言中可以通过openxlsx包进行读取。 1. 读取xlsx文件 > dd = read.xlsx(".....读取xls文件报错 如果读取xls文件,报错: > dat = read.xlsx("计算遗传力.xls")Error in read.xlsx.default("计算遗传力.xls") : openxlsx...汇总 openxls通过函数read.xlsx读取xlsx文件 readxl通过函数read_xls读取xls文件 软件安装方法:install.packages("openxlsx") 以及 install.packages

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文件操作

R提供了大量读入文件函数,这些函数通常是以read.*开头,后面接文件扩展,例如read.csv,read.xlsx,read.spss 等。其中最常用为 read.table。...读入文件之后,需要验证文件是否读入成功,通常使用 head 函数截取文件头部显示出来,判断格式是否正确,在 Rstudio 也可以使用 View()函数将全部内容显示出来。...如果格式不正确就需要修改命令重新读取文件;如果没有问题,就可以对数据进行后续分析了。...数据处理结束之后,需要将存储在变量结果保存到文件R 提供了大量写入文件函数,这些函数通常与 read 系列都是对应,用法也类似使用起来也并不难。...,一个工作簿包含多个工作表(sheet),因此需要指定读取工作簿那个工作表,可以指定工作表名字,也可以使用顺序号。

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R语言技巧 - 多sheet文档读取并合并输出

--- title: R语言技巧 - 多sheets文档读取并合并输出 tags: Rundefined Excel categories: R语言技巧 date: Feb 26, 2023 at 21...:12:11 author: yeyezi subject: R语言技巧 - 多sheets文档读取并合并输出 偶尔我们会遇到将多个sheets合并为一个需求, 但是如果有几十个sheets合并起来既容易出错又麻烦...代码如下: rm(list = ls()) library(librarian) shelf(openxlsx, dplyr, plyr) setwd("Project/EXCEL/") shtnames...::write.xlsx(dat, "EXCEL.xlsx", colWidths = "auto") 效果对比 原文档: 图片 处理后: 图片 稍事修改: 图片 当然如果相对分sheet表格进行操作也是可以..., 只需要改动其中提取循环内容就可以: for (i in seq_along(shtnames)) { xlsxlist[[i]] <- read.xlsx("各省高校经费预算 O.xlsx

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R语言︱文件读入、读出一些方法罗列(批量xlsx文件、数据库、文本txt、文件夹)

其中非结构化数据,在读入时候会出现很多分隔符问题, 可以见博客:【R】数据导入读取read.table函数详解,如何读取不规则数据(fill=T) ————————————————————————...xlsx包加载成功后,用read.xlsx就可以直接读取xlsx文件,还可以指定读取行和段,以及第几个表,以及可以保存为xlsx文件,这个包还是很强大。...——需要read.xlsx这一步骤 ##批量读入文件夹xlsx文件 #如何批量读取一个文件夹各种txt文件 micepath <- "C:/Users/long/Desktop" micefiles...library(openxlsx) data=read.xlsx("hsb2.xlsx",sheet=1) ———————————————————————————————————————————————...所以可以用file.path方式直接生成,比较方便,而且绝对正确

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R语言从入门到精通:Day4

这些数据类型在我们运用R语言解决实际问题时候都非常有用,在上节例子我们是在R里面直接生成数据,但是实际数据分析,如何快速灵活读取和处理多种格式外部数据呢?...这里我给大家推荐一个不需要这些依赖R包:openxlsxopenxlsx安装如图8)。...openxlsx帮助文档里介绍了三个写入数据和一个读取数据函数,其中读取数据函数read.xlsx()就能实现xlsx文件读取。...这个函数命名和用法都和read.table()非常类似(如图9),大家不妨自己尝试一下如何使用这个函数。 ? 图8:包openxlsx安装 ? 图9:函数read.xlsx()参数 4....常用数据操作函数 要求:掌握 读取数据之后,大家就可以开始做一些简单数据处理了。R语言中有很多常用函数,这里先给大家一个简短表格,供大家在读取数据后做一些练习。

