相关内容
使用muscle进行多序列比对
默认输出的比对结果也为fasta格式，也支持phylip, msf, clustalw等其他格式。 除了多序列比对外，muscle还可以构建进化树，支持以下两种建树方式njupgma ...linux下安装的代码如下wget https:www.drive5.commuscledownloads3.8. 31muscle3. 8.31_i86linux64.tar.gztar xzvf muscle3.8. 31_i86linux64.tar.gzmv ...
对新冠病毒核酸序列构建系统进化树
今天在群里看到一个提问，很有趣，好像是有一个网页工具可以把fastq格式转为phylip格式。 我虽然没有使用过这个软件，但是我觉得这个提问，可能是忽略了计算过程，直接说结果。 应该是问题本身就错误的。? 我们四年前就系统性整理过生信基础知识名词本，其中就有数据格式专题，目录如下：1.fastq和fasta格式2.sam格式...
SDL2库(3)-Android 端源码简要分析（VideoSubSystem）参考
这里上一遍文章说过，第一个参数是app_process * use the name app_process sophysfs_platformcalcbasedir() works. https:bitbucket.orgmartinfelislove...device->getclipboardtext = android_getclipboardtext; device->hasclipboardtext = android_hasclipboardtext; return device; 其实可以看到这里如果...
使用Clustal进行多序列比对
通过phylogenetic tree可以查看进化树的结果，默认采用nj法建树，示意如下? 也可以通过send to simple phylogeny, 创建进化树，支持nj和upgma两种建树方式...该软件支持多种格式的输出fastaclustalmsfphylipselexstockholmvienna默认输出格式为fasta, 可以通过--outfmt参数指定输出文件的格式。 多序列比对不同于...
基于FPGA的多通道高速信号采集处理平台设计
在网络接口的光模块选择上，sfp+相比于 xfp 体积小，适配 ieee802.3ae协议并遵循sff-8431 协议，其 phy 和 mac 层转换由fpga处理器实现。 因此本系统选择...可以由示波器读出该信号眼高为1.1366v，眼宽为578ps，眼交叉比为50.37%，差分时钟设计指标通过了lecroy 示波器的qualiphy对1600mbps ddr3的标准测试...
纳尼？Genbank中超200万条序列受污染！蛋白污染主要来源于一只蜘蛛？
“我们检测到2012年细菌和古细菌的污染情况还只有2%-3%，” ncbi总监lipman说，“但之后就急速攀升，这一比率在2014年已经接近10%。 到2015年就达到了23%...phylum and species. numbers show above each taxonomic node indicate the totalnumber of contaminated sequences. the tree uses the same color code...
