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vasp-vtst过渡态计算过程

前言 课题组主要采用第一性原理和分子动力学两种工具研究材料的基本性质,为设计具有特定功能的器件提供前期基础。...——课题组概况 vasp-vtst计算过渡态 1935年,Eyring,Evans和Polanyi在统计热力学和量子力学的基础上提出了过渡态理论,可以通过基本物性(分子震动频率、质量、核间距等)计算反应速率常数...NEB方法:撒点,弹簧力 CL-NEB方法:其中一个点跑到势能面鞍点,即过渡态 vasp-vtst提供的NEB优化算法(IOPT参数) VASP计算过程 过渡态计算的收敛准则只与力相关,即设置EDIFFG...#通知VASP使用vtst计算; ICAHIN=0 #通知VASP使用vtst计算; IMAGES=7 #之前添加的图像数量N image number; IBRION =3...#specify that VASP does molecular dynamics; POTIM=0 #zero time step so that VASP does

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使用PyVibMS可视化分子和固体中的振动模式

综合上面的多种原因,笔者构思开发了一款基于PyMOL程序的可以跨平台使用、适配多种量子化学、第一性原理计算程序的辅助插件PyVibMS。...4.2 VASP计算单晶硅的振动分析 在对VASP计算的振动分析进行可视化之前,我们需要振动计算后得到的OUTCAR和CONTCAR文件 (见PyVibMS-master/examples/VASP/original-data...接着,回到PyVibMS界面后,将文件类型XYZ调成VASP 5.x。因为这个VASP输出文件既包含了PBC盒子的信息,又包含了振动模式的信息,我们勾选 Has PBC 和 Has Vib....4.4 其他量子化学、第一性原理计算程序的振动分析 对于PyVibMS没有原生支持的量子化学、第一性原理的计算程序,PyVibMS目前仍然可以支持。...mode文件可以通过自写脚本的方式从量子化学、第一性原理计算程序的振动分析结果里面提取相应的信息 来制作。下面以这个二氧化碳分子为例,介绍其文件格式。 #之后的文字为注释,在实际情况下不存在。

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Python量子力学计算模拟以及数据可视化

VASPy是一个纯Python编写的处理VASP文件数据以及进行数据快速可视化的库,基于OOP的思想提供了操作VASP文件的友好的接口,可以帮助使用者快速编写处理VASP相关文件的脚本,以提升效率。...VASP简介 对于广大做计算化学或者材料模拟的同学肯定听说过VASP的大名或者其科学研究与其息息相关。...(http://www.vasp.at/) VASPy项目简介 VASPy的思想是将VASP相关的文件都视为可操作的对象,通过友好的接口对一个或者多个VASP对象进行快速的操作以提升工作效率。...类可以抽取文件中的晶格结构信息并结合VASP相关的类进行VASP文件的创建,同样可以方便的讲VASP的文件生成相应的用Material Studio可以显示的文件包括讲XDATCAR生成相应的*.arc...由MaterialStudio的xsd文件生成VASP输入文件的脚本 由VASP的输出文件生成相应的MaterialStudio可以显示的xsd文件的脚本 由MaterialStudio的轨迹文件生成VASP

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哪些领域将成为下半年的监管关注重点?

该报告的发布标志着 FATF 于 2019 年首次发布的《加密资产和加密资产服务提供商(VASP)指南》已经经历了三个年头。...所以为了应对 DeFi 日益增加的风险,VASP 和金融机构应确保他们使用区块链分析功能来检测与 DeFi 混币器和跨链桥相关的风险。...作为核心,旅行规则要求 VASP 识别超过一定金额的交易的发起人和受益人,并将信息和数据安全的传输给其 VASP 交易对手。该规则的目的是帮助执法部门发现、调查加密资产领域的洗钱和其他金融犯罪。...FATF 的《最新报告》对未实施“旅行规则”的成员国和 VASP 提出了严厉警告——各国应根据 FATF 标准对 VASP 施加信息和数据共享要求。...跨链 DeFi、非托管钱包、NFT 和旅行规则合规性将是 VASP 合规团队的首要问题。

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springaop的原理_javaaop原理

目录 Spring核心知识 SpringAOP原理 AOP编程技术 什么是AOP编程 AOP底层实现原理 AOP编程使用 ---- Spring核心知识 Spring是一个开源框架,Spring是于...SpringAOP原理 AOP编程技术 什么是AOP编程 AOP: Aspect Oriented Programming 面向切面编程。   ...AOP底层实现原理 代理设计模式 什么是代理模式 通过代理控制对象的访问,可以详细访问某个对象的方法,在这个方法调用处理,或调用后处理。既(AOP微实现) ,AOP核心技术面向切面编程。...代理模式应用场景 SpringAOP、事物原理、日志打印、权限控制、远程调用、安全代理 可以隐蔽真实角色 代理的分类 静态代理(静态定义代理类) 动态代理(动态生成代理类) Jdk自带动态代理 Cglib...不需要实现接口 2.代理对象的生成,是利用JDK的API,动态的在内存中构建代理对象(需要我们指定创建代理对象/目标对象实现的接口的类型) 3.动态代理也叫做:JDK代理,接口代理 JDK动态代理 1)原理

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GDB原理之ptrace实现原理

本文不是介绍 GDB 的使用方式,而是大概介绍 GDB 的实现原理,当然 GDB 是一个庞大而复杂的项目,不可能只通过一篇文章就能解释清楚,所以本文主要是介绍 GDB 使用的核心的技术 - ptrace...,所以这里为了填补这个空缺,下面就详细介绍一下 ptrace 的原理与实现。...ptrace实现原理 本文使用的 Linux 2.4.16 版本的内核 看懂本文需要的基础:进程调度,内存管理和信号处理相关知识。...PTRACE_TRACEME、PTRACE_SINGLESTEP、PTRACE_PEEKTEXT、PTRACE_PEEKDATA 和 PTRACE_CONT 等,而其他的操作,有兴趣的朋友可以自己去分析其实现原理...access_process_vm() 函数的实现主要涉及到 内存管理 相关的知识,可以参考我以前对内存管理分析的文章,这里主要大概说明一下 access_process_vm() 的原理

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