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.| 通过异质数据集投射到一个共同细胞嵌入空间进行在线单细胞数据整合

Zhang通讯发表在 Nature Communications 研究成果:作者提出了SCALEX,一种深度学习方法,通过细胞投射到一个批次不变、共同细胞嵌入空间,以真正在线方式(即不需要重新训练模型...首先,SCALEX实现了一个没有批处理编码器,它只从输入单细胞数据(x)中提取与生物相关潜在特征(z),以及一个特定批处理解码器,它通过数据重构期间批处理信息纳入其中,从z中重构原始数据。...作者根据基准数据集,通过统一模态逼近和投影(UMAP)嵌入可视化以及一系列评分指标,评估了这些工具整合性能。...SCALEX通过在线投影添加新数据,增加了现有细胞空间范围和分辨率 SCALEX编码器具有通用性,可以将不同来源细胞投射到一个共同细胞嵌入空间,而不需要重新训练模型,这使得SCALEX能够以在线方式单细胞数据与现有的数据进行整合...图3 异质数据射到一个共同细胞嵌入空间中。 图4 构建一个可扩展小鼠单细胞图谱。 图5 在线整合COVID-19 PBMC图谱。

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如何成为Python数据操作库Pandas专家?

前言 Pandas库是Python中最流行数据操作库。受到R语言frames启发,它提供了一种通过其data-frame API操作数据简单方法。...下面我们给大家介绍Pandas在Python中定位。 ? 01 了解Pandas 要很好地理解pandas,关键之一是要理解pandas是一系列其他python库包装器。...另一个因素是向量化操作能力,它可以对整个数据集进行操作,而不只是对一个数据集进行操作。...03 通过DTYPES高效地存储数据通过read_csv、read_excel或其他数据读取函数数据加载到内存中时,pandas会进行类型推断,这可能是低效。...04 处理带有块大型数据pandas允许按块(chunk)加载数据数据。因此,可以数据作为迭代器处理,并且能够处理大于可用内存数据。 ?

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Pandas系列 - DataFrame操作

行切片 附加行 append 删除行 drop 数据(DataFrame)是二维数据结构,即数据以行和列表格方式排列 数据(DataFrame)功能特点: 潜在列是不同类型 大小可变 标记轴...描述 1 data 数据采取各种形式,如:ndarray,series,map,lists,dict,constant和另一个DataFrame。...2 index 对于行标签,要用于结果索引是可选缺省值np.arrange(n),如果没有传递索引值。 3 columns 对于列标签,可选默认语法是 - np.arange(n)。...这只有在没有索引传递情况下才是这样。 4 dtype 每列数据类型。 5 copy 如果默认值为False,则此命令(或任何它)用于复制数据。...创建DataFrame Pandas数据(DataFrame)可以使用各种输入创建 列表 字典 系列(Series) Numpy ndarrays 另一个数据(DataFrame) 列表 import

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Pandas系列 - 基本数据结构

从面板中选择数据 系列(Series)是能够保存任何类型数据(整数,字符串,浮点数,Python对象等)一维标记数组。...,list,constants 2 index 索引值必须是唯一和散列,与数据长度相同 默认np.arange(n)如果没有索引被传递 3 dtype dtype用于数据类型 如果没有,推断数据类型...创建DataFrame Pandas数据(DataFrame)可以使用各种输入创建 列表 字典 系列(Series) Numpy ndarrays 另一个数据(DataFrame) 列表 import...) major_axis axis 1,它是每个数据(DataFrame)索引(行) minor_axis axis 2,它是每个数据(DataFrame)pandas.Panel(data...,dict,constant和另一个数据(DataFrame) items axis=0 major_axis axis=1 minor_axis axis=2 dtype 每列数据类型 copy

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超3000个特效镜头,复联4是怎么在短时间里完成

而距离3首仅一年,《复联4》就带着超过3000个特效镜头赶来。这背后是12家特效公司、上千人团队以及计算机工作。 今天我们不聊剧情,聊聊特效与它新武器人工智能那些事。...如果没有特效,你看到复联,画风完全是另一个模样 但特效制作一般需要花费巨大心血和财力,所以特效做不好的话会被戏称「五毛特效」。...工业光魔制作绿巨人特效 利用这种技术,工业光魔团队可以一位演员样子映射到表演者脸上,并且制作效率大大提高。...数字王国使用 Masquerade 定制机器学习软件,通过两个垂直方向高清摄像头捕获面部数据,细致追踪面部 100 到 150 个跟踪点。...之后,通过计算机视觉技术,训练和调试机器学习模型,自动将得到脸部渲染映射到灭霸这个角色上,最终得到自然面部视觉效果。

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如何在 Pandas 中创建一个数据并向其附加行和列?

