腾讯云
开发者社区
文档
建议反馈
控制台
首页
学习
活动
专区
工具
TVP
最新优惠活动
文章/答案/技术大牛
搜索
搜索
关闭
发布
登录/注册
精选内容/技术社群/优惠产品,
尽在小程序
立即前往
文章
问答
(9999+)
视频
沙龙
1
回答
错误帕伽索斯
包
: TypeError: highly_variable_features()得到了一个意外的关键字参数'consider_batch‘
python
、
rna-seq
我正在使用Pagesus软件
包
分析
我的
单细胞
RNA测序数据。我遇到了以下错误,使用飞马软件
包
进行
单细胞
分析
。highly_variable_features() got an unexpected keyword argument 'consider_batch'. after executing 我在使用python和这个
包
方面非常新手
浏览 7
提问于2022-04-17
得票数 -2
3
回答
安装Seurat -
R
单细胞
基因组工具
包
r
、
git
、
seurat
我是
R
的新手,并试图安装Seurat来
分析
我的基因组
单细胞
数据。但是,我想使用Seurat (),但是在安装软件
包
时遇到了困难。我的行动顺序如下: install.packages("devtools") library
浏览 3
提问于2015-08-03
得票数 1
1
回答
Seurat数据可视化
seurat
嗨,我正在使用公共数据pbmc来练习
单细胞
分析
,我在这一点上被这个错误信息卡住了。刚从
R
开始,遇到困难,有人能给一个指针吗?非常感谢代码: RidgePlot(pbmc3k.final,features = features,ncol = 2) FetchData.Seurat中的错误(对象=对象
浏览 3
提问于2022-08-11
得票数 0
1
回答
更改
R
中pheatmap中树状图的线宽
pheatmap
我使用存储在
单细胞
实验
分析
中的
单细胞
RNA-seq数据,使用
R
中的pheatmap对~ 11.3000个表达基因(而不是聚类样本)进行层次聚类,以显示数据的异质性。我试着用gpar设置线条宽度,但似乎没有变化
R
代码 gpar(lwd = 0.
浏览 5
提问于2018-05-22
得票数 2
1
回答
如何从GEO数据库中提取
单细胞
RNA测序数据?
r
、
bioinformatics
、
bioconductor
、
ncbi
我是
R
和计算生物学的新手。我正在尝试查看已发布的数据集,以便为我自己的项目检查基因表达。我很难找到教我如何从GEO NCBI数据库中
分析
R
上的
单细胞
RNA测序数据的材料。
浏览 12
提问于2020-04-14
得票数 0
1
回答
(
R
) Seurat:样品分组
r
、
seurat
我用Seurat软件
包
分析
了六个
单细胞
RNA-seq数据集。如何将数据1,2,3和4分组为“未处理组”,数据5和6分组为“处理组”,然后执行下游
分析
? 谢谢。
浏览 15
提问于2020-07-16
得票数 0
回答已采纳
2
回答
如何在slotname @data中从seuratobject中筛选基因?
r
、
regex
、
s4
、
seurat
我正在使用一个名为"Seurat“的
R
包
进行
单细胞
RNA-Seq
分析
,我试图从插槽名'data‘中删除seuratobject (s4类)中的几个基因。
浏览 4
提问于2018-01-10
得票数 1
回答已采纳
1
回答
R
中余弦距离函数向Rcpp的转换
r
、
matrix
、
rcpp
我一直在开发一个用于
单细胞
RNA-seq
分析
的
R
软件
包
,我使用的函数之一是通过n个基因来计算给定的m细胞矩阵的余弦不同矩阵。t(rowSums(input^2)))))} 这段代码对于较小的数据集很好,但是当我在超过20,000行上运行它时,它会花费很长时间,然后由于内存问题而使我的
R
会话崩溃如何将此函数转换为Rcpp,然后像
包
中的任何其他函数一样调用它?或者,这是解决速度/内存问题的最好方法吗?
浏览 0
提问于2020-09-05
得票数 0
1
回答
我应该使用哪种编程
语言
来集成不同的
分析
软件
包
?
dataset
、
programming
我目前正在编写一个软件
包
,以简化一个研究实验室的数据
分析
。有几个不同的
分析
软件
包
,我们使用,基于unix,matlab,和(很少使用) python。我的软件
包
的目标是允许用户在运行
分析
之前选择和选择在每个步骤中使用的现有
包
,然后程序将在没有进一步的用户干预的情况下执行它。因为目标是集成这些不同的
包
,用不同的
语言
编写,所以我决定用bash编写程序,这样无论用哪种
语言
编写,都很容易调用实际的
分析
脚本。
浏览 0
提问于2016-08-21
得票数 1
回答已采纳
1
回答
如何在指定的网格中绘制多个UMAP?
r
、
seurat
我正在使用新的Seurat 3软件
包
来
分析
单细胞
测序数据。我已经合并了18个Seurat对象,并将单独的标识符保存在meta.data中。
浏览 3
提问于2018-12-11
得票数 2
1
回答
Python port of
R
's‘
R
port’
包
python
、
r
、
linear-regression
为了进行回归
分析
,我需要计算Lindeman-Merenda Gold (LMG)分数。我发现它可以在
R
语言
的relaimpo包下找到。 不幸的是,我没有任何关于
R
的经验。这个
包
有python端口吗?如果它不存在,有没有可能通过python使用这个
包
?
