[Bioinformatics]好文简读：基于自编码的药物-靶点相互作用预测

论文题目：

Autoencoder-based drug–target interaction prediction by preserving the consistency of chemical properties and functions of drugs 论文摘要：

本文提出了一种基于自编码器的方法，AEFS，在空间一致性约束下预测DTI。作者建立了一个异构网络来整合药物、蛋白质和疾病的信息。原始药物特征通过多层编码器投影到嵌入（蛋白质）空间，并通过解码器进一步投影到标签（疾病）空间。在这一过程中，引入药物的临床信息来辅助DTI预测。AEFS通过保持药物相关性在原始特征空间、嵌入空间和标签空间的分布，保持药物化学性质和功能的一致性。实验比较表明，AEFS对不平衡数据更具鲁棒性，在DTI预测中具有显著优越的性能。

论文链接：

https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btab384/6279744 Github链接：

https://github.com/JackieSun818/AEFS

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