我正在尝试运行一个基因集富集分析,如下图所示:http://yulab-smu.top/clusterProfiler-book/chapter7.html 我一直在尝试使用这个特定的代码: data然后,我想将它和相应的名称(ENTREZ ID)放入一个名为gene的数据框中,这样我就可以运行富集分析了。Ordering multiple columns using cut-off values in R 我是不是错过了一些语法来完成这项工作?任何帮助都将不胜感激。 谢谢
我有一个包含SAGE计数数据的矩阵,我想测试GO在路径中的富集。因此,我想在R中使用globaltest。这些样本可以分为两组用于检测途径富集: KI1组和WT2组
groups <- c("KI1","KI1","KI1","KI1","KI1","WT2","WT2","WT2","WT2","WT2