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ACL-BioNLP 2020 | 耶鲁大学实践成果:生物医药知识图谱嵌入模型基准测试

例如,SNOMED Clinical Terms(SNOMED-CT),世界上使用最广泛的医疗保健文献和报告的临床术语,包含数十万个医学术语及其关系并拥有多层次组织结构。...表1 最终SNOMED数据集的统计信息 2.2实现 考虑到SNOMED-CT的巨大规模以及可扩展性和一致的实施对于运行实验的重要性,作者将GraphVite用于KGE模型。...图1显示了RotatE,ComplEx,Snomed2Vec和Cui2Vec的概念嵌入,其颜色对应于广泛的语义组。...鉴于SNOMED-CT比两个数据集更大,并且可以说是一个更复杂的知识图谱,因此链接预测结果表明KGE模型学习了SNOMED-CT的合理表示。...表2显示了SNOMED-CT上5个KGE模型的链接预测任务的结果,其中表的上部针对SNOMED-CT上的5个KGE模型,下部针对两个标准KGE数据集上的TransE和RotatE。

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