撰文丨王聪
编辑丨王多鱼
排版丨水成文
细胞对环境变化的响应能力对于其生存至关重要。细胞对环境扰动的反应依赖于信号转导级联反应,以调节基因表达并激活应激反应程序以恢复稳态。当无法解决应激时,细胞会触发程序性细胞死亡,以防止功能异常的细胞对生物体造成伤害。
紫外线(UV)辐射会破坏DNA,引发DNA损伤反应(DDR),但它也会破坏RNA,引发转录组范围内的核糖体碰撞,并引发核糖体毒性应激反应(RSR)。然而,这些通路在决定细胞命运中的相对作用、时机和调节尚不清楚。
2024年6月5日,约翰·霍普金斯大学和纪念斯隆·凯特琳癌症中心的研究人员在国际顶尖学术期刊Cell 上发表了题为:The ribotoxic stress response drives UV-mediated cell death 的研究论文。
该研究揭示了核糖体应激反应(RSR)驱动了紫外线(UV)介导的细胞死亡,并进一步解析了其作用机制。
核糖体是主要的应激感受器,激活决定细胞命运的信号通路。在非应激细胞中,翻译稳态是通过调节mRNA的起始速率来维持的。然而,核糖体偶尔会遇到由基因表达缺陷或化学损伤引起的有问题的mRNA。长时间的核糖体停滞会导致核糖体碰撞,核糖体碰撞会招募质量控制(QC)因子,这些因子会将mRNA和新生肽链作为降解目标,并挽救停滞的核糖体。然而,过度的核糖体碰撞会将碰撞的核糖体转化为信号传递平台,启动全局应激响应。
紫外线(UV)诱导DNA损伤并激活DNA损伤反应(DDR)通路,这些DNA损伤诱导DNA复制叉停滞并激活ATR激酶。ATR及其效应激酶CHEK1的信号传导有助于解决复制应激和维持基因组完整性。这些信号通路也会阻滞细胞周期,为修复留出时间。DNA损伤的严重程度和细胞的修复能力决定了它是存活还是经历p53介导的凋亡。
紫外线还通过光化学反应产生嘧啶二聚体和其他光产物诱导转录组RNA损伤。紫外线损伤导致解码缺陷,因为核糖体在含有富含嘧啶的受损密码子上停滞。其他在mRNA上引入大量加合物的化学制剂也会导致核糖体停滞,从而激活核糖体毒性应激反应(RSR),然而,DDR和RSR在决定核酸(包括DNA和RNA)损伤后细胞命运中的相对作用尚不清楚。
早期研究表明,核糖体毒性应激激活p38和JNK-MAPK,之后的研究发现ZAKα(也简称为ZAK)是响应核糖体毒性应激的上游MAP3K。紫外线诱导的翻译功能障碍也与GCN2和整合应激反应(ISR)激活有关。该团队最近的研究发现,核糖体碰撞直接激活ZAK和GCN2激酶。ZAK与延伸中的核糖体结合,在核糖体碰撞时被激活,随后激活p38和JNK,分别触发细胞周期阻滞和凋亡。核糖体碰撞也激活GCN2,通过ISR导致eIF2α磷酸化和全局蛋白合成抑制。
虽然上述这些研究揭示了核糖体碰撞会激活核糖体毒性应激反应(RSR)和整合应激反应(ISR)通路,但未能阐明细胞是如何通过整合ZAK和GCN2通路的输出来协调对碰撞的适度反应并决定细胞命运的。一个引人注目的模型是,核糖体碰撞的频率和持续时间作为一种分子节流器,调节细胞生存(通过ISR和p38介导的细胞周期停滞)与死亡(通过JNK介导的细胞凋亡)之间的平衡。一个推论是,调节机制应该抑制ZAK对偶然碰撞的过度反应,确保信号停止。
在这项最新研究中,研究团队揭示了紫外线辐射会引发一种即时早期反应,主要由ZAK信号通路驱动,从而在紫外线应激后重新配置全局磷酸蛋白组。通过比较ZAK和DDR通路关键组分的相对贡献,研究团队发现ZAK(以及RSR)是响应紫外线时早期凋亡和细胞周期停滞的主要驱动力。
具体来说,在这项研究中,研究团队使用时间分辨率磷酸蛋白组学、化学遗传学、单细胞成像和生化方法,创建了一份关于细胞响应紫外线损伤时激活的信号通路的时序图谱。
该研究发现,紫外线诱导的细胞凋亡是由核糖体毒性应激反应(RSR)激酶ZAK介导的,而不是通过DNA损伤反应(DDR)。
该研究还鉴定出其中两个负反馈模块,它们调节ZAK介导的细胞凋亡:
1)GCN2激活通过减少受损mRNA上的核糖体碰撞来限制ZAK活性;
2)ZAK活性触发其保守的磷酸水解位点的自磷酸化,导致其降解和信号终止。
这些机制共同作用,使ZAK的活性与核糖体碰撞水平相适应,以建立稳定、耐受和死亡的调节机制,揭示了其作为细胞核酸损伤“哨兵”的关键作用。
论文链接:
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)00527-0
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