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沙龙
1
回答
在数据帧中查找条形码,并计算这种情况发生的次数,循环速度是否很慢?
r
、
dataframe
-A0RS-01A-11D-A099-09A1CF,SYNCRIP,
TCGA
-B6-A0RS-01A-11D-A099-09A2M,SHBG,
TCGA
-D8-A1JK-01A-11D-A13L-09
TCGA
-AO-A03O-01A-11W-A019-09
TCGA</e
浏览 1
提问于2013-01-16
得票数 3
回答已采纳
3
回答
需要将向量中的每个术语的结尾与某个术语R进行匹配
r
我尝试过
使用
grepl、grep和subsetting,但它们给出了不正确的值。samples)下面是samples向量的一小部分: [5]
TCGA
.DD.A1EG.11A
浏览 31
提问于2017-07-22
得票数 0
1
回答
使用
awk计算包含多列的fIle的中位数
awk
print (count[(NR / 2)] + count[(NR / 2) + 1]) / 2;}}'
TCGA
-G4-6298-11A 0.309164840970903 0.108696904309357
TCGA
-AA-3506-11A 0.293174399370542 0.1254642565
浏览 1
提问于2019-12-11
得票数 0
2
回答
为什么for循环
使用
一个数据集,而替换错误的长度为零,与非常相似的数据集r。
r
、
for-loop
当我
使用
列表n_cl时,就会发生这种情况。但是,当我
使用
list,cl,它的结构实际上是一样的,代码工作得很好。这里少了什么?" "
TCGA
_DD_A1EH" "
TCGA
_FV_A23B" [1] "
TCGA
_DD_A1EH" "
TCGA
_DD_A3A8" "
TCGA
_ES_A2HT" "
TCGA
_DD_A1EG&qu
浏览 1
提问于2017-08-30
得票数 0
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1
回答
用ggplot绘制热图中的切片
r
、
ggplot2
、
heatmap
、
melt
"
TCGA
.02.0026.01", "
TCGA
", "
TCGA
.02.0104.01", "
TCGA
.02.0114.01", &quo
浏览 9
提问于2022-06-19
得票数 0
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4
回答
如何
使用
regex修改熊猫索引,然后将其与另一个数据的索引进行比较?
regex
、
pandas
-06-0125-01A-01D-A45W-05', '
TCGA
-06-0125-02A-11D-2004-05', '
TCGA
-06-0171-01A-02D-A45W-05', '
TCGA
-06-0171-02A-11D-2004-05',
浏览 15
提问于2022-06-01
得票数 1
1
回答
R: For循环中的For循环,每一轮重建和导出输出
r
、
csv
、
for-loop
、
nested-loops
gex[1,] 987 0.797900410.8575385 listx <- c("
TCGA
-DM-A28E-01","
TCGA</em
浏览 7
提问于2015-01-25
得票数 0
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4
回答
如何在第n个分隔符上拆分字符串?
bash
、
shell
、
scripting
输入:
TCGA
-J4-8200-10A-11D-A323-01我想把第四冲刺的每一行平分"-“
TCGA
-HC-8216-10A
TCGA
-EJ-A65E-10A#!/usr/bin/env bash IN="
TCGA</em
浏览 5
提问于2015-07-10
得票数 4
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1
回答
在R数据帧中合并相同的头列
r
、
dataframe
TCGA
_2 MUT;
TCGA
_4 MUT; AMP;
TCGA
_6
TCGA
TCGA
_1 MSE;
浏览 7
提问于2022-08-07
得票数 0
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2
回答
如何在R中
使用
regex?
r
}$", "\\1", ori.maf.barcode$Tumor_Sample_Barcode) [1] "
TCGA
-2K-A9WE-01A-11D-A382-10" "
TCGA
-2Z-A9J1-01A-11D-A382-10" [3] "
TCGA
-2Z-A9J2-01A-11D-A382-10" "
TCGA
-2Z-A9J3-0
浏览 2
提问于2022-10-31
得票数 0
1
回答
read_table将所有数据读入一列
string
、
pandas
、
dataframe
我有这样的文件:
TCGA
2 1 QWE
TCGA
3 2 KLS但结果显示:Out[17]: 0
TCGA
10 QWE2
TCGA
2 -2 RAF 3
TCGA
浏览 5
提问于2016-05-12
得票数 3
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3
回答
如何基于子字符串匹配对字符向量进行子集?
