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从PBS作业调用python脚本
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如何从pbs作业调用python脚本运行？更多细节:我目前正在处理以下形状的pbs文件(此部分工作正常，不应更改)：#PBS -N # work name #PBS -l #PBS -m cd $PBS_O_WORKDIR我必须修改它，以便在上面的计算完
浏览 22提问于2017-08-10得票数 1
/bin/bash#PBS -l select=2:ncpus=4:mem=2Gexport PYTHONPATH=/some/path/to/python3.6/dist-packages
export PYSPARK_
浏览 3提问于2019-12-02得票数 0
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我过去使用python作为我的提交脚本，而不是bash等。在slurm中，我通常在顶部指示编译器的路径。我在qsub上试过，但没成功。知道怎么让它工作吗？代码：#PBS -V#PBS -m abe
import/spool/pbs/mom_pri
浏览 10提问于2020-09-14得票数 0
/usr/bin/env pythonsys.path.append('/usr/local/build_pbs/lib/python2.7/site-packages/pbs/')c = pbs.pbs
浏览 1提问于2014-05-01得票数 0
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python train.py arg > log.out # arg is the argument that differs for each nodempiexec train.py
浏览 6提问于2018-10-01得票数 0
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我正在尝试将python作业提交给PBS，并将打印出来的内容作为输出。一个简单的例子是：import timepbs提交文件job_test.pbs：#PBS -l nodes=2:ppn=8,walltime=8:00:00#PBS -q gpu
module load anaconda/3
浏览 0提问于2017-07-28得票数 1
我使用带有-v标志的qsub，如下所示：这将开始和计数传递给了foobar.pbs，但是foobar.pbs最终需要调用如下代码：问题是bash似乎没有正确解释python调用，并且python进程永远不会产生。任何帮助都将不胜感激#!
浏览 1提问于2014-08-14得票数 1
我正在使用MPI (mpi4py)编写mpi4py python代码，并且我希望在一个HPC集群中的队列中实现我的代码跨多个节点(每个节点有16个处理器)。codename.py#PBS -N phy#PBS -l walltime=23:00:00#<em
浏览 3提问于2017-05-25得票数 4
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我正在尝试使用指令来安装Python-for-Android。我的目标是为基于Pygame的游戏构建一个APK文件，该文件已经准备好并可以在Python中运行。我在Windows 10 Home 32位系统上运行Python 2.7.11 32位。
正如这里所看到的，我最初被告知安装pbs，因为我使用的是Windows系统。我这样做了，安装似乎成功进行了。0.110 (http://pypi.python.org/pypi/pbs) for win
浏览 0提问于2016-06-14得票数 4
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脚本无法使用高性能计算机。
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我构建了一个示例python代码(demo1.py)，它简单地创建了一个有代码执行时间的文件。我构建了这个PBS文件(simpledemo.pbs)#PBS -j oe#PBS -N SimpleDemo#PBS -e out.logmodu
浏览 12提问于2022-04-14得票数 0
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/bin/bash#PBS -l select=2:ncpus=24:mpiprocs=24#PBS -q normal#PBS -l walltime=01:30:00#PBS -M xxxxx@gmail.com
ln -s $PWD $PBS_O_WORKDIR/$PBS_JOBIDmodul
浏览 18提问于2022-06-11得票数 0
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假设我有一个python脚本，它将创建一个具有给定随机数的文本文件。我在C程序中得到了一个mpiexec模板，它看起来如下所示，但是我找不到python程序的任何模板。#PBS -N my_job#PBS -l nodes=4:ppn=12
cp $PBS_O_WORK
浏览 4提问于2016-10-14得票数 1
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我必须运行一个名为training.py的python脚本。安装了多个版本的python (2.4、2.7、3.2)。在脚本中，我必须提到要运行的python版本。
我想设计一个实验，当不同的值被传递给parameters.py时，它会连续多次调用training.py和training.py。
浏览 2提问于2013-09-29得票数 1
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我希望测试几个参数、方法和来自python的不同输入(意味着数百次函数运行)，在一个标准集群上使用PBS和Torque。集群处于我无法更改的给定配置中，这样一种集成python + qsub的解决方案肯定会让社区受益。有没有一种正确的方法来转换一些东西，比如扫描参数，比如 model(input, a)#PBS -l mem=i
浏览 1提问于2010-07-22得票数 10
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我有一个PBS作业脚本，它有一个可执行文件，可以将结果写入out文件。directory on compute node
[ -w $PBS_O_EXEDIR ] && \rsync -Cavz --rsh=$SSH $HOST:$PBS_O_EXEDIR `dirname $PBS_O_EXEDIR`
[ -d $PBS_O_WORKDIR ] || mk
浏览 2提问于2020-05-16得票数 0
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我试图在高计算集群上提交一个作业，它需要运行python代码，比如说10000次。我使用了gnu并行，但随后IT团队给我发了一封邮件，称我的工作在他们的监控系统中创建了太多ssh登录日志。下面是带有gnu并行的初始pbs脚本：#PBS -P My_project#PBS -l select=10:ncpus=16:mem=4GB
#PBS -l walltime=01:30jobs.log --wd $
浏览 4提问于2021-07-15得票数 0
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我用Python编写了一段代码，它实现了mpi4py，将数据块分散到集群的处理器上。每个处理器将给定的数据块写入一个.txt文件，然后将所有这些.txt文件合并到一个文件中。一切都如期而至。/bin/bash#PBS -N test#PBS -o job.o
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浏览 15提问于2022-02-10得票数 0
与手工编写和提交5个pbs文件不同，在一个pbs文件中处理它的常见方法是什么？对于我的特殊情况，我需要为每个示例生成.sh文件，并仔细命名它们，这样我就可以利用$PBS_VNODENUM。以下是一些有用的示例代码：
但是，我最终使用python为每个示例生成pbs文件，并在同一个python文件qsub中单独在一个循环中生成pbs文件。(是如何在使用python中提交pbs的一个示例)
浏览 7提问于2016-05-11得票数 0
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我们的集群使用PBS作业提交方法，例如使用qsub、qstat、qdel等命令来管理集群上的作业。
浏览 3提问于2020-01-28得票数 2
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