我编写了一个脚本,使用循环创建了一个多对齐fasta,并将其存储在一个文件中。
concatenation = open ('example.fasta', 'w')
for key, value in concat.items():
output = '>' + key + '\n' + value + '\n'
concatenation.write(output)
我想使用AlignIO的功能将我的fasta转换成phylip (并打开一个新文件),但是我无法找到解析我的‘example
我正在使用python,我有这样的数据:
RedHat Enterprise Linux ES 2.1 IA64
RedHat Enterprise Linux ES 2.1
Red Hat Enterprise Linux AS 2.1
Linux kernel 2.6.9
Linux kernel 2.6.8 rc3
Linux kernel 2.6.8 rc1
+ Ubuntu Ubuntu Linux 4.1 ppc
+ Ubuntu Ubuntu Linux 4.1 ia64
Linux kernel 2.6.8
我想把这个信息存储在一个json file.but
嗨,我一直在努力寻找解决这个问题的方法,但我找不到。我需要安装模块'IO::EventMux',所以我使用:
cpan[1]> install IO::EventMux
然而,我得到了以下错误:
Catching error: "CPAN::Exception::yaml_process_error=HASH(0xe34ed78)" at /usr/local/share/perl/5.14.2/CPAN.pm line 392
CPAN::shell() called at /usr/local/share/perl/5.14.2/App/Cpa
我有点卡住了,还是个初学者。在升级过程中,我的dev/sda1 1似乎达到了容量。
sudo apt-get autoremove
给我:
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
You might want to run 'apt-get -f install' to correct these.
The following packages have unmet dependencies:
linux-image-extra-4.4.