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R语言之数据获取操作

1.获取内置数据集 R 内置数据集存在于各个包,其中基本包 datasets 里只有数据集,没有函数。这个包提供了近 100 个数据集,涵盖医学、自然、社会学等各个领域。...而在函数 read.csv ( ) ,参数 header 默认值为 TRUE。因此,在读入数据前,建议先打开原始文件进行查看,然后设置恰当参数正确地读入数据。...还可以借助第三方包(例如 openxlsx 包、readxl 包和 gdata 包)直接读取 xlsx 或 xls 格式数据文件。...以 openxlsx 包为例: library(openxlsx) write.xlsx(patients, "patients.xlsx") patients.data <- read.xlsx("patients.xlsx...foreign 包里函数 read.epiinfo( ) 可以直接读取 EpiData 生成 .rec 文件,但是建议先在 EpiData 中将录入数据导出为 Stata 数据文件,然后在 R 中使用函数

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ExcelSNP数据如何变为plink格式

转化代码 library(openxlsx) library(tidyverse) library(data.table) dat = read.xlsx("genotype.xlsx") dat...这个一般是map和ped数据不匹配,可以通过Rmap和map查看一下什么情况: > dim(map) [1] 43251 4 > dim(ped) [1] 185 43257 可以看到...常见问题2:缺失值为NN 这里,读取数据时,将其定义为缺失: dat = read.xlsx("geno20.xlsx",na.strings = "NN") 再处理: plink --file...思路: 将其读取R 转置 保存到本地 然后通过grep,去掉相关行 然后再读到R,再进行处理。 报错总结 数据有空行,有缺失,有indel。...更新代码,判断是否有空行,将NN作为缺失读取R,可以避免上面的情况,更新后代码如下: library(openxlsx) library(tidyverse) library(data.table

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多元统计分析:对应分析

A:因子分析,可用较少公共因子 来提取 样本数据 绝大部分信息,以便通过较少因素而获得足够信息, 缺点:对于R型、Q型因子分析,即对 变量、样本 分别做因子分析,并没有考虑变量与样本间联系,损失了一部分信息...对应分析就是 通过 数学变换,把 Q型 、R型 因子分析 结合起来 卡方效验 H_0: 相互独立 H_1: 相互影响(不独立) library(openxlsx) d10.1 = read.xlsx('...library(openxlsx) Case10 = read.xlsx('.....× Y标准差 而经数据标准化后,标准差为1,所以此时分母为1,相关系数=协方差 标准化: 消除 列间 量纲差异,无法消除(行间)样本间 量纲差异 独立性效验 仅 判 因素A和因素B是否 独立,若...如何通俗易懂地解释「协方差」与「相关系数」概念? 《多元统计分析与R语言建模》王斌会 《R语言实战》Robert I.

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R语言中如何写入xlsx不同sheet表格

背景: 想要实现一个功能, 将不同数据写入一个Excel, 不同数据对应不同sheet表, 看了一下R语言, 找到解决方法如下....测试思路 模拟两个数据框 新建一个list表 写入excel 代码 aa<-data.frame(1:5,2:6)ab<-data.frame(2:60,13:71)library(openxlsx)...感想: 最近发现, R语言中list更好用, 我R语言水平感觉要进步一个台阶了......运用R语言list示例: 需求描述: 现在有3个Excel, 想把这些Excel合并到一个Excel不同sheet表, 如何实现?...解决问题思路: 1, 使用dir函数, 返回文件名集合 2, 新建一个list, 赋值为空NULL 3, 写一个for循环, 循环读入, 并保存到list 4, 对list重命名 代码如下: a =