浏览 1
提问于2018-12-14
得票数 1
1
回答
使用
R
复制文本文件中所需的数据
r
但是忽略文本中的
包
数据。
R
很容易通过函数和扩展进行扩展,而
R
社区以其在
包
方面的积极贡献而闻名。这些
包
主要是在
R
中开发的,有时在Java、C和Fortran中
浏览 2
提问于2014-12-04
得票数 0
1
回答
R
的Splunk查询
语言
r
、
splunk
这种快速查询
语言
也很容易用于非开发人员。我使用
R
旁边的SPLUNK开发先进的
分析
包
,以测试软件的稳健性。我想把两者混合起来。 是否有任何
R
包
或
R
软件接受和处理SPLUNK查询?如果没有,还需要有人在
R
中使用这个功能吗?
浏览 1
提问于2014-10-28
得票数 1
2
回答
OS X/ Python /
R
的CHAID
分析
选项
python
、
r
、
macos
、
machine-learning
我正在寻找一个很好的开源(或低成本)的方式来执行CHAID
分析
。我最喜欢的
语言
是python,但
R
也可以。OS是必须的。谢谢。
浏览 0
提问于2013-06-26
得票数 6
回答已采纳
2
回答
有没有办法在Python中进行并行
分析
?
python
、
statistics
我目前正在使用Python
语言
运行探索性因子
分析
,它可以很好地与factor_analyzer
包
()配合使用。为了选择合适的因子数量,我使用了Kaiser标准和Scree图。然而,我想用Horn的平行
分析
来证实我的结果(Horn,1965)。在
R
中,我将使用psych
包
中的parallel函数。有没有人知道Python中等效的方法/函数/
包
?
浏览 1
提问于2020-06-10
得票数 3
3
回答
非数值特征的相关矩阵
machine-learning
、
r
、
feature-reduction
目前,我有数据集的数值以及非数值属性.我试图使用
R
编程
语言
删除dataset中的冗余特性。注意:不能将非数字属性转换为二进制属性。Caret
R
包
提供了findCorrelation,它将
分析
可以删除的属性的数据属性报告的关联矩阵。但是,它只工作'x‘的数值。我一直无法找到用于非数字属性的
包
。卡莱特
R
包
中是否有一个函数也适用于非数字属性?如果没有,有什么方法/
包
可以帮助我实现同样的目标?
浏览 0
提问于2019-11-12
得票数 1
1
回答
用定义的细胞群绘制X轴上基因的小提琴图
r
、
bioinformatics
、
violin-plot
这与
单细胞
RNA测序数据
分析
有关. 是否有可能创造一个小提琴图,在X轴上有基因,Y轴上有归一化表达,而不是X轴上的簇或细胞类型,Y轴上有基因,而选择
分析
的细胞是用户定义的?我也查看了scCustomize
包
,没有发现任何跳出我的任何东西,但这是完全合理的,我可能错过了一些东西!
浏览 11
提问于2022-10-01
得票数 0
回答已采纳
1
回答
需要比较excel中的两列并将多个引用引入单个单元格
excel
我正在为下列要求寻找一个excel公式:Column1
包
含:
R
1,
R
2,
R
2,
R
3,
R
3,
R
4 Column2
包
含: T1,T2,T3,T4,T5,T6,T7,T8Column1
包
含:
R
1,
R
2,
R
3,
R
4现在在Column2中我期待着输出为T1,T2,T3代表<e
浏览 1
提问于2016-10-04
得票数 0
回答已采纳
1
回答
在
分析
工作流中集成以多种
语言
编码的工具的标准方法
methods
我试图将多种
语言
(
R
、python、C等)的多个
包
和工具缝合在一起。在一个单一的
分析
工作流中。 有什么标准的方法吗?最好(但不一定)在python中。
浏览 0
提问于2017-06-06
得票数 1
回答已采纳
5
回答
科学论文的“统计”引文
r
、
package
、
stat
、
citations
我使用
R
包
‘stats’
分析
了我的数据(2.15.3版)。一位评论员问我这个套餐的正确引证,而不仅仅是普通的引用。有人知道我在哪里可以找到有效的引文插入我的论文吗?谢谢
浏览 3
提问于2013-03-28
得票数 42
回答已采纳
点击加载更多
扫码
添加站长 进交流群
领取专属
10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关
资讯
R语言必学包之stringr包
R语言必学包之dplyr
R语言dplyr包浅谈(一)
R语言—Rattle包数据挖掘(6)
R语言—Rattle包数据挖掘(5)
热门
标签
更多标签
云服务器
即时通信 IM
ICP备案
对象存储
实时音视频
活动推荐
运营活动
广告
关闭
领券