Pandas一个用于数据操作和分析Python库。它建立在 numpy 库之上,提供数据有效实现。数据是一种二维数据结构。在数据中,数据以表格形式在行和列中对齐。...在本教程中,我们学习如何创建一个数据,以及如何在 Pandas 中向其追加行和列。...Pandas.Series 方法可用于从列表创建系列。列值也可以作为列表传递,而无需使用 Series 方法。 例 1 在此示例中,我们创建了一个数据。...然后,通过列名 ['Name', 'Age'] 传递给 DataFrame 构造函数 columns 参数,我们在数据中创建 2 列。...ignore_index参数设置为 True 以在追加行后重置数据索引。 然后,我们 2 列 [“薪水”、“城市”] 附加到数据。“薪水”列值作为系列传递。序列索引设置为数据索引。

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原创译文 | 最新顶尖数据分析师必用15大Python库(上)

Pandas (资料数量:15089; 贡献者:762) Pandas一个Python软件包,可以处理“标记”(labeled)和“关联”(relational)数据,简单直观。...Pandas数据整理完美工具。 使用者可以通过它快速简便地完成数据操作,聚合和可视化。 ?...Pandas库有两种主要数据结构: “系列”(Series)——单维结构 “数据”(Data Frames)——二维结构 例如,如果你通过Series在Data Frame中附加一行数据,你就能从这两种数据结构中获得一个...“数据” 使用Pandas你可以完成以下操作: 轻松删除或添加“数据” bjects数据结构转化成“数据对象” 处理缺失数据,用NaNs表示 强大分组功能 4.Matplotlib (资料数量...:21754; 贡献者:588) MatPlotlib是SciPy Stack另一个核心软件包和Python库,可以轻松生成简单而强大可视化功能。

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如果 .apply() 太慢怎么办?

如果我们想要将相同函数应用于Pandas数据中整个列值,我们可以简单地使用 .apply()。Pandas数据Pandas系列数据一列)都可以与 .apply() 一起使用。...但是,你是否注意到当我们有一个超大数据集时,.apply() 可能会非常慢? 在本文中,我们讨论一些加速数据操作技巧,当你想要将某个函数应用于列时。...唯一需要做是创建一个接受所需数量NumPy数组(Pandas系列)作为输入函数。...create_range函数,它接受两个NumPy数组,并通过简单for循环返回一个NumPy数组。...编写一个独立函数,可以NumPy数组作为输入,并直接在Pandas Series(数据列) .values 上使用它。 为了方便起见,这是本文中全部Jupyter笔记本代码。

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python数据处理 tips

在本文中,我分享一些Python函数,它们可以帮助我们进行数据清理,特别是在以下方面: 删除未使用列 删除重复项 数据映射 处理空数据 入门 我们将在这个项目中使用pandas,让我们安装包。...df.head()显示数据前5行,使用此函数可以快速浏览数据集。 删除未使用列 根据我们样本,有一个无效/空Unnamed:13列我们不需要。我们可以使用下面的函数删除它。...inplace=True直接对数据本身执行操作,默认情况下,它将创建另一个副本,你必须再次将其分配给数据,如df = df.drop(columns="Unnamed: 13")。...这可能是由于来自数据错误输入造成,我们必须假设这些值是正确,并映射到男性或女性。...如果我们在读取数据时发现了这个问题,我们实际上可以通过缺失值传递给na_values参数来处理这个缺失值。结果是一样。 现在我们已经用空值替换了它们,我们将如何处理那些缺失值呢?