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R语言批量读取300个Excel表格

R语言都是可以实现。 还有一个Excel表格,有100个Sheet,想把这100个sheet表读取然后合并。...还有一种情况,是有100个Excel表格,想把其合并到一个Excel不同sheet。 虽然,我知道大家电脑内存很大,但是你这样折腾Excel真的好吗???...批量读取 2.1 批量读取多个Excel数据 「步骤:」 先把目录下Excel名称列出来 批量读取 后续操作 library(tidyverse) library(openxlsx) list_name...知识点总结 使用了map和匿名函数进行批量操作 写入多个Excel时,用了map2函数,其实还可以用walk2函数,walk2就不会返回结果到终端了 默认write.xlsx函数,支持写入list就是多个...sheet表格 有时候重命名list更有用,比如写入到不同sheet表格,名称就是不同sheet表名称 读取不同sheet表格时,可以用1,2,3表示对应sheet 另外,如果想把批量读取Excel

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R-ggplot2 空间绘图 - 房价气泡图绘制

目前计划推出基础图表绘制教程推文(会同时推出R和Python两个版本),原因在于有时苦苦找不到数据,不仅导致想绘制图表完成不了,而且也白白浪费了时间,再者也有小伙伴私信要求多些基础教程推文,当然...geojson数据格式读取 ggplot2 可视化展示 openxlsx 实现R灵活读取excel文件 ggtext包实现文本定制化操作 geojsonio包对geojson数据格式读取 这里使用数据和上期推文数据一样...,读取geojson格式文件代码如下: HK <- geojson_read("香港特别行政区.json",what='sp') 即可实现R语言对geojson格式地图文件读取。...散点图层添加 同样,我们使用上篇推文中房价数据,这里数据为xlsx 格式数据,我们需使用openxlsx 包进行excel文件数据方便读取,代码如下: library(openxlsx) #读取Excel...ggtext 实现文本同行不同颜色设置 对一行文本不同颜色、粗细等文本属性设置,ggtext包 可以轻松实现(这个在Python目前还无法高效实现),这里我们只放出相应代码,如下: #导入ggtext

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玩转数据处理120题|R语言版本

(df$grammer) 第二期:数据处理基础 21 数据读取 题目:读取本地EXCEL数据 难度:⭐ R解法 #R语言处理excel不友好,直接读取日期时间数据会变成实数 #openxlsx::read.xlsx...detectDates参数只能识别纯日期 #as.Data转换该列后时间数据丢失,只有日期 #故先把excel文件转存为csv后用readr包读取 # 该方法不理想 library(openxlsx...lead(df,5) 77 数据计算 题目:使用expending函数计算开盘价移动窗口均值 难度:⭐⭐ R解法 #R没有expanding完全一致函数 #考虑到expanding实际功能就是累积均值...:从CSV文件读取指定数据 难度:⭐⭐ 备注 从数据1前10行读取positionName, salary两列 R语言解法 #一步读取文件指定列用readr包或者原生函数都没办法 #如果文件特别大又不想全部再选指定列可以用如下办法...题目:从CSV文件读取指定数据 难度:⭐⭐ 备注 从数据2读取数据并在读取数据时将薪资大于10000为改为高 R语言解法 library(readr) df2 <- read_csv('数据

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火山图|给你geneList,帮我标到火山图上

一 载入R包,数据 library(ggplot2) library(openxlsx) library(dplyr) #绘制火山图数据 data <- read.xlsx("火山图.xlsx", sheet...了解一下ggplot2绘图方式,标示基因就是各个基因text,然后想办法将其赋予到一个 aes 即可。 三 标示指定基因 和上面类似,将指定基因添加到绘制数据即可。...3.1 读入含有geneList文件 gene <- read.xlsx("火山图.xlsx", sheet = 2) gene$geneList <- gene$gene ?...3.3 标示文件指定基因 ggplot(data = data2, aes(x = logFC, y = -log10(adj.P.Val), color = change)) + geom_point...3.4 ggrepel 解决重叠问题 如果目标标示基因太多会导致重叠,可使用ggrepal函数 library(ggrepel)ggplot(data = data2, aes(x = logFC,

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