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Cytoscape插件7:MCODE

MCODE,Molecular COmplex Detection 发现PPI网络中紧密联系的regeions,这些区域可能代表分子复合体。 根据给定的参数,分离dense regions,这相对其他cluster方法有其优点,因为其他的方法很少考虑网络的其余部分。总之MCODE可以发现PPI网络中相互作用的Dense region。这主要基于connection data,其中很多已经被证实是complex。这个函数不会被因高通量技术带来高假阳性影响。分子复合体预测很重要,因为这可以提供功能注释的另一个水平。因为sub-units of a molecular complex通常情况下,功能代表同一个生物目标分子,对一个未知pro的预测(作为复合体一部分),对这个pro的注释也增加了可信度。 MCODE也可以对感兴趣的dense区域进行提取并可视化,这点很重要,因为现有的工具比如spring不能对大的网络进行操作(spring不能大于2000个nodes)。

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Focal Loss升级 | E-Focal Loss让Focal Loss动态化,类别极端不平衡也可以轻松解决

长尾目标检测是一项具有挑战性的任务,近年来越来越受到关注。在长尾场景中,数据通常带有一个Zipfian分布(例如LVIS),其中有几个头类包含大量的实例,并主导了训练过程。相比之下,大量的尾类缺乏实例,因此表现不佳。长尾目标检测的常用解决方案是数据重采样、解耦训练和损失重加权。尽管在缓解长尾不平衡问题方面取得了成功,但几乎所有的长尾物体检测器都是基于R-CNN推广的两阶段方法开发的。在实践中,一阶段检测器比两阶段检测器更适合于现实场景,因为它们计算效率高且易于部署。然而,在这方面还没有相关的工作。

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Meta-learning原来有这么多用途!一文汇总元学习在5个问题中的应用

在Meta-learning核心思想及近年顶会3个优化方向一文中,我们从meta-learning的基础思想出发,并介绍了MAML经典模型,以及在此基础上最近3年学术界对meta-learning算法本身的不同角度优化。Meta-learning可以理解为是一个工具,它可以应用于很多不同的场景中,利用meta-learning两层优化目标的思路解决特定场景下的问题。本文梳理了业内近几年利用meta-learning解决不同场景问题的顶会论文,涉及meta-learning在域自适应、迁移学习、图学习、正负样本不均衡、知识蒸馏等多个场景的应用,帮助大家更深入的理解meta-learning的本质思想,以及如何在不同问题中应用meta-learning这个工具。

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