我有3个不同的群体(人员类型1,2和3),它们正在沿着3个变量(度,weighted.degree,偏心)进行评估,我希望在一组箱图中查看这些变量。对于给定变量的每个人员类型,这些框图应该并排放置,并按变量使用3个垂直堆叠的图形:类似于3 x 3的箱图矩阵。我当前的代码是为变量生成所需的垂直堆叠,但在每个垂直堆叠的图中,我有一个
我与OTUs的数据代表真菌分类,我已发现,通过元胞编码的蛾ITS2引物。我有一个phyloseq对象,它有一个otu_table、tax_table和sam_data。在我的sam_data中,我已经将单个样本按一个类别合并,称为物种。这意味着,不再有一些样本属于同一物种的样本,我现在有一个phyloseq对象,它的样本要少得多,因为曾经共享物种的人现在被聚在一起。合并代码:
physeq <- phyloseq(OTU, TA