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Python 数据科学入门教程:Pandas

一个是列表索引,它返回一个数据另一个数据一列。 接下来,我们注意到第零列中第一项是abbreviation,我们不想要它。...我们将在下一个教程中讨论这个问题。 五、连接(concat)和附加数据 欢迎阅读 Python 和 Pandas 数据分析系列教程第五部分。在本教程中,我们介绍如何以各种方式组合数据。...六、连接(join)和合并数据 欢迎阅读 Python 和 Pandas 数据分析系列教程第六部分。 在这一部分种,我们讨论连接(join)和合并数据,作为组合数据另一种方法。...九、重采样 欢迎阅读另一个 Python 和 Pandas 数据分析教程。在本教程中,我们讨论通过消除噪音来平滑数据。有两种主要方法来实现。...这对于平滑我们数据,以及在它上面收集一些基本统计量是有用。 十一、滚动统计量 欢迎阅读另一个 Python 和 Pandas 数据分析系列教程,这里面我们成为了房地产大亨。

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OpenAI科学家一文详解自监督学习

这是一个简单解决方案,与图像内容无关。 ? ? 另一个想法是“功能”或“视觉图元”视为一个标量值属性,可以对多个补丁进行汇总,并在不同补丁之间进行比较。...生成对抗网络(GAN)能够学习从简单潜在变量映射到任意复杂数据分布。...追踪 物体运动情况可以通过系列视频进行跟踪。在临近中捕获同一物体特征方式之间差异并不大,这些差异通常是由物体或摄像机微小运动触发。...选择第一个补丁x和最后一个补丁x+并将其用作训练数据点。 如果直接训练模型,在对两个特征向量之间差异实现最小化,那么该模型可能只会学会将所有内容映射到相同值。 ? 其损失函数为: ?...与基于图像着色不同,此处任务是通过利用视频之间颜色自然时间一致性,颜色从正常参考复制到另一个灰度目标(因此,这两个不应相距太远)。

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OpenAI科学家一文详解自监督学习

这是一个简单解决方案,与图像内容无关。 另一个想法是“功能”或“视觉图元”视为一个标量值属性,可以对多个补丁进行汇总,并在不同补丁之间进行比较。...生成对抗网络(GAN)能够学习从简单潜在变量映射到任意复杂数据分布。...追踪 物体运动情况可以通过系列视频进行跟踪。在临近中捕获同一物体特征方式之间差异并不大,这些差异通常是由物体或摄像机微小运动触发。...选择第一个补丁x和最后一个补丁x+并将其用作训练数据点。 如果直接训练模型,在对两个特征向量之间差异实现最小化,那么该模型可能只会学会将所有内容映射到相同值。...与基于图像着色不同,此处任务是通过利用视频之间颜色自然时间一致性,颜色从正常参考复制到另一个灰度目标(因此,这两个不应相距太远)。

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一文详解自监督学习

这是一个简单解决方案,与图像内容无关。 另一个想法是“功能”或“视觉图元”视为一个标量值属性,可以对多个补丁进行汇总,并在不同补丁之间进行比较。...生成对抗网络(GAN)能够学习从简单潜在变量映射到任意复杂数据分布。...追踪 物体运动情况可以通过系列视频进行跟踪。在临近中捕获同一物体特征方式之间差异并不大,这些差异通常是由物体或摄像机微小运动触发。...选择第一个补丁x和最后一个补丁x+并将其用作训练数据点。 如果直接训练模型,在对两个特征向量之间差异实现最小化,那么该模型可能只会学会将所有内容映射到相同值。...与基于图像着色不同,此处任务是通过利用视频之间颜色自然时间一致性,颜色从正常参考复制到另一个灰度目标(因此,这两个不应相距太远)。

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【ML】OpenAI科学家一文详解自监督学习

这是一个简单解决方案,与图像内容无关。 另一个想法是“功能”或“视觉图元”视为一个标量值属性,可以对多个补丁进行汇总,并在不同补丁之间进行比较。...生成对抗网络(GAN)能够学习从简单潜在变量映射到任意复杂数据分布。...追踪 物体运动情况可以通过系列视频进行跟踪。在临近中捕获同一物体特征方式之间差异并不大,这些差异通常是由物体或摄像机微小运动触发。...选择第一个补丁x和最后一个补丁x+并将其用作训练数据点。 如果直接训练模型,在对两个特征向量之间差异实现最小化,那么该模型可能只会学会将所有内容映射到相同值。...与基于图像着色不同,此处任务是通过利用视频之间颜色自然时间一致性,颜色从正常参考复制到另一个灰度目标(因此,这两个不应相距太远)。

