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回答
在使用Biopython时: NameError:名称'
pubmed
_id‘没有定义,尽管之前已经定义了它?
、
、
、
、
= record1.get("IdList") print("Plant: {} Disease: {} PubmedID: DOI:".format(plant, disease)) handle2 = Entrez.esummary(db="pmc", id
浏览 26
提问于2020-02-28
得票数 0
1
回答
Power中表中值的出现
、
、
我得到了
PubMed
的文章,我使用Power来可视化每个作者写了多少篇文章,每一篇文章都是由许多作者写的,如图中所示--这是我在power bi中的表结构。
浏览 2
提问于2021-06-17
得票数 0
1
回答
rails在循环中更改布尔值。
、
、
下面是我使用的方法: nih_pub = NihPublication.where(user: current_user).all
pubmed
_pub.each {|
pubmed
| if nih.pubyear ==
pubmed
.publication_year and nih.pmid ==
pubmed
浏览 3
提问于2016-05-11
得票数 0
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1
回答
URLError:<urlopen错误未知url类型:
pubmed
>
、
、
print ('*',s) 上面的代码适用于RSS feed - http://feeds.bbci.co.uk/news/rss.xml,但给出了适用于RSS feed - https://
pubmed
.ncbi.nlm.nih.govlimit=15&utm_campaign=
pubmed
-2&fc=20200625034601的错误 错误是: URLError: <urlopen error unknown url type:
pubmed</
浏览 17
提问于2020-06-25
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2
回答
使用preg_replace获取URL前的正斜杠
、
使用preg_replace获取URL前的正斜杠preg_match('/<div class="rprt">(.*)<\/div>/',$contentss,$ma
浏览 4
提问于2013-06-07
得票数 0
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1
回答
网络搜索pubmeds 2.,3.,4...页面
、
、
、
所有其他关于网络抓取和
PubMed
的帖子都是关于不同的事情。我的代码:from bs4 import BeautifulSoup 'name': "EntrezSystem2.PEntrez.
PubMed
.
Pubmed
_ResultsPanel.
Pubmed
_Pager.Page"><< First</a><a name="EntrezSystem
浏览 3
提问于2019-07-13
得票数 1
3
回答
Python,在已知字符串下面的行上搜索文本?
、
、
、
、
这个网页包含描述使用基因组数据的项目的信息,我想提取所有
PUBMED
ID (来自这个项目的出版物的唯一ID号)。每个
PUBMED
ID是一个8位数字。我尝试过两种不同的方法来提取
PUBMED
ID,但这两种方法都存在问题。我不能在这里使用这两种方法,因为这个页面上除了
PUBMED
ID之外还有多个文本段具有相同的xml标记(<id>),而且如果我不知道文本是什么,我显然无法使用文本搜索
PUBMED
ID!', text, flags = 0)这给出了这样的输
浏览 1
提问于2016-12-06
得票数 1
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2
回答
不能使用post请求继续下一页
、
、
、
GENERALRequest URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
pubmed
%222015%22%5BDate%20-%20Publication%5D%20%3A%20%223000%22%5BDate%20-%20Publication%5D;id=reldata:db=
pubmed
from urllib.parse import urljoin from bs4 import
浏览 0
提问于2018-06-29
得票数 9
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1
回答
使用Python查询
PubMed
-如何获取从查询到Pandas DataFrame的所有文章详细信息并在CSV中导出它们
、
、
、
我需要以下文章的细节:
pubmed
_id,标题,关键词,期刊,摘要,结论,方法,结果,版权,doi,publication_date,authors
浏览 1
提问于2019-07-16
得票数 3
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2
回答
是否有任何方法获取给定的公共ids列表的摘要?
、
db=
pubmed
&id=**17284678,9997**&retmode=text&rettype=xml abstract_dict={"pmid1":"abstract1
浏览 5
提问于2017-11-29
得票数 4
回答已采纳
1
回答
行尾附加逗号,导致read.csv和read.table出错
、
、
我的工作是做以下工作:colnames(pmr) <- c(colnames
浏览 0
提问于2018-06-22
得票数 4
回答已采纳
1
回答
如何在python crawler中访问多页表单的发布数据
、
、
我正在尝试用python抓取
pubmed
,并获取一篇文章被引用的所有论文的
pubmed
ID。我当前如何打开
pubmed
页面: webpage = urlopen(seed).read() citedByPage= urlopen('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmedlinkname=
pubmed
_
pubmed
_citedin&from
浏览 0
提问于2013-05-25
得票数 2
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1
回答
使用Python模块BeautifulSoup解析函数的输出
、
、
、
然后,它打开每个网页,扫描它寻找
PUBMED
ID (一个8位数字),并返回它找到的每个
PUBMED
ID,该ID由一个逗号从完成URL的代码中分离出来,这样就可以将其写入CSV文件: if
PUBMED
_TF is True: for x in soup.find_all('db', text='
PUBMED
浏览 2
提问于2016-12-08
得票数 1
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2
回答
获取特定作者的所有href
、
、
/31919170https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
pubmed
/31919170https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
pubmed
/31919170 https://www.
浏览 39
提问于2020-03-15
得票数 1
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3
回答
Pubmed
eutils搜索的排序选项?
、
、
我使用BioPython通过eutils API查询
Pubmed
数据库。esearch端点有一个排序选项,但是API文档没有列出这个值的所有选项。示例呼叫: sortsort_method工作的值 但是,我不知道如何指定默认的排序顺序,这是“最近的
浏览 4
提问于2015-11-21
得票数 4
1
回答
如何在一定条件下使用漂亮汤获取链接
、
我希望根据guid值提取链接,如下所示: <guid ispermalink="false">
pubmed
:32461484</guid>, <guid ispermal
浏览 1
提问于2020-06-29
得票数 0
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1
回答
从HDFS中读取XML文件用lxml.etree解析
、
、
、
、
我已经用lxml.etree用Python编写了一个解析器,现在我正试图在Hadoop集群上运行上述解析器。当我在本地运行该函数时,它按预期工作,但当我尝试将其应用到集群上的文件时,我会收到以下错误(我正在Pyspark,python3中执行以下操作)xml_tree = etree.parse(xml_pathname) OSError: Error reading file '/file_path/date_directory/exa
浏览 3
提问于2020-04-08
得票数 0
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3
回答
如何在不增加转义字符的情况下折叠向量?
mylinks <- structure(list(traits = c("<a href=\"https://
pubmed
.ncbi.nlm.nih.gov/1234567\" target=\"_blank\">Response to amphetamines</a>", "<a href=\"https://
pubmed
.ncbi.nlm.nih.gov/12
浏览 5
提问于2020-06-04
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1
回答
使用刮伤法提出邮件请求
、
、
、
、
= [ 'EntrezSystem2.PEntrez.
PubMed
.
Pubmed
_ResultsPanel.Entrez_Pager.Page.PEntrez.
PubMe
浏览 3
提问于2014-05-10
得票数 2
回答已采纳
3
回答
替换任何regex php
、
、
*
PUBMED
=/',"",$array_item);有了这个我做错了什么
浏览 7
提问于2014-09-02
得票数 2
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