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单细胞去除批次效应软件比较

细胞类型相同的不同样本 在人肾脏数据集中,所有样本之间所有的细胞类型都相同,包括Proximal tubule cells、Proximal convoluted tubule cells、Proximal...从细胞类型分群和注释结果中可以看出,未去除批次效应时,Proximal tubule cells、Proximal convoluted tubule cells、Proximal straight tubule...以及Glomerular parietal epithelial cells具有明显的批次效应,尤其是Proximal tubule cells、Proximal convoluted tubule cells...除了Harmony方法,其余三种方法在去除批次效应之后,Proximal tubule cells、Proximal convoluted tubule cells和Glomerular parietal...未处理时无法从1号样本中检测到Proximal tubule cells,而在其余处理方式中,均可从1号样本中识别出该类型细胞,甚至在Harmony处理结果中,该类型细胞的占比明显高于其他所有处理方式,

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AAAI 2018 | 腾讯AI Lab现场陈述论文:训练L1稀疏模型的象限性消极下降算法

在 RCV1 等典型稀疏数据集上,我们测试了不同参数下 L1/L2 范数约束 Logistic 回归下该算法性能,其结果显著超越了已有的线性收敛算法 Proximal-SVRG,并且在卷积神经网络 (CNN...) 的实验上超越 Proximal-SGD 等算法,证明了该算法在凸函数和非凸函数上均有很好的表现。...由于该 L1 范数是不可导的(在零点),目前最通用的优化方法是近端方法 (proximal method),通过迭代式地采取梯度下降步骤,然后在当前点上优化一个 proximal 问题。 ?...我们的方法 OPDA 用红线标识,作为基准的 Proximal-Gradient Descent 算法用蓝线标识。在迭代了同样多次数之后,我们看到 OPDA 用更快的速度收敛到了等高线中更低的区域。

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