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1
回答
scipy
pdist
只有
两个
最近
的
邻居
python
、
scipy
、
pdist
我一直在使用
scipy
计算成对距离,我正在尝试计算到
最近
的
两个
邻居
的
距离。我目前
的
工作解决方案是: dists = squareform(
pdist
(xs.todense())) dists = np.sort(dists, axis=1)[:, 1:3] 然而,在我
的
例子中,squareform方法在空间上是非常昂贵
的
,并且有点多余。我只需要
最近
的
两个
距离,不是
浏览 37
提问于2020-01-29
得票数 1
回答已采纳
3
回答
使用欧几里得距离在numpy数组列表中查找numpy数组
的
最近
邻
python
、
arrays
、
algorithm
、
numpy
、
nearest-neighbor
我有一个n维向量,我想使用欧几里得距离在n维向量列表中找到它
的
k个
最近
的
邻居
。 我写了下面的代码(用k=10),虽然可以工作,但运行起来太慢了,我想知道是否有更好
的
解决方案。
浏览 24
提问于2017-08-18
得票数 3
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1
回答
用matplotlib连接散射图中k个
最近
邻
的
有效方法
python
、
matplotlib
我试图构造一个
最近
邻图,即每个数据点都连接到它
的
k个
最近
邻居
的
散点图。我目前
的
解决方案有效,但显然效率不高。到目前为止,我得到
的
是:from
scipy
.spatial.distance import
pdist
, squareformk = 4 # matrix of pairwi
浏览 2
提问于2018-04-26
得票数 2
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2
回答
枕叶稀疏距离矩阵(Scikit或
Scipy
)
python
、
numpy
、
scipy
、
scikit-learn
、
sparse-matrix
我正在试图计算
最近
的
邻居
聚类,在一个从scikit-learn
的
DictVectorizer返回
的
稀疏矩阵上。我
的
印象是科学学习可以计算出这些距离矩阵。我还尝试过
pdist
和kdtree等方法,但也收到了无法处理结果
的
其他错误。 self.n, self.m = np.shape(self.data) ValueError: n
浏览 1
提问于2014-01-13
得票数 8
1
回答
求出每个点之间
的
距离,并找出曲线接近自身
的
位置。
python
、
numpy
我正在编程一个随机生成
的
样条曲线,首先生成控制点,然后用spicy.splev进行插值。就是一个例子。我现在想要得到每个点与样条线
的
其他点
的
距离,以查看样条线是否在某一点上太接近自己,这包括自碰撞。在每个点之前和之后,应该有一个间隔,其中点被忽略,因为这些点始终是距离每个点
最近
的
点: length = len(splinePoints: return np.s
浏览 12
提问于2017-07-23
得票数 0
3
回答
基于函数值和邻近度
的
聚类点
python
、
numpy
、
scipy
、
cluster-analysis
我想找到all 在X中没有一个更好
的
点(较小
的
f值)在r距离内。X有数十万个点,所以我不能预先计算sp.spatial.distance.
pdist
(X),只能使用以下方法: pts,n = np.shape(X)centers = []
pdist
= sp.spatial.distance.cdist(X,[X[i]]) ifnot np.any(np.logical_and(
p
浏览 13
提问于2016-09-14
得票数 0
回答已采纳
1
回答
运行
scipy
.spatial.distance.
pdist
后提取距离
python
、
pandas
、
similarity
、
euclidean-distance
我想根据3列(特征)中
的
值计算观察(行)之间
的
欧几里德距离。我正在使用
scipy
.spatial.distance.
pdist
。据我所知,返回
的
对象(dist)包含我
的
20个观察(行)之间
的
190段距离。和:我如何能建立一个对称
的
20乘20矩阵与距离在其中? 我
的
最终目标是:对于每一个观察(行),我想找出它
最近
的
5个
邻居
(也就是距离它
的
最小距离
的
浏览 4
提问于2017-11-03
得票数 1
回答已采纳
2
回答
用枕骨测量地理距离
python
、
scipy
、
geographic-distance
我没有使用
scipy
的
pdist
函数
的
结果。我感兴趣
的
是真实
的
地理距离(首选单位: km)。取以下坐标:distance =
pdist
(coordinates)# [ 13.75021037] 但单位是什么?谷
浏览 4
提问于2015-07-25
得票数 6
回答已采纳
4
回答
如何计算数据集中所有点
的
多重欧几里得距离?
python
我是python
的
新手,我有一个包含数百个条目的数据集,我想找出每个点
的
第六个
最近
邻居
的
欧几里得距离并保存它们。任何帮助都是非常感谢
的
。 非常感谢大家!