r
"
TCGA
-2Z-A9J1-01A-11D-A382-10", "
TCGA
-2Z-A9J2-01A-11D-A382-10", "
TCGA
-2Z-A9JQ-01A
浏览 3
提问于2022-10-22
得票数 2
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1
回答
如何根据所有列删除重复行?
pandas
、
dataframe
我希望删除所有重复的行,这些行要么具有相同的Hugo_Symbol列值,要么在其余的所有列(即以“
TCGA
-”开头的列)之间具有相同的值。Hugo_Symbol is the same数据帧的一个片段:common_dict 3: 0.2216, 5: -2.48, 7: -1.4578, 9: 3.4868},
浏览 5
提问于2022-04-12
得票数 2
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1
回答
如何修正“storage.mode(y)中的错误”<- "double“:无效的改变一个因子的存储模式”在lasso中?
r
、
glmnet
、
lasso-regression
在
使用
脊线和套索回归时,我得到了以下错误。
TCGA
.G2.A2EF.01 <dbl>,
TCGA
.BT.A42C.01 <dbl>,
TCGA
.FD.A62O.01 <dbl>, #
TCGA
.BL.A13J.01 <dbl>,
TCGA
.E5
TCGA
.H4.A2HQ.01 <dbl>,
TCGA
.DK.AA74.01 <dbl>,
TCGA
.XF.AAMR.
浏览 1
提问于2019-04-08
得票数 1
1
回答
如何将dataframe索引替换为来自另一个dataframe的列值?
pandas
-02-0003", 2003, "WITH TUMOR", 100, 50], ["
TCGA
-02-0004", 2002, "WITH TUMOR", 80, 59], ["
TCGA
-02-0006-02-0003-01", "123ebb05-33c0-441c-9549-262433b14810", "
TCGA
-02-0003"], ["
TCGA
-02-0006-01"
浏览 2
提问于2022-05-05
得票数 0
1
回答
如何
使用
正则表达式分配分类变量?
python
、
pandas
、
regex
、
numpy
, '
TCGA
-2Z-A9J3-01A': 0.553849599144766, '
TCGA
-2Z-A9JE-01A': 0.0734337852294042, '
TCGA
-
浏览 7
提问于2022-07-22
得票数 0
1
回答
带t检验和打印p值的分组盒图
r
、
ggplot2
、
boxplot
、
p-value
、
t-test
", "
TCGA
.02.0084.01", "
TCGA
.02.0087.01", "
TCGA
.02.0104.01", "
TCGA
.02.0114.01", "
TCGA
.02.0281.01", "
TCGA
", "
TCGA
.08.0359.01", "
TCGA
.08.0385.01"
浏览 6
提问于2022-06-22
得票数 1
回答已采纳
2
回答
如何
使用
熊猫对标题的某一部分进行分组?
python
、
pandas
e.g
TCGA
.02.0047.GBM.C4,
TCGA
.02.0055.GBM.C4,
TCGA
.ZS.A9CG.LIHC.C3,
TCGA
.ZU.A8S4.CHOL.C1,
TCGA
.ZX.AA5X.CESC.C2
浏览 10
提问于2022-11-02
得票数 0
2
回答
熊猫数据按多列分组并删除重复行
python
、
pandas
、
bioinformatics
我试图
使用
以下形式的数据完成一项任务(生物信息学,
TCGA
数据): df = pd.DataFrame({'ID':['
TCGA
-AB-0001','
TCGA
-AB-0001','
TCGA
-AB-0001','
TCGA
-AB-0001','
TCGA
-AB-0002','
TCGA
-AB-0002','<em
浏览 2
提问于2016-06-01
得票数 2
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2
回答
尝试将数据框中的值替换为其他值
r
例如,当L1的ABCC10表示"
TCGA
_DD_A1EG“时,我希望将其替换为第1行(ABCC10)第3列(
TCGA
.DD.A1EG)中的值2.193205。我想对每个值都这样做。L1看起来像这样:[1] "
TCGA
_DD_A1EG" "
TCGA
_FV_A3R2" "
TCGA
_FV_A3I0" "
TCGA
_DD_A1EH" "
TCGA
_FV_A23B&q
浏览 8
提问于2017-08-30
得票数 1
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