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    预测细胞形态对干扰的响应

    今天为大家介绍的是来自Fabian J. Theis和Mohammad Lotfollahi的一篇关于细胞形态学的论文。高通量筛选技术的进步使得我们能够探索富含表型信息的方法,例如高内容显微镜技术,从而加速药物靶点鉴定和作用机制研究。然而,将这些实验扩展到庞大的药物或基因干扰空间面临挑战,因为只有少数化合物在筛选中显示活性。尽管机器学习方法在各种应用中被广泛使用,但在预测涉及未知现象的场景时,特别是将未见过的控制细胞图像转换为所需的干扰现象,机器学习方法并未表现出可靠的能力。作者提出了一种生成模型,即图像干扰自编码器(IMPA),它利用未经处理的细胞图像作为输入,预测化学和基因干扰的细胞形态学效应。

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    【哈佛大学-Cell】通过多模态深度学习的泛癌症综合组织基因组分析

    来源:专知本文为论文介绍,建议阅读5分钟我们使用多模态深度学习联合检查来自14种癌症类型的病理全图像和分子剖面数据。 快速出现的计算病理学领域已经证明有希望从组织学图像开发客观的预后模型。然而,大多数预后模型要么仅基于组织学,要么仅基于基因组学,并没有解决如何整合这些数据源来开发联合的图像组学预后模型。此外,从这些模型中确定可解释的形态和分子描述符来控制这种预后也很有意义。我们使用多模态深度学习联合检查来自14种癌症类型的病理全图像和分子剖面数据。我们的弱监督、多模态深度学习算法能够融合这些异质模式来预测

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