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数据分析】数据缺失影响模型效果?是时候需要missingno工具包来帮你了!

df.replace('', np.NaN) missingno 库 Missingno 是一个优秀且简单易用 Python 库,它提供了一系列可视化,以了解数据中缺失数据存在和分布。...pandas导入为 pd import pandas as pd import missingno as msno df = pd.read_csv('xeek_train_subset.csv')...这将返回一个表,其中包含有关数据汇总统计信息,例如平均值、最大值和最小值。在表顶部是一个名为counts行。在下面的示例中,我们可以看到数据每个特性都有不同计数。...右上角表示数据最大行数。 在绘图顶部,有一系列数字表示该列中非空值总数。 在这个例子中,我们可以看到许多列(DTS、DCAL和RSHA)有大量缺失值。...这可以通过使用missingno库和一系列可视化来实现,以了解有多少缺失数据存在、发生在哪里,以及不同数据列之间缺失值发生是如何关联

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Polars:一个正在崛起数据框架

它们在收集和清理来自限定文本文件、电子表格和数据库查询数据方面提供了灵活性。最常用数据框架是Pandas,这是一个python包,对于有限数据来说,它表现足够好。...df.description().to_pandas() ◆ 访问表元素 Polars可以通过pandas.DataFrame.iloc函数类似的行索引直接访问表行,如下所示。...plt.show() ◆ Eager和LazyAPI PolarsEager和Lazy APIs Polars(引申为Pandas)默认采用了Eager运行,这意味着函数会实时映射到每个数据。...它实现与Pandas类似,支持映射和应用函数到数据框架中系列。绘图很容易生成,并与一些最常见可视化工具集成。此外,它允许在没有弹性分布式数据集(RDDs)情况下进行Lazy评估。...总的来说,Polars可以为数据科学家和爱好者提供更好工具,数据导入到数据框架中。有很多Pandas可以做功能目前在Polars上是不存在。在这种情况下,强烈建议数据框架投向Pandas

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智能手机终场战事:小步快跑进入“智慧时代”

比如OPPO Find X5系列发布会上,自研影像专用NPU芯片占了很大篇幅,成为计算摄影另一个忠实拥趸;继全球发布后今日在国内亮相荣耀Magic4系列直接定位于全能智慧旗舰,影像、性能、隐私等方面都有...正如Mobile在报道荣耀Magic4时引述一组数据:“荣耀Magic4系列CPU性能提高了20%,GPU性能提高了30%,人工智能功能提高了300%。”...回头来看,荣耀Magic提出理念不可谓不前沿,试图通过数据、人工智能等技术重构人机关系,智能手机不单单是通信、娱乐和生产力工具,还将是普通用户“贾维斯”,用户想要看电影时候主动推荐热大片,用户需要出行时候主动打车...另一个是AI场景落地。...另一个佐证是在影像能力上尝到甜头荣耀,不仅在荣耀Magic4系列上升级了多主摄融合计算摄影技术,摘得DXOMARK影像评分最高分,还进一步“智慧”能力向其他场景加速渗透。

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Pandas与GUI界面的超强结合,爆赞!

,有位粉丝提到了一个牛逼库,它巧妙Pandas与GUI界面结合起来,使得我们可以借助GUI界面来分析DATaFrame数据框。 基于此,我觉得有必要写一篇文章,再为大家做一个学习分享。...image.png pandasgui安装与简单使用 根据作者介绍,pandasgui是用于分析 Pandas DataFramesGUI。这个属于第三方库,使用之前需要安装。...image.png pandasgui6大特征 pandasgui一共有如下6大特征: Ⅰ 查看数据系列(支持多索引); Ⅱ 统计汇总; Ⅲ 过滤; Ⅳ 交互式绘图; Ⅴ 重塑功能; Ⅵ 支持csv...查看数据系列 运行下方代码,我们可以清晰看到数据shape,行列索引名。...支持csv文件导入、导出 支持数据导入、导出,让我们更加便捷操作数据集。同时这里还有一些其他菜单,等着大家仔细研究。 image.png 关于pandasgui介绍,就到这里,你学会了吗?

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