浏览 5
提问于2019-07-19
得票数 1
1
回答
如何循环电势?
matlab
、
simulation
我目前正在研究聚合物在溶液中
的
分子动力学模拟,这是计算体系势能和施加在每个单体上
的
力
的
子程序之一。= FORCE(j,k) - Ff*dr(k)- GAMMA*VELOCITY(j,k); endend 我如何为POT_E下
的
"33.34 * EPS * power(sqrt(dist2) - SIG,2)/(2 * power(SIG,2))“部分创建一个循环,这样它就只计算
最近
原子之间
的
距离
浏览 0
提问于2015-10-27
得票数 0
1
回答
在pandas dataframe python上应用成对函数
python
、
distance
、
pairwise
我有一个数据帧,我想成对应用我自己
的
距离。问题是myDistance需要2个数据帧,并使用skelarn pairwise_distance或
scipy
pdist
转换为ndarray。3 2def myDistance(f1,f2):这是可行
的
,但这不是,因为
pdist
将df行视为ndarray from
scipy</e
浏览 1
提问于2018-01-24
得票数 1
1
回答
导入python库模块时出错
python
、
distance
、
scipy-spatial
我正在研究python中
的
集群。我要导入
的
包是但这显示了以下错误。(C:\Users\majid\Anaconda3\lib\site-packages\
scipy
\spatial\distance.py) ImportError:无法从“
scipy
.spatial.distance
浏览 2
提问于2020-04-03
得票数 1
1
回答
二维均匀网格上随机浮点
的
Python舍入
python
、
numpy
、
random
、
rounding
尽管numpy &
scipy
有许多四舍五入
的
函数,但我找不到一个函数,它允许我对二维均匀网格中
的
节点进行离散化随机浮动。[ 0. ], [ 3.2], [ 6.4],如果我有正态分布
的
随机浮点
的
m数,如何将它们包围到
最近
的
网格节点(假设周期边界)?
浏览 6
提问于2015-07-21
得票数 3
回答已采纳
3
回答
从numpy距离数组中提取N个
最近
的
对
python
、
arrays
、
numpy
、
distance
我有一个大
的
,对称
的
,二维距离数组。我想得到
最近
的
N对观测。import randomimport
scipy
.spatial.distance N = 100
浏览 4
提问于2013-12-12
得票数 3
回答已采纳
1
回答
Pandas:计算X,Y分组之间
的
距离和角度
python
、
pandas
好
的
,我有以下专栏:0 0 2.3 3.43 10.0 3 1 4.2 1.7dist(x0, x1, y0,y1) = sqrt((x0 - x1) ** 2 + (y0 - y1) ** 2) 类似地,计算第i个和第j个元素之间
的
夹角。那么,我如何才能在
浏览 33
提问于2019-10-22
得票数 0
回答已采纳
1
回答
更快地计算特殊相关距离矩阵
python
、
matrix
、
pandas
、
distance
、
correlation
我首先尝试了
scipy
.spatial.distance.
pdist
(df,'correlation'),它对于我
的
5000行* 20功能数据集非常快速。因为我想构建一个推荐程序,所以我只想稍微改变距离,只考虑对于
两个
用户来说NaN都不同
的
特性。实际上,
scipy
.spatial.distance.
pdist
(df,'correlation')在满足任何值为NaN (‘nan’)
的
特性时输出nan。([row_i
浏览 1
提问于2014-08-01
得票数 2
回答已采纳
1
回答
复数数组上
的
scipy
cdist或
pdist
python
、
numpy
、
scipy
用
scipy
.spatial.distance.euclidean计算
两个
复数之间
的
欧氏距离:import
scipy
.spatial.distance给予:但是,成对距离矩阵或
两个
输入数组
的
每对之间
的
距离不起作用: A = numpy.random.uniform(size=(5,1)) +numpy.random.uniform(size=(5
浏览 4
提问于2014-02-21
得票数 3
回答已采纳
1
回答
对于某些特定
的
索引,
scipy
的
pdist
函数有特定
的
用法吗?
python
、
scipy
、
pdist
我
的
问题是关于
scipy
.spatial.distance
的
pdist
功能
的
使用。虽然我必须计算1x64矢量与存储在2D数组中
的
数百万个1x64矢量中
的
每个矢量之间
的
汉明距离,但我不能使用
pdist
来计算。因为它返回同一个2D数组中任意
两个
向量之间
的
汉明距离。我想知道是否有任何方法可以让它计算特定索引
的
向量和所有其他向量之间
的
汉明距离。 这是我目前
的</e
浏览 6
提问于2016-08-17
得票数 0
回答已采纳
2
回答
从形状向量(n,2)到两点之间
的
距离
python
、
numpy
X中
两个
向量Xi和Xj之间
的
距离是|Xj - Xi|。得到X中所有组合
的
距离,就像在图像中那样。问题研究我想我可以研究一下枕叶代码,因为似乎得到了与向量
的
距离。
scipy
.spatial.distance.<e
浏览 4
提问于2020-12-22
得票数 0
回答已采纳
1
回答
计算点之间
的
欧几里得距离时出现内存错误
python
、
numpy
、
cluster-analysis
、
dbscan
我想找到DBSCAN
的
eps。我有一组点,需要计算每个点到其他点
的
距离。其中形状数组是(2267436,2),然后找到
最近
和最小
的
点。以下是我
的
数据: [ 176147.50406716 2502422.34894945] [ 231214.870296 2684054.8263628 ]]
浏览 0
提问于2017-12-31
得票数 0
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