华创派｜布鲁克与Rapid Novor合作发布实时多肽从头测序软件

在2023年US HUPO大会上，质谱设备提供商Bruker Corporation（布鲁克）发布了一系列在其timsTOF平台上的重要生物信息软件产品，重中之重是和Rapid Novor（快序生物）合作开发的实时多肽从头测序软件PaSER Novor。

PaSER Novor软件基于Rapid Novor自主研发的Novor算法，使用timsTOF质谱平台上超过170万个PSM（Peptide Spectrum Match）作为训练集，对Novor算法进行了重新训练和优化，结果令人非常振奋。在布鲁克官网上发表的题为“PaSER Novor: Real-time de novo sequencing for 4D-Proteomics applications”电子书中可以看到，在对PaSER Novor训练前后，与市场上另一个最常用的从头测序软件（软件A）的性能进行比较，PaSER Novor在灵敏度、准确度以及速度上，全方位胜出。

以下是算法在不同酶切数据上的性能比较。PaSER Novor在训练前后都超过了软件A。

以下是PaSER Novor和软件A在氨基酸级别上准确度比较的一个示例。对同一张二级谱图，PaSER Novor准确测出了14个氨基酸中的12个，而软件A只有3个氨基酸正确。

PaSER Novor 软件不仅灵敏度好、准确度高，更大的亮点是运行速度快。在某同样的硬件平台以及上述数据集上，PaSER Novor从头测序的平均速度是每秒1464张谱，而软件A的平均速度只有每秒79张谱。这是接近20倍的速度差异。

莫纳什大学（Monash University）免疫蛋白质组学实验室主任Tony Purcell教授表示：“从头搜索在我实验室研究中一直扮演着非常关键的角色。PaSER Novor算法不仅测序结果准确，而且速度非常快，达到甚至超过了仪器采集数据的速度，这使免疫肽组学（Peptidomics）实现规模化和实时化成为可能。这对我们快速将科学研究向临床转化有着极其重要的影响，前所未有的缩短了科研向临床转化的时间表。”

布鲁克生命科学质谱学的信息学总监Dennis Trede博士评论说：“我们很高兴看到我们与Rapid Novor的合作正在推动蛋白质组学领域取得有意义的进展。超高灵敏度的timsTOF SCP与Rapid Novor多肽从头测序算法的结合，赋能了从微量肿瘤活检样本中实现规模化的免疫肽组学研究。”

Rapid Novor公司的首席科学家马斌博士是国际上从头测序算法领域的主要创始人，在20多年的时间里，先后指导开发了两代从头测序算法。他说：“Novor是我主持开发的第二代算法。比起前一代，Novor采用了全新的算法架构，大大提高了精度和速度，并成为Rapid Novor公司蛋白从头测序产品的基石之一。这次非常高兴能够通过与布鲁克的合作，让广大的质谱从业人员用上这个又好又快的软件。”

这次与布鲁克的合作，也进一步强化了Rapid Novor在蛋白从头测序领域的技术领先地位。

https://www.bruker.com/en/products-and-solutions/mass-spectrometry/ms-software/paser/_jcr_content/root/sections/more_information/sectionpar/search_copy_copy_cop.download-asset.pdf/330827ae-d85d-4397-9218-27bd5f690e28/1815127-lcms-205-paser-novor-ebook.pdf

布鲁克官宣链接地址：

https://www.bruker.com/en/news-and-events/news/2023/bruker-launches-de-novo-sequencing-for-immunopeptidomics.html

关于Rapid Novor

Rapid Novor 公司专注于基于质谱的蛋白质组学领域， 具有自主知识产权的分析软件，拥有业界先进的质谱实验室。到目前为止，公司实验室已经拥有多台先进的质谱仪，并成为加拿大最大的私立蛋白组学质谱实验室，已累计为为全球数百家客户提供了高质量的专业服务。Rapid Novor的蛋白测序技术在药物研发、抗体工程、个体化诊疗等领域均具有广阔的